RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.52■■■■■ 9.2
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.68■■■■■ 7.94
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC9O60706 1549 aa63.75■■■■■ 7.8
RAB40C-211ENST00000568586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.14■■■■■ 7.38
RAB40C-211ENST00000568586 NACADO15069 1562 aa60.99■■■■■ 7.35
RAB40C-211ENST00000568586 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.64■■■■■ 7.3
RAB40C-211ENST00000568586 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.56■■■■■ 7.28
RAB40C-211ENST00000568586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.29■■■■■ 7.24
RAB40C-211ENST00000568586 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.06■■■■■ 7.21
RAB40C-211ENST00000568586 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.67■■■■■ 7.14
RAB40C-211ENST00000568586 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.49■■■■■ 7.11
RAB40C-211ENST00000568586 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.35■■■■■ 7.09
RAB40C-211ENST00000568586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.14■■■■■ 7.06
RAB40C-211ENST00000568586 SCRIBQ14160 1630 aa58.85■■■■■ 7.01
RAB40C-211ENST00000568586 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.75■■■■■ 7
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RAB40C-211ENST00000568586 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.67■■■■■ 6.82
RAB40C-211ENST00000568586 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.4■■■■■ 6.78
RAB40C-211ENST00000568586 NCAPD3P42695 1498 aa56.34■■■■■ 6.61
RAB40C-211ENST00000568586 SMARCA4P51532 1647 aa56.34■■■■■ 6.61
RAB40C-211ENST00000568586 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.23■■■■■ 6.59
RAB40C-211ENST00000568586 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.21■■■■■ 6.59
RAB40C-211ENST00000568586 SMARCA2P51531 1590 aa56.11■■■■■ 6.57
RAB40C-211ENST00000568586 HMGXB3Q12766 1538 aa55.95■■■■■ 6.55
RAB40C-211ENST00000568586 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.9■■■■■ 6.54
RAB40C-211ENST00000568586 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.84■■■■■ 6.53
RAB40C-211ENST00000568586 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.67■■■■■ 6.5
RAB40C-211ENST00000568586 WIZO95785 1651 aa55.14■■■■■ 6.42
RAB40C-211ENST00000568586 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.05■■■■■ 6.4
RAB40C-211ENST00000568586 NESP48681 1621 aa55.03■■■■■ 6.4
RAB40C-211ENST00000568586 ERCC6Q03468 1493 aa54.97■■■■■ 6.39
RAB40C-211ENST00000568586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.85■■■■■ 6.37
RAB40C-211ENST00000568586 CUX2O14529 1486 aa54.71■■■■■ 6.35
RAB40C-211ENST00000568586 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.63■■■■■ 6.34
RAB40C-211ENST00000568586 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.59■■■■■ 6.33
RAB40C-211ENST00000568586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.53■■■■■ 6.32
RAB40C-211ENST00000568586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.33■■■■■ 6.29
RAB40C-211ENST00000568586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.3■■■■■ 6.28
RAB40C-211ENST00000568586 CFTRP13569 1480 aa54.2■■■■■ 6.27
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.97■■■■■ 6.23
RAB40C-211ENST00000568586 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.96■■■■■ 6.23
RAB40C-211ENST00000568586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.94■■■■■ 6.23
RAB40C-211ENST00000568586 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.9■■■■■ 6.22
RAB40C-211ENST00000568586 WDR62O43379 1518 aa53.83■■■■■ 6.21
RAB40C-211ENST00000568586 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.73■■■■■ 6.19
RAB40C-211ENST00000568586 PRDM2Q13029 1718 aa53.59■■■■■ 6.17
RAB40C-211ENST00000568586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.45■■■■■ 6.15
RAB40C-211ENST00000568586 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.08■■■■■ 6.09
