RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617305.4

HNRNPUL1-221, Transcript of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene HNRNPUL1, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		61.1	■■■■■ 7.37
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ABCC9	O60706	1549 aa		54.97	■■■■■ 6.39
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		54.94	■■■■■ 6.39
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		52.34	■■■■■ 5.97
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	NACAD	O15069	1562 aa		51.96	■■■■■ 5.91
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		51.66	■■■■■ 5.86
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.51	■■■■■ 5.84
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.26	■■■■■ 5.8
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	51.12	■■■■■ 5.77
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		51.1	■■■■■ 5.77
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		50.8	■■■■■ 5.72
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	50.62	■■■■■ 5.69
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		50.53	■■■■■ 5.68
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		50.21	■■■■■ 5.63
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SCRIB	Q14160	1630 aa		49.96	■■■■■ 5.59
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		49.69	■■■■■ 5.55
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	49.58	■■■■■ 5.53
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		49.57	■■■■■ 5.53
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.97	■■■■■ 5.27
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.78	■■■■■ 5.24
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SMARCA4	P51532	1647 aa		47.7	■■■■■ 5.23
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.66	■■■■■ 5.22
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.61	■■■■■ 5.21
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		47.61	■■■■■ 5.21
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CUX2	O14529	1486 aa		47.53	■■■■■ 5.2
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ERCC6	Q03468	1493 aa		47.5	■■■■■ 5.19
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	47.45	■■■■■ 5.19
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.3	■■■■■ 5.16
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.28	■■■■■ 5.16
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	NES	P48681	1621 aa		47.18	■■■■■ 5.14
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.04	■■■■■ 5.12
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.91	■■■■■ 5.1
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	46.79	■■■■■ 5.08
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		46.63	■■■■■ 5.06
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		46.59	■■■■■ 5.05
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.48	■■■■■ 5.03
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	WIZ	O95785	1651 aa		46.46	■■■■■ 5.03
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		46.24	■■■■■ 4.99
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	WDR62	O43379	1518 aa		46.14	■■■■■ 4.98
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.03	■■■■■ 4.96
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		46.02	■■■■■ 4.96
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.94	■■■■■ 4.95
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CFTR	P13569	1480 aa		45.93	■■■■■ 4.94
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.92	■■■■■ 4.94
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.57	■■■■■ 4.88
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.46	■■■■■ 4.87
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TRIM41	Q8WV44	630 aa		45.39	■■■■■ 4.86
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		45.36	■■■■■ 4.85
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		45.28	■■■■■ 4.84
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	IFT140	Q96RY7	1462 aa		45.12	■■■■■ 4.81
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TOPBP1	Q92547	1522 aa		45.06	■■■■■ 4.8
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.01	■■■■■ 4.8
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	45.01	■■■■■ 4.8
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.9	■■■■■ 4.78
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.78	■■■■■ 4.76
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		44.71	■■■■■ 4.75
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		44.71	■■■■■ 4.75
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		44.71	■■■■■ 4.75
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.68	■■■■■ 4.74
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.59	■■■■■ 4.73
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.58	■■■■■ 4.73	5e-7	■■■■■ 32.2
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ARHGEF11	O15085	1522 aa		44.56	■■■■■ 4.72
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CHD1	O14646	1710 aa		44.45	■■■■■ 4.71
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.39	■■■■■ 4.7
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SOGA1	O94964	1423 aa		44.37	■■■■■ 4.69
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.29	■■■■■ 4.68
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.28	■■■■■ 4.68
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.28	■■■■■ 4.68
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	FBLN2	P98095	1184 aa		44.27	■■■■■ 4.68
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CUX1	P39880	1505 aa		44.22	■■■■■ 4.67
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		44.19	■■■■■ 4.66
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		44.15	■■■■■ 4.66
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ARAP1	Q96P48	1450 aa		44.11	■■■■■ 4.65
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	44.07	■■■■■ 4.65
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	GRIN2B	Q13224	1484 aa		44.03	■■■■■ 4.64
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.99	■■■■■ 4.63
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.98	■■■■■ 4.63
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.95	■■■■■ 4.63
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.91	■■■■■ 4.62
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.84	■■■■■ 4.61
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.83	■■■■■ 4.61
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		43.8	■■■■■ 4.6
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.79	■■■■■ 4.6
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.75	■■■■■ 4.59
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	43.73	■■■■■ 4.59
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.58	■■■■■ 4.57
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		43.51	■■■■■ 4.56
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	TOP2B	Q02880	1626 aa		43.5	■■■■■ 4.55
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.46	■■■■■ 4.55
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.42	■■■■■ 4.54
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	NUP160	Q12769	1436 aa		43.34	■■■■■ 4.53
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.3	■■■■■ 4.52
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.29	■■■■■ 4.52
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.27	■■■■■ 4.52
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		43.23	■■■■■ 4.51
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	SHROOM2	Q13796	1616 aa		43.16	■■■■■ 4.5
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.84	■■■■■ 4.45
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.81	■■■■■ 4.44
HNRNPUL1-221	ENST00000617305	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.64	■■■■■ 4.42

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