Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 521.37■■□□□ 1.012e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.192e-9■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-PTCD1-202ENST00000437572 544 ntTSL 416.69■□□□□ 0.265e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 416.47■□□□□ 0.235e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-PTCD1-203ENST00000451138 331 ntTSL 415.83■□□□□ 0.125e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.295e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 212.35□□□□□ -0.435e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 411.29□□□□□ -0.65e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.035e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.285e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-210ENST00000491560 658 ntTSL 25.85□□□□□ -1.475e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.615e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 ATAD2-207ENST00000534257 544 ntTSL 46.24□□□□□ -1.413e-11■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.963e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 UPF3A-206ENST00000480362 965 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 UPF3A-204ENST00000475218 1791 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.663e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HDAC2-215ENST00000523334 4810 ntTSL 23.63□□□□□ -1.833e-7■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 47.74□□□□□ -1.172e-12■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.834e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.374e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.354e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 04e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 514.43□□□□□ -0.14e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.144e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.34e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KNL1-209ENST00000532347 564 ntTSL 48.44□□□□□ -1.066e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.256e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CHD1-211ENST00000514344 2955 ntTSL 54.02□□□□□ -1.772e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.916e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.46□□□□□ -2.186e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-202ENST00000392520 5205 ntTSL 514.55□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-208ENST00000537607 4958 ntTSL 511.82□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-217ENST00000545913 8520 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIT-207ENST00000536325 329 ntTSL 34.25□□□□□ -1.731e-6■□□□□ 11.3
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PUM1Q14671 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.836e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.056e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.16e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.176e-7■□□□□ 11.3
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PUM1Q14671 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.491e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-203ENST00000380524 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 11.3
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PUM1Q14671 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 310.13□□□□□ -0.793e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.113e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 57.72□□□□□ -1.173e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 24.12□□□□□ -1.753e-29■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-11■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-210ENST00000561029 2717 ntTSL 520.71■□□□□ 0.911e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 58.02□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.451e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 212.89□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HDLBP-237ENST00000479169 1017 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 HDLBP-228ENST00000459788 563 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-6■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 322.3■■□□□ 1.162e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-204ENST00000418347 563 ntTSL 421.45■■□□□ 1.022e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-212ENST00000455009 580 ntTSL 320.45■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-219ENST00000484600 582 ntTSL 220.45■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-213ENST00000458033 561 ntTSL 220.22■□□□□ 0.832e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-203ENST00000417330 559 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 319.95■□□□□ 0.782e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-207ENST00000431816 581 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-221ENST00000493403 532 ntTSL 318.57■□□□□ 0.562e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-202ENST00000414376 572 ntTSL 417.28■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-209ENST00000443222 669 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-208ENST00000432343 839 ntTSL 513.42□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-210ENST00000445924 727 ntTSL 513.02□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 ARPC1B-216ENST00000474880 709 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.6□□□□□ -0.557e-8■□□□□ 11.3
PUM1Q14671 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.451e-7■□□□□ 11.3
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