RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565511.5

RAB40C-209, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB40C, Length 783 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-209ENST00000565511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.52■■■■■ 7.12
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RAB40C-209ENST00000565511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.54■■■■■ 5.68
RAB40C-209ENST00000565511 NACADO15069 1562 aa50.26■■■■■ 5.64
RAB40C-209ENST00000565511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.96■■■■■ 5.59
RAB40C-209ENST00000565511 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.63■■■■■ 5.54
RAB40C-209ENST00000565511 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.6■■■■■ 5.53
RAB40C-209ENST00000565511 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.56■■■■■ 5.52
RAB40C-209ENST00000565511 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
RAB40C-209ENST00000565511 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.39■■■■■ 5.5
RAB40C-209ENST00000565511 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.21■■■■■ 5.47
RAB40C-209ENST00000565511 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.14■■■■■ 5.46
RAB40C-209ENST00000565511 SCRIBQ14160 1630 aa48.65■■■■■ 5.38
RAB40C-209ENST00000565511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.37■■■■■ 5.33
RAB40C-209ENST00000565511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.95■■■■■ 5.27
RAB40C-209ENST00000565511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
RAB40C-209ENST00000565511 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.71■■■■■ 5.23
RAB40C-209ENST00000565511 SMARCA4P51532 1647 aa46.41■■■■■ 5.02
RAB40C-209ENST00000565511 NCAPD3P42695 1498 aa46.39■■■■■ 5.02
RAB40C-209ENST00000565511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.34■■■■■ 5.01
RAB40C-209ENST00000565511 SMARCA2P51531 1590 aa46.17■■■■■ 4.98
RAB40C-209ENST00000565511 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
RAB40C-209ENST00000565511 HMGXB3Q12766 1538 aa46.12■■■■■ 4.97
RAB40C-209ENST00000565511 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.93■■■■■ 4.94
RAB40C-209ENST00000565511 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.92■■■■■ 4.94
RAB40C-209ENST00000565511 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
RAB40C-209ENST00000565511 NESP48681 1621 aa45.71■■■■■ 4.91
RAB40C-209ENST00000565511 ERCC6Q03468 1493 aa45.68■■■■■ 4.9
RAB40C-209ENST00000565511 CUX2O14529 1486 aa45.51■■■■■ 4.88
RAB40C-209ENST00000565511 WIZO95785 1651 aa45.41■■■■■ 4.86
RAB40C-209ENST00000565511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.31■■■■■ 4.84
RAB40C-209ENST00000565511 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
RAB40C-209ENST00000565511 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-209ENST00000565511 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.14■■■■■ 4.82
RAB40C-209ENST00000565511 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
RAB40C-209ENST00000565511 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.97■■■■■ 4.79
RAB40C-209ENST00000565511 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.95■■■■■ 4.79
RAB40C-209ENST00000565511 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
RAB40C-209ENST00000565511 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.66■■■■■ 4.74
RAB40C-209ENST00000565511 WDR62O43379 1518 aa44.58■■■■■ 4.73
RAB40C-209ENST00000565511 CFTRP13569 1480 aa44.57■■■■■ 4.73
RAB40C-209ENST00000565511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.52■■■■■ 4.72
RAB40C-209ENST00000565511 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.52■■■■■ 4.72
RAB40C-209ENST00000565511 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.28■■■■■ 4.68
RAB40C-209ENST00000565511 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
RAB40C-209ENST00000565511 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
RAB40C-209ENST00000565511 TOPBP1Q92547 1522 aa43.74■■■■■ 4.59