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC8Q09428 1581 aa53.04■■■■■ 6.08
RAB40C-211ENST00000568586 TOPBP1Q92547 1522 aa53.02■■■■■ 6.08
RAB40C-211ENST00000568586 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.9■■■■■ 6.06
RAB40C-211ENST00000568586 IFT140Q96RY7 1462 aa52.85■■■■■ 6.05
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.62■■■■■ 6.01
RAB40C-211ENST00000568586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.55■■■■■ 6
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RAB40C-211ENST00000568586 CUX1P39880 1505 aa52.41■■■■■ 5.98
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RAB40C-211ENST00000568586 OSCARQ8IYS5 282 aa52.33■■■■■ 5.97
RAB40C-211ENST00000568586 SOGA1O94964 1423 aa52.32■■■■■ 5.97
RAB40C-211ENST00000568586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.31■■■■■ 5.96
RAB40C-211ENST00000568586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.29■■■■■ 5.96
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RAB40C-211ENST00000568586 WDR97A6NE52 1622 aa52.08■■■■■ 5.93
RAB40C-211ENST00000568586 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.08■■■■■ 5.93
RAB40C-211ENST00000568586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.88■■■■■ 5.9
RAB40C-211ENST00000568586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.84■■■■■ 5.89
RAB40C-211ENST00000568586 TOP2BQ02880 1626 aa51.82■■■■■ 5.89
RAB40C-211ENST00000568586 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.8■■■■■ 5.88
RAB40C-211ENST00000568586 GRIN2BQ13224 1484 aa51.78■■■■■ 5.88
RAB40C-211ENST00000568586 CHD1O14646 1710 aa51.74■■■■■ 5.87
RAB40C-211ENST00000568586 SYNJ1O43426 1573 aa51.74■■■■■ 5.87
RAB40C-211ENST00000568586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.73■■■■■ 5.87
RAB40C-211ENST00000568586 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.71■■■■■ 5.87
RAB40C-211ENST00000568586 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.69■■■■■ 5.87
RAB40C-211ENST00000568586 FBLN2P98095 1184 aa51.65■■■■■ 5.86
RAB40C-211ENST00000568586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.63■■■■■ 5.86
RAB40C-211ENST00000568586 PBRM1Q86U86 1689 aa51.52■■■■■ 5.84
RAB40C-211ENST00000568586 SYNJ2O15056 1496 aa51.51■■■■■ 5.84
RAB40C-211ENST00000568586 TRIM41Q8WV44 630 aa51.51■■■■■ 5.84
RAB40C-211ENST00000568586 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.5■■■■■ 5.83
RAB40C-211ENST00000568586 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.47■■■■■ 5.83
RAB40C-211ENST00000568586 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.47■■■■■ 5.83
RAB40C-211ENST00000568586 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.47■■■■■ 5.83
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF11O15085 1522 aa51.45■■■■■ 5.83
RAB40C-211ENST00000568586 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.31■■■■■ 5.8
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RAB40C-211ENST00000568586 ADAMTS12P58397 1594 aa51.15■■■■■ 5.78
RAB40C-211ENST00000568586 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.11■■■■■ 5.77
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RAB40C-211ENST00000568586 ARAP1Q96P48 1450 aa51.01■■■■■ 5.76
RAB40C-211ENST00000568586 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.98■■■■■ 5.75
RAB40C-211ENST00000568586 NUP160Q12769 1436 aa50.96■■■■■ 5.75
RAB40C-211ENST00000568586 CEP170Q5SW79 1584 aa50.85■■■■■ 5.73
RAB40C-211ENST00000568586 KIF27Q86VH2 1401 aa50.84■■■■■ 5.73
RAB40C-211ENST00000568586 IGF1RP08069 1367 aa50.78■■■■■ 5.72
RAB40C-211ENST00000568586 SHROOM2Q13796 1616 aa50.6■■■■■ 5.69
RAB40C-211ENST00000568586 CUL7Q14999 1698 aa50.55■■■■■ 5.68
RAB40C-211ENST00000568586 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.49■■■■■ 5.67
RAB40C-211ENST00000568586 JPH4Q96JJ6 628 aa50.41■■■■■ 5.66
RAB40C-211ENST00000568586 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.41■■■■■ 5.66
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