RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440422.5

TMBIM1-211, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene TMBIM1, Length 659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1-211ENST00000440422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.32■■■■■ 6.77
TMBIM1-211ENST00000440422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.12■■■■■ 5.77
TMBIM1-211ENST00000440422 ABCC9O60706 1549 aa50.89■■■■■ 5.74
TMBIM1-211ENST00000440422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.46■■■■■ 5.35
TMBIM1-211ENST00000440422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.25■■■■■ 5.31
TMBIM1-211ENST00000440422 NACADO15069 1562 aa48.23■■■■■ 5.31
TMBIM1-211ENST00000440422 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.67■■■■■ 5.22
TMBIM1-211ENST00000440422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
TMBIM1-211ENST00000440422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.51■■■■■ 5.2
TMBIM1-211ENST00000440422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.46■■■■■ 5.19
TMBIM1-211ENST00000440422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.45■■■■■ 5.19
TMBIM1-211ENST00000440422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.27■■■■■ 5.16
TMBIM1-211ENST00000440422 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.2■■■■■ 5.15
TMBIM1-211ENST00000440422 SCRIBQ14160 1630 aa46.79■■■■■ 5.08
TMBIM1-211ENST00000440422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.35■■■■■ 5.01
TMBIM1-211ENST00000440422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
TMBIM1-211ENST00000440422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.93■■■■■ 4.94
TMBIM1-211ENST00000440422 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.73■■■■■ 4.91
TMBIM1-211ENST00000440422 SMARCA4P51532 1647 aa44.62■■■■■ 4.73
TMBIM1-211ENST00000440422 NCAPD3P42695 1498 aa44.58■■■■■ 4.73
TMBIM1-211ENST00000440422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.57■■■■■ 4.73
TMBIM1-211ENST00000440422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
TMBIM1-211ENST00000440422 SMARCA2P51531 1590 aa44.35■■■■■ 4.69
TMBIM1-211ENST00000440422 HMGXB3Q12766 1538 aa44.26■■■■■ 4.68
TMBIM1-211ENST00000440422 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.26■■■■■ 4.68
TMBIM1-211ENST00000440422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
TMBIM1-211ENST00000440422 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.12■■■■■ 4.65
TMBIM1-211ENST00000440422 NESP48681 1621 aa43.9■■■■■ 4.62
TMBIM1-211ENST00000440422 ERCC6Q03468 1493 aa43.79■■■■■ 4.6
TMBIM1-211ENST00000440422 WIZO95785 1651 aa43.73■■■■■ 4.59
TMBIM1-211ENST00000440422 CUX2O14529 1486 aa43.51■■■■■ 4.56
TMBIM1-211ENST00000440422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
TMBIM1-211ENST00000440422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.45■■■■■ 4.55
TMBIM1-211ENST00000440422 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.27■■■■■ 4.52
TMBIM1-211ENST00000440422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
TMBIM1-211ENST00000440422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.24■■■■■ 4.51
TMBIM1-211ENST00000440422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.18■■■■■ 4.5
TMBIM1-211ENST00000440422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
TMBIM1-211ENST00000440422 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.05■■■■■ 4.48
TMBIM1-211ENST00000440422 CFTRP13569 1480 aa42.87■■■■■ 4.45
TMBIM1-211ENST00000440422 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.86■■■■■ 4.45
TMBIM1-211ENST00000440422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.8■■■■■ 4.44
TMBIM1-211ENST00000440422 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.75■■■■■ 4.43
TMBIM1-211ENST00000440422 WDR62O43379 1518 aa42.74■■■■■ 4.43
TMBIM1-211ENST00000440422 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.71■■■■■ 4.43
TMBIM1-211ENST00000440422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
TMBIM1-211ENST00000440422 PRDM2Q13029 1718 aa42.37■■■■■ 4.37