RAB40C-209ENST00000565511 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
RAB40C-209ENST00000565511 IFT140Q96RY7 1462 aa43.6■■■■■ 4.57
RAB40C-209ENST00000565511 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.59■■■■■ 4.57
RAB40C-209ENST00000565511 ABCC8Q09428 1581 aa43.5■■■■■ 4.55
RAB40C-209ENST00000565511 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
RAB40C-209ENST00000565511 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
RAB40C-209ENST00000565511 OSCARQ8IYS5 282 aa43.38■■■■■ 4.53
RAB40C-209ENST00000565511 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
RAB40C-209ENST00000565511 TRIM41Q8WV44 630 aa43.3■■■■■ 4.52
RAB40C-209ENST00000565511 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.21■■■■■ 4.512e-6■■■■■ 26.9
RAB40C-209ENST00000565511 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.18■■■■■ 4.5
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RAB40C-209ENST00000565511 CUX1P39880 1505 aa43.13■■■■■ 4.5
RAB40C-209ENST00000565511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.08■■■■■ 4.49
RAB40C-209ENST00000565511 CHD1O14646 1710 aa43.05■■■■■ 4.48
RAB40C-209ENST00000565511 SOGA1O94964 1423 aa43.03■■■■■ 4.48
RAB40C-209ENST00000565511 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43■■■■■ 4.47
RAB40C-209ENST00000565511 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43■■■■■ 4.47
RAB40C-209ENST00000565511 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43■■■■■ 4.47
RAB40C-209ENST00000565511 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
RAB40C-209ENST00000565511 ARHGEF11O15085 1522 aa42.87■■■■■ 4.45
RAB40C-209ENST00000565511 WDR97A6NE52 1622 aa42.86■■■■■ 4.45
RAB40C-209ENST00000565511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.79■■■■■ 4.44
RAB40C-209ENST00000565511 FBLN2P98095 1184 aa42.74■■■■■ 4.43
RAB40C-209ENST00000565511 GRIN2BQ13224 1484 aa42.64■■■■■ 4.42
RAB40C-209ENST00000565511 PBRM1Q86U86 1689 aa42.63■■■■■ 4.41
RAB40C-209ENST00000565511 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
RAB40C-209ENST00000565511 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.58■■■■■ 4.41
RAB40C-209ENST00000565511 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.57■■■■■ 4.41
RAB40C-209ENST00000565511 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.54■■■■■ 4.4
RAB40C-209ENST00000565511 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.53■■■■■ 4.4
RAB40C-209ENST00000565511 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.51■■■■■ 4.4
RAB40C-209ENST00000565511 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
RAB40C-209ENST00000565511 ARAP1Q96P48 1450 aa42.5■■■■■ 4.39
RAB40C-209ENST00000565511 SYNJ2O15056 1496 aa42.48■■■■■ 4.39
RAB40C-209ENST00000565511 TOP2BQ02880 1626 aa42.47■■■■■ 4.39
RAB40C-209ENST00000565511 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
RAB40C-209ENST00000565511 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.38
RAB40C-209ENST00000565511 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.41■■■■■ 4.38
RAB40C-209ENST00000565511 ADAMTS12P58397 1594 aa42.22■■■■■ 4.35
RAB40C-209ENST00000565511 GRIN2AQ12879 1464 aa42.14■■■■■ 4.34
RAB40C-209ENST00000565511 CEP170Q5SW79 1584 aa42.06■■■■■ 4.32
RAB40C-209ENST00000565511 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.02■■■■■ 4.32
RAB40C-209ENST00000565511 NUP160Q12769 1436 aa42■■■■■ 4.31
RAB40C-209ENST00000565511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.99■■■■■ 4.31
RAB40C-209ENST00000565511 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.97■■■■■ 4.31
RAB40C-209ENST00000565511 SHROOM2Q13796 1616 aa41.84■■■■■ 4.29
RAB40C-209ENST00000565511 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
RAB40C-209ENST00000565511 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.63■■■■■ 4.25
RAB40C-209ENST00000565511 IGF1RP08069 1367 aa41.55■■■■■ 4.24
RAB40C-209ENST00000565511 KIF27Q86VH2 1401 aa41.54■■■■■ 4.24
RAB40C-209ENST00000565511 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
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