Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 27.2□□□□□ -1.263e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.81□□□□□ -1.323e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.47□□□□□ -1.373e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.413e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.96□□□□□ -1.463e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.483e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.15□□□□□ -1.593e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.613e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.613e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.82□□□□□ -1.83e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.068e-7■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 38.94□□□□□ -0.988e-7■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.031e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-205ENST00000453466 1509 ntTSL 521.32■■□□□ 11e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-204ENST00000444457 2385 ntTSL 220.05■□□□□ 0.81e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-206ENST00000456433 904 ntTSL 518.25■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-203ENST00000443722 1323 ntTSL 514.19□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PMPCB-208ENST00000498530 1161 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.488e-7■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 26.91□□□□□ -1.32e-10■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.512e-10■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.795e-7■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.375e-7■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 411.06□□□□□ -0.646e-6■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GARS-206ENST00000478124 1877 ntTSL 520.22■□□□□ 0.837e-9■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.327e-9■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 212.36□□□□□ -0.437e-9■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 210.44□□□□□ -0.747e-9■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.7□□□□□ -1.187e-9■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 55.48□□□□□ -1.537e-9■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.243e-8■■■■□ 23.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-216ENST00000495070 571 ntTSL 417.41■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 MCM4-210ENST00000520934 621 ntTSL 325.44■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 MCM4-211ENST00000520994 522 ntTSL 321.97■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-207ENST00000476201 929 ntTSL 515.08■□□□□ 02e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-215ENST00000613864 584 ntTSL 415.08■□□□□ 02e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-13■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 513.36□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 MCM4-207ENST00000519170 734 ntTSL 312.23□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 MCM4-203ENST00000518221 572 ntTSL 411.91□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 PARVB-206ENST00000477438 421 ntTSL 511.33□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 IMPDH2-211ENST00000491610 844 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.761e-43■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 39.37□□□□□ -0.912e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.892e-7■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-204ENST00000425172 596 ntTSL 225.44■■□□□ 1.662e-6■■■■□ 23.7
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 316.79■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 PTBP1-215ENST00000589883 683 ntTSL 320.76■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.094e-8■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.944e-8■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.274e-8■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.14e-8■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-204ENST00000461768 496 ntTSL 39.03□□□□□ -0.965e-9■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 COPB1-204ENST00000526191 697 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 511□□□□□ -0.652e-9■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 324.24■■□□□ 1.471e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-212ENST00000563749 2367 nt23.68■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-203ENST00000399461 879 ntTSL 223.5■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 317.82■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-211ENST00000563270 554 ntTSL 416.26■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 516.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 GCN1-204ENST00000548132 498 ntTSL 313.22□□□□□ -0.295e-6■■■■□ 23.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.955e-10■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 318.31■□□□□ 0.525e-10■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 SLC2A4RG-208ENST00000496425 502 ntTSL 218.3■□□□□ 0.525e-10■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.285e-9■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM25-208ENST00000574234 471 ntTSL 26.52□□□□□ -1.375e-10■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 36.28□□□□□ -1.45e-10■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.234e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-207ENST00000527133 667 ntTSL 313.74□□□□□ -0.214e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.274e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-205ENST00000526009 747 ntTSL 38.44□□□□□ -1.064e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CLNS1A-209ENST00000527299 387 ntTSL 26.15□□□□□ -1.424e-8■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 513.42□□□□□ -0.264e-16■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 28.89□□□□□ -0.994e-16■■■■□ 23.5
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 514.04□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 23.4
UTP3Q9NQZ2 SEC13-217ENST00000482647 782 ntTSL 222.35■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 23.3
UTP3Q9NQZ2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 23.3
UTP3Q9NQZ2 AUP1-207ENST00000472800 663 ntTSL 421.01■□□□□ 0.955e-10■■■■□ 23.3
UTP3Q9NQZ2 LGALS1-202ENST00000425542 637 ntTSL 319.51■□□□□ 0.715e-10■■■■□ 23.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4149.1 ms