Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 MRPL28-209ENST00000481453 2229 ntTSL 221.22■□□□□ 0.995e-13■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 MRPL28-210ENST00000483764 1512 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.665e-13■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.625e-13■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.415e-13■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-206ENST00000502756 796 ntTSL 227.59■■■□□ 2.013e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 522.12■■□□□ 1.133e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-214ENST00000515813 738 ntTSL 220.42■□□□□ 0.863e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.83e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 515.73■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 ADCY7-210ENST00000567277 2304 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.669e-10■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.299e-10■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.19e-10■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-8■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.466e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 KDM3A-206ENST00000452034 709 ntTSL 516.54■□□□□ 0.246e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.016e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 212.11□□□□□ -0.476e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.266e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 232.58■■■□□ 2.814e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.354e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.184e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 326.86■■□□□ 1.894e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 224.68■■□□□ 1.544e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 CELF1-213ENST00000530151 583 ntTSL 324.15■■□□□ 1.464e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.034e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.014e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 CELF1-210ENST00000526419 476 ntTSL 420.71■□□□□ 0.914e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 320.01■□□□□ 0.794e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 318.45■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 318.33■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 516.46■□□□□ 0.234e-9■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-211ENST00000598697 3349 ntTSL 218.68■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-209ENST00000598502 3695 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-205ENST00000595519 3702 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-207ENST00000596338 3993 ntTSL 216.94■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 223.08■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 322.73■■□□□ 1.236e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-203ENST00000418940 582 ntTSL 421.73■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 222.75■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 33
GTF2F1P35269 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 33
GTF2F1P35269 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.577e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 328.22■■■□□ 2.117e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.56■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.919e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 219.92■□□□□ 0.789e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 518.85■□□□□ 0.619e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.589e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 217.81■□□□□ 0.449e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.49■□□□□ 0.399e-11■■■■■ 33
GTF2F1P35269 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.466e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.346e-7■■■■■ 33
GTF2F1P35269 CDC42SE2-207ENST00000504701 567 ntTSL 425.54■■□□□ 1.686e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.036e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-209ENST00000506419 458 ntTSL 316.2■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -16e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-211ENST00000511432 286 ntTSL 55.16□□□□□ -1.586e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 CDC42SE2-205ENST00000502840 539 ntTSL 44.37□□□□□ -1.716e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 INPP5A-204ENST00000423490 416 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-209ENST00000586856 690 ntTSL 526.43■■□□□ 1.827e-8■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-206ENST00000586131 1007 ntTSL 322.51■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-212ENST00000591309 557 ntTSL 422.5■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-208ENST00000586737 481 ntTSL 514.49□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ERCC2-207ENST00000586441 682 ntTSL 513.61□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 32.9
GTF2F1P35269 PHF23-206ENST00000572789 1006 ntTSL 220.66■□□□□ 0.95e-8■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 225.23■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 523.93■■□□□ 1.428e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 32.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 32.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 71.3 ms