TMBIM1-211ENST00000440422 TOPBP1Q92547 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
TMBIM1-211ENST00000440422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
TMBIM1-211ENST00000440422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
TMBIM1-211ENST00000440422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.89■■■■■ 4.3
TMBIM1-211ENST00000440422 IFT140Q96RY7 1462 aa41.87■■■■■ 4.29
TMBIM1-211ENST00000440422 ABCC8Q09428 1581 aa41.81■■■■■ 4.28
TMBIM1-211ENST00000440422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
TMBIM1-211ENST00000440422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
TMBIM1-211ENST00000440422 OSCARQ8IYS5 282 aa41.62■■■■■ 4.25
TMBIM1-211ENST00000440422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
TMBIM1-211ENST00000440422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.58■■■■■ 4.25
TMBIM1-211ENST00000440422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.57■■■■■ 4.253e-7■■■■□ 22.1
TMBIM1-211ENST00000440422 CUX1P39880 1505 aa41.54■■■■■ 4.24
TMBIM1-211ENST00000440422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
TMBIM1-211ENST00000440422 SOGA1O94964 1423 aa41.44■■■■■ 4.23
TMBIM1-211ENST00000440422 TRIM41Q8WV44 630 aa41.44■■■■■ 4.22
TMBIM1-211ENST00000440422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
TMBIM1-211ENST00000440422 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
TMBIM1-211ENST00000440422 FBLN2P98095 1184 aa41.16■■■■■ 4.18
TMBIM1-211ENST00000440422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.13■■■■■ 4.17
TMBIM1-211ENST00000440422 WDR97A6NE52 1622 aa41.12■■■■■ 4.17
TMBIM1-211ENST00000440422 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
TMBIM1-211ENST00000440422 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
TMBIM1-211ENST00000440422 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
TMBIM1-211ENST00000440422 ARHGEF11O15085 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
TMBIM1-211ENST00000440422 GRIN2BQ13224 1484 aa41.01■■■■■ 4.16
TMBIM1-211ENST00000440422 SYNJ1O43426 1573 aa40.98■■■■■ 4.15
TMBIM1-211ENST00000440422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.98■■■■■ 4.15
TMBIM1-211ENST00000440422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
TMBIM1-211ENST00000440422 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.95■■■■■ 4.15
TMBIM1-211ENST00000440422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
TMBIM1-211ENST00000440422 TOP2BQ02880 1626 aa40.91■■■■■ 4.14
TMBIM1-211ENST00000440422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.9■■■■■ 4.14
TMBIM1-211ENST00000440422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
TMBIM1-211ENST00000440422 PBRM1Q86U86 1689 aa40.88■■■■■ 4.14
TMBIM1-211ENST00000440422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
TMBIM1-211ENST00000440422 SYNJ2O15056 1496 aa40.82■■■■■ 4.12
TMBIM1-211ENST00000440422 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
TMBIM1-211ENST00000440422 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.71■■■■■ 4.11
TMBIM1-211ENST00000440422 ARAP1Q96P48 1450 aa40.7■■■■■ 4.11
TMBIM1-211ENST00000440422 ADAMTS12P58397 1594 aa40.57■■■■■ 4.08
TMBIM1-211ENST00000440422 GRIN2AQ12879 1464 aa40.51■■■■■ 4.07
TMBIM1-211ENST00000440422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
TMBIM1-211ENST00000440422 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
TMBIM1-211ENST00000440422 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
TMBIM1-211ENST00000440422 NUP160Q12769 1436 aa40.37■■■■■ 4.05
TMBIM1-211ENST00000440422 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.3■■■■■ 4.04
TMBIM1-211ENST00000440422 IGF1RP08069 1367 aa40.12■■■■■ 4.01
TMBIM1-211ENST00000440422 SHROOM2Q13796 1616 aa40.11■■■■■ 4.01
TMBIM1-211ENST00000440422 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
TMBIM1-211ENST00000440422 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
TMBIM1-211ENST00000440422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.98■■■■□ 3.99
TMBIM1-211ENST00000440422 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms