Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 WDR70-204ENST00000507136 759 ntTSL 210.35□□□□□ -0.754e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-205ENST00000563080 1030 ntTSL 510.31□□□□□ -0.764e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-205ENST00000454964 598 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-209ENST00000429161 745 ntTSL 210.25□□□□□ -0.772e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-204ENST00000379020 2252 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.784e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-204ENST00000469185 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPFIA1-211ENST00000528750 1168 ntTSL 59.89□□□□□ -0.834e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 STXBP1-206ENST00000625363 550 ntTSL 49.79□□□□□ -0.844e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.874e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-208ENST00000424303 796 ntTSL 29.61□□□□□ -0.872e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.874e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MAP3K15-204ENST00000518578 4697 ntTSL 29.43□□□□□ -0.94e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.914e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-202ENST00000377600 2989 ntTSL 59.18□□□□□ -0.944e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.994e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -14e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 58.7□□□□□ -1.024e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CCDC7-210ENST00000545067 4001 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.024e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SYNJ2-203ENST00000367113 939 ntTSL 28.64□□□□□ -1.034e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-235ENST00000556082 660 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.034e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.064e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC39A14-208ENST00000519960 467 ntTSL 48.44□□□□□ -1.064e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.074e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-207ENST00000418772 434 ntTSL 58.23□□□□□ -1.094e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 GANC-208ENST00000567421 1526 ntTSL 58.13□□□□□ -1.114e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-219ENST00000553488 1065 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.124e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IFT122-214ENST00000507221 590 ntTSL 37.95□□□□□ -1.144e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ADARB1-209ENST00000464215 389 ntTSL 37.92□□□□□ -1.144e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 RSRC1-213ENST00000494002 679 ntTSL 27.82□□□□□ -1.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SMIM14-203ENST00000507613 680 ntTSL 27.79□□□□□ -1.164e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPP2CA-205ENST00000522385 585 ntTSL 37.73□□□□□ -1.174e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.184e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-224ENST00000554040 592 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-221ENST00000553498 911 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-236ENST00000556220 692 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.194e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 PPFIA1-209ENST00000527612 598 ntTSL 37.5□□□□□ -1.214e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-210ENST00000566579 526 ntTSL 47.5□□□□□ -1.214e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC7A6-213ENST00000567346 543 ntTSL 27.43□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IFT122-229ENST00000513932 553 ntTSL 37.43□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.234e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 RAB31-202ENST00000577284 604 ntTSL 47.38□□□□□ -1.234e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MAP3K15-202ENST00000359173 3961 ntTSL 27.31□□□□□ -1.244e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-207ENST00000505765 414 ntTSL 37.05□□□□□ -1.282e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.294e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.34e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.324e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.334e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 LINC02210-CRHR1-201ENST00000587305 560 ntTSL 56.7□□□□□ -1.344e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-223ENST00000553686 869 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.384e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-245ENST00000556958 769 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.384e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-226ENST00000554350 943 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.414e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SETD4-216ENST00000485865 549 ntTSL 26.22□□□□□ -1.412e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-210ENST00000507965 708 ntTSL 26.12□□□□□ -1.434e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-230ENST00000554673 981 ntTSL 56.05□□□□□ -1.444e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 MTHFS-203ENST00000560261 595 ntTSL 36.04□□□□□ -1.444e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ZMPSTE24-203ENST00000474142 530 ntTSL 25.82□□□□□ -1.484e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 CTNS-210ENST00000576979 548 ntTSL 55.78□□□□□ -1.484e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 RSRC1-204ENST00000468344 551 ntTSL 35.78□□□□□ -1.484e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 45.67□□□□□ -1.54e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.54e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-244ENST00000556898 990 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.514e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-239ENST00000556315 924 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-229ENST00000554672 759 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-228ENST00000554592 1010 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-247ENST00000557311 562 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-233ENST00000555816 760 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-232ENST00000555381 803 ntTSL 1 (best)5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-202ENST00000359366 2584 ntTSL 1 (best)5.23□□□□□ -1.574e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-212ENST00000515746 619 ntTSL 55.13□□□□□ -1.594e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 STXBP1-207ENST00000626333 667 ntTSL 45.1□□□□□ -1.594e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.64e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-222ENST00000553570 757 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-220ENST00000553491 857 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-237ENST00000556274 913 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-238ENST00000556288 901 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-231ENST00000554994 922 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-243ENST00000556671 921 ntTSL 1 (best)4.99□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 44.95□□□□□ -1.624e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-218ENST00000553309 1022 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-242ENST00000556644 372 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 SLC35B1-213ENST00000508926 393 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-23■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.654e-12■■■■■ 275.7
SF3B1O75533 ATXN3-246ENST00000557030 807 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.664e-12■■■■■ 275.7
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