RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.26■■□□□ 1.96
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GGA3-211ENST00000582232 ABCC9O60706 1549 aa23.05■■□□□ 1.28
GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GGA3-211ENST00000582232 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.63■■□□□ 1.21
GGA3-211ENST00000582232 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.58■■□□□ 1.21
GGA3-211ENST00000582232 NACADO15069 1562 aa22.53■■□□□ 1.2
GGA3-211ENST00000582232 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.48■■□□□ 1.19
GGA3-211ENST00000582232 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.42■■□□□ 1.18
GGA3-211ENST00000582232 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.94■■□□□ 1.1
GGA3-211ENST00000582232 SCRIBQ14160 1630 aa21.92■■□□□ 1.1
GGA3-211ENST00000582232 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.74■■□□□ 1.07
GGA3-211ENST00000582232 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.67■■□□□ 1.06
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GGA3-211ENST00000582232 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.15■□□□□ 0.98
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GGA3-211ENST00000582232 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
GGA3-211ENST00000582232 SMARCA4P51532 1647 aa21.06■□□□□ 0.96
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GGA3-211ENST00000582232 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
GGA3-211ENST00000582232 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.92■□□□□ 0.94
GGA3-211ENST00000582232 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.89■□□□□ 0.94
GGA3-211ENST00000582232 SMARCA2P51531 1590 aa20.85■□□□□ 0.93
GGA3-211ENST00000582232 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.83■□□□□ 0.93
GGA3-211ENST00000582232 WIZO95785 1651 aa20.79■□□□□ 0.92
GGA3-211ENST00000582232 NCAPD3P42695 1498 aa20.78■□□□□ 0.92
GGA3-211ENST00000582232 HMGXB3Q12766 1538 aa20.72■□□□□ 0.91
GGA3-211ENST00000582232 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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GGA3-211ENST00000582232 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GGA3-211ENST00000582232 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.36■□□□□ 0.85
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GGA3-211ENST00000582232 CFTRP13569 1480 aa20.16■□□□□ 0.82
GGA3-211ENST00000582232 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.16■□□□□ 0.82
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GGA3-211ENST00000582232 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.99■□□□□ 0.79
GGA3-211ENST00000582232 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.92■□□□□ 0.78
GGA3-211ENST00000582232 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.9■□□□□ 0.78
GGA3-211ENST00000582232 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.86■□□□□ 0.77
GGA3-211ENST00000582232 ERCC6Q03468 1493 aa19.84■□□□□ 0.77
GGA3-211ENST00000582232 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.74■□□□□ 0.75
GGA3-211ENST00000582232 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
GGA3-211ENST00000582232 ABCC8Q09428 1581 aa19.72■□□□□ 0.75
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GGA3-211ENST00000582232 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
GGA3-211ENST00000582232 WDR62O43379 1518 aa19.69■□□□□ 0.74
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GGA3-211ENST00000582232 CUX1P39880 1505 aa19.67■□□□□ 0.74
GGA3-211ENST00000582232 TOPBP1Q92547 1522 aa19.66■□□□□ 0.74
GGA3-211ENST00000582232 TOP2BQ02880 1626 aa19.65■□□□□ 0.74
GGA3-211ENST00000582232 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.65■□□□□ 0.74
GGA3-211ENST00000582232 SYNJ1O43426 1573 aa19.63■□□□□ 0.73
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GGA3-211ENST00000582232 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.55■□□□□ 0.72
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GGA3-211ENST00000582232 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
GGA3-211ENST00000582232 SOGA1O94964 1423 aa19.44■□□□□ 0.7
GGA3-211ENST00000582232 IFT140Q96RY7 1462 aa19.44■□□□□ 0.7
GGA3-211ENST00000582232 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.41■□□□□ 0.7
GGA3-211ENST00000582232 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.4■□□□□ 0.7
GGA3-211ENST00000582232 WDR97A6NE52 1622 aa19.39■□□□□ 0.69
GGA3-211ENST00000582232 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
GGA3-211ENST00000582232 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.28■□□□□ 0.68
GGA3-211ENST00000582232 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
GGA3-211ENST00000582232 KIF27Q86VH2 1401 aa19.25■□□□□ 0.67
GGA3-211ENST00000582232 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
GGA3-211ENST00000582232 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.23■□□□□ 0.67
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GGA3-211ENST00000582232 EEA1Q15075 1411 aa19.21■□□□□ 0.67
GGA3-211ENST00000582232 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.2■□□□□ 0.66
GGA3-211ENST00000582232 GRIN2BQ13224 1484 aa19.18■□□□□ 0.66
GGA3-211ENST00000582232 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.18■□□□□ 0.66
GGA3-211ENST00000582232 PBRM1Q86U86 1689 aa19.17■□□□□ 0.66
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GGA3-211ENST00000582232 ADAMTS12P58397 1594 aa19.04■□□□□ 0.64
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GGA3-211ENST00000582232 PRXQ9BXM0 1461 aa19.03■□□□□ 0.64
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GGA3-211ENST00000582232 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.97■□□□□ 0.63
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GGA3-211ENST00000582232 CHD1O14646 1710 aa18.92■□□□□ 0.62
GGA3-211ENST00000582232 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
GGA3-211ENST00000582232 GOLGA3Q08378 1498 aa18.86■□□□□ 0.61
GGA3-211ENST00000582232 FBLN2P98095 1184 aa18.86■□□□□ 0.61
GGA3-211ENST00000582232 NUP160Q12769 1436 aa18.84■□□□□ 0.61
GGA3-211ENST00000582232 CEP170Q5SW79 1584 aa18.81■□□□□ 0.6
GGA3-211ENST00000582232 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.78■□□□□ 0.6
GGA3-211ENST00000582232 OSCARQ8IYS5 282 aa18.77■□□□□ 0.6
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