Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-208ENST00000492098 1098 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-205ENST00000503340 696 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-222ENST00000569972 836 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-207ENST00000523573 764 ntTSL 59.36□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAD50-207ENST00000487596 738 ntTSL 39.3□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SREK1-211ENST00000522214 882 ntTSL 29.17□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-205ENST00000453351 565 ntTSL 49.11□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD4-206ENST00000453615 371 ntTSL 39.06□□□□□ -0.962e-20■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PRKAB1-209ENST00000545870 566 ntTSL 38.85□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAD50-205ENST00000453394 2076 ntTSL 58.73□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM168-202ENST00000418785 799 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-207ENST00000504023 770 ntTSL 48.49□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-204ENST00000504016 509 ntTSL 38.42□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ORC2-204ENST00000464147 2185 ntTSL 58.37□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 XPO1-221ENST00000489954 583 ntTSL 48.32□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-203ENST00000484243 549 ntTSL 38.3□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.132e-10■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PRKAB1-208ENST00000545223 583 ntTSL 27.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RNF213-213ENST00000571908 624 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.162e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-206ENST00000485186 434 ntTSL 37.66□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 NUP214-223ENST00000530843 189 ntTSL 57.47□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM38B-204ENST00000435034 721 ntTSL 37.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CDK1-206ENST00000487784 598 ntTSL 57.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CISD1-202ENST00000464703 698 ntTSL 57.36□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CBWD2-208ENST00000479583 3305 ntTSL 27.06□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 NUP214-216ENST00000526346 577 ntTSL 47.01□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-216ENST00000569098 587 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-219ENST00000569173 516 ntTSL 57.01□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-209ENST00000566831 718 ntTSL 26.87□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACADM-214ENST00000532207 762 ntTSL 26.69□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-208ENST00000511175 636 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-211ENST00000566991 3657 ntTSL 25.95□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-212ENST00000513013 493 ntTSL 55.68□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-202ENST00000502453 4273 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAD50-203ENST00000423956 2915 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RTF1-207ENST00000561076 314 ntTSL 32.79□□□□□ -1.963e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SMARCC2-212ENST00000552566 534 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SMARCC2-205ENST00000548130 1238 ntTSL 59.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 57.16□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 220.28■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 MCM7-204ENST00000425308 1497 ntTSL 330.21■■■□□ 2.433e-7■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 TFR2-207ENST00000473374 891 ntTSL 522.47■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 DDB1-204ENST00000535147 2789 ntTSL 211.11□□□□□ -0.639e-8■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-211ENST00000582232 598 ntTSL 212.32□□□□□ -0.443e-10■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 GGA3-207ENST00000578896 439 ntTSL 59.53□□□□□ -0.883e-10■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 218.34■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 217.85■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 WNK1-221ENST00000574679 722 ntTSL 56.04□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 37.2
UTP3Q9NQZ2 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 527.53■■■□□ 22e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 EIF4G3-208ENST00000438975 1270 ntTSL 521.85■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 512.21□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-205ENST00000432282 682 ntTSL 510.05□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-208ENST00000466470 944 ntTSL 210.05□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 28.52□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.767e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.697e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-217ENST00000598493 808 ntTSL 522.19■■□□□ 1.147e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-221ENST00000600610 1105 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.117e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-223ENST00000600995 812 ntTSL 221.58■■□□□ 1.057e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.877e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-205ENST00000594018 934 ntTSL 519.97■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-213ENST00000596166 1024 ntTSL 319.97■□□□□ 0.797e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-211ENST00000596001 1072 ntTSL 519.72■□□□□ 0.757e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-214ENST00000596218 897 ntTSL 319.51■□□□□ 0.717e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-228ENST00000602165 617 ntTSL 419.5■□□□□ 0.717e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-225ENST00000601261 606 ntTSL 419.24■□□□□ 0.677e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-204ENST00000593297 555 ntTSL 419.02■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-206ENST00000594345 1004 ntTSL 318.96■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-220ENST00000599429 592 ntTSL 418.96■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-215ENST00000596941 678 ntTSL 218.66■□□□□ 0.587e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-224ENST00000601213 584 ntTSL 418.66■□□□□ 0.587e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-9■■■■■ 37.1
UTP3Q9NQZ2 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 516.85■□□□□ 0.297e-9■■■■■ 37.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3829.9 ms