RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520934.1

MCM4-210, Transcript of minichromosome maintenance complex component 4, humanhuman

TSL 3

Gene MCM4, Length 621 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4-210ENST00000520934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.83■■■■■ 6.69
MCM4-210ENST00000520934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.39■■■■■ 5.66
MCM4-210ENST00000520934 ABCC9O60706 1549 aa48.8■■■■■ 5.4
MCM4-210ENST00000520934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
MCM4-210ENST00000520934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.32■■■■■ 5.17
MCM4-210ENST00000520934 NACADO15069 1562 aa47.24■■■■■ 5.15
MCM4-210ENST00000520934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
MCM4-210ENST00000520934 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.09■■■■■ 5.13
MCM4-210ENST00000520934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.05■■■■■ 5.12
MCM4-210ENST00000520934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.17■■■■■ 4.98
MCM4-210ENST00000520934 SCRIBQ14160 1630 aa45.96■■■■■ 4.95
MCM4-210ENST00000520934 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.7■■■■■ 4.91
MCM4-210ENST00000520934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.66■■■■■ 4.9
MCM4-210ENST00000520934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
MCM4-210ENST00000520934 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
MCM4-210ENST00000520934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.33■■■■■ 4.69
MCM4-210ENST00000520934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.2■■■■■ 4.67
MCM4-210ENST00000520934 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
MCM4-210ENST00000520934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
MCM4-210ENST00000520934 SMARCA4P51532 1647 aa44.02■■■■■ 4.64
MCM4-210ENST00000520934 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.78■■■■■ 4.6
MCM4-210ENST00000520934 SMARCA2P51531 1590 aa43.65■■■■■ 4.58
MCM4-210ENST00000520934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
MCM4-210ENST00000520934 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.58■■■■■ 4.57
MCM4-210ENST00000520934 NCAPD3P42695 1498 aa43.55■■■■■ 4.56
MCM4-210ENST00000520934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
MCM4-210ENST00000520934 HMGXB3Q12766 1538 aa43.39■■■■■ 4.54
MCM4-210ENST00000520934 WIZO95785 1651 aa43.37■■■■■ 4.53
MCM4-210ENST00000520934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
MCM4-210ENST00000520934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
MCM4-210ENST00000520934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
MCM4-210ENST00000520934 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.41■■■■■ 4.38
MCM4-210ENST00000520934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.37■■■■■ 4.37
MCM4-210ENST00000520934 NESP48681 1621 aa42.35■■■■■ 4.37
MCM4-210ENST00000520934 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
MCM4-210ENST00000520934 CFTRP13569 1480 aa42.15■■■■■ 4.34
MCM4-210ENST00000520934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.06■■■■■ 4.32
MCM4-210ENST00000520934 ERCC6Q03468 1493 aa42.05■■■■■ 4.32
MCM4-210ENST00000520934 PRDM2Q13029 1718 aa41.99■■■■■ 4.31
MCM4-210ENST00000520934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.93■■■■■ 4.3
MCM4-210ENST00000520934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.83■■■■■ 4.29
MCM4-210ENST00000520934 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.74■■■■■ 4.27
MCM4-210ENST00000520934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
MCM4-210ENST00000520934 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.59■■■■■ 4.25
MCM4-210ENST00000520934 CUX2O14529 1486 aa41.45■■■■■ 4.23
MCM4-210ENST00000520934 WDR62O43379 1518 aa41.43■■■■■ 4.22
MCM4-210ENST00000520934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
MCM4-210ENST00000520934 ABCC8Q09428 1581 aa41.29■■■■■ 4.2
MCM4-210ENST00000520934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.23■■■■■ 4.19
MCM4-210ENST00000520934 TOPBP1Q92547 1522 aa41.21■■■■■ 4.19
MCM4-210ENST00000520934 CUX1P39880 1505 aa41.05■■■■■ 4.16
MCM4-210ENST00000520934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.97■■■■■ 4.15
MCM4-210ENST00000520934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.86■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 TOP2BQ02880 1626 aa40.85■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.85■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 IFT140Q96RY7 1462 aa40.85■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
MCM4-210ENST00000520934 SOGA1O94964 1423 aa40.74■■■■■ 4.11
MCM4-210ENST00000520934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
MCM4-210ENST00000520934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.69■■■■■ 4.1
MCM4-210ENST00000520934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
MCM4-210ENST00000520934 WDR97A6NE52 1622 aa40.53■■■■■ 4.08
MCM4-210ENST00000520934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
MCM4-210ENST00000520934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.49■■■■■ 4.07
MCM4-210ENST00000520934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
MCM4-210ENST00000520934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.064e-11■■■■■ 47.1
MCM4-210ENST00000520934 TRIM41Q8WV44 630 aa40.34■■■■■ 4.05
MCM4-210ENST00000520934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.29■■■■■ 4.04
MCM4-210ENST00000520934 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.28■■■■■ 4.04
MCM4-210ENST00000520934 PBRM1Q86U86 1689 aa40.22■■■■■ 4.03
MCM4-210ENST00000520934 GRIN2BQ13224 1484 aa40.21■■■■■ 4.03
MCM4-210ENST00000520934 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.11■■■■■ 4.01
MCM4-210ENST00000520934 KIF27Q86VH2 1401 aa40.1■■■■■ 4.01
MCM4-210ENST00000520934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.07■■■■■ 4.01
MCM4-210ENST00000520934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
MCM4-210ENST00000520934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.03■■■■■ 4
MCM4-210ENST00000520934 CHD1O14646 1710 aa39.94■■■■□ 3.98
MCM4-210ENST00000520934 SYNJ2O15056 1496 aa39.89■■■■□ 3.98
MCM4-210ENST00000520934 FBLN2P98095 1184 aa39.89■■■■□ 3.98
MCM4-210ENST00000520934 ADAMTS12P58397 1594 aa39.88■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 IGF1RP08069 1367 aa39.84■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.83■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.83■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 OSCARQ8IYS5 282 aa39.83■■■■□ 3.97
MCM4-210ENST00000520934 CUL7Q14999 1698 aa39.79■■■■□ 3.96
MCM4-210ENST00000520934 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
MCM4-210ENST00000520934 EEA1Q15075 1411 aa39.65■■■■□ 3.94
MCM4-210ENST00000520934 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
MCM4-210ENST00000520934 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.63■■■■□ 3.93
MCM4-210ENST00000520934 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.52■■■■□ 3.92
MCM4-210ENST00000520934 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
MCM4-210ENST00000520934 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.47■■■■□ 3.91
MCM4-210ENST00000520934 CEP170Q5SW79 1584 aa39.46■■■■□ 3.91
MCM4-210ENST00000520934 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
MCM4-210ENST00000520934 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.45■■■■□ 3.91
MCM4-210ENST00000520934 PRXQ9BXM0 1461 aa39.41■■■■□ 3.9
MCM4-210ENST00000520934 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.24■■■■□ 3.87
MCM4-210ENST00000520934 KIF21BO75037 1637 aa39.2■■■■□ 3.87
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