RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586856.1

ERCC2-209, Transcript of ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunit, humanhuman

TSL 5

Gene ERCC2, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2-209ENST00000586856 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.89■■■■■ 7.02
ERCC2-209ENST00000586856 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.51■■■■■ 6
ERCC2-209ENST00000586856 ABCC9O60706 1549 aa51.45■■■■■ 5.83
ERCC2-209ENST00000586856 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.45■■■■■ 5.51
ERCC2-209ENST00000586856 NACADO15069 1562 aa49.34■■■■■ 5.49
ERCC2-209ENST00000586856 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.13■■■■■ 5.46
ERCC2-209ENST00000586856 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
ERCC2-209ENST00000586856 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.99■■■■■ 5.43
ERCC2-209ENST00000586856 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.73■■■■■ 5.39
ERCC2-209ENST00000586856 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
ERCC2-209ENST00000586856 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
ERCC2-209ENST00000586856 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.97■■■■■ 5.27
ERCC2-209ENST00000586856 SCRIBQ14160 1630 aa47.89■■■■■ 5.26
ERCC2-209ENST00000586856 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.45■■■■■ 5.19
ERCC2-209ENST00000586856 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.28■■■■■ 5.16
ERCC2-209ENST00000586856 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
ERCC2-209ENST00000586856 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.57■■■■■ 5.05
ERCC2-209ENST00000586856 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.25■■■■■ 4.99
ERCC2-209ENST00000586856 SMARCA4P51532 1647 aa45.78■■■■■ 4.92
ERCC2-209ENST00000586856 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
ERCC2-209ENST00000586856 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.51■■■■■ 4.88
ERCC2-209ENST00000586856 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
ERCC2-209ENST00000586856 SMARCA2P51531 1590 aa45.48■■■■■ 4.87
ERCC2-209ENST00000586856 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.4■■■■■ 4.86
ERCC2-209ENST00000586856 HMGXB3Q12766 1538 aa45.32■■■■■ 4.85
ERCC2-209ENST00000586856 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.32■■■■■ 4.85
ERCC2-209ENST00000586856 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
ERCC2-209ENST00000586856 WIZO95785 1651 aa44.93■■■■■ 4.78
ERCC2-209ENST00000586856 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
ERCC2-209ENST00000586856 NESP48681 1621 aa44.49■■■■■ 4.71
ERCC2-209ENST00000586856 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
ERCC2-209ENST00000586856 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.36■■■■■ 4.69
ERCC2-209ENST00000586856 ERCC6Q03468 1493 aa44.36■■■■■ 4.69
ERCC2-209ENST00000586856 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.13■■■■■ 4.65
ERCC2-209ENST00000586856 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.03■■■■■ 4.64
ERCC2-209ENST00000586856 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.01■■■■■ 4.64
ERCC2-209ENST00000586856 CUX2O14529 1486 aa43.95■■■■■ 4.63
ERCC2-209ENST00000586856 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
ERCC2-209ENST00000586856 CFTRP13569 1480 aa43.88■■■■■ 4.61
ERCC2-209ENST00000586856 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.86■■■■■ 4.61
ERCC2-209ENST00000586856 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.68■■■■■ 4.58
ERCC2-209ENST00000586856 PRDM2Q13029 1718 aa43.67■■■■■ 4.58
ERCC2-209ENST00000586856 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.65■■■■■ 4.58
ERCC2-209ENST00000586856 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.64■■■■■ 4.58
ERCC2-209ENST00000586856 WDR62O43379 1518 aa43.52■■■■■ 4.56
ERCC2-209ENST00000586856 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
ERCC2-209ENST00000586856 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
ERCC2-209ENST00000586856 TOPBP1Q92547 1522 aa42.98■■■■■ 4.47
ERCC2-209ENST00000586856 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.95■■■■■ 4.47
ERCC2-209ENST00000586856 ABCC8Q09428 1581 aa42.91■■■■■ 4.46
ERCC2-209ENST00000586856 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.88■■■■■ 4.45
ERCC2-209ENST00000586856 IFT140Q96RY7 1462 aa42.73■■■■■ 4.43
ERCC2-209ENST00000586856 CUX1P39880 1505 aa42.61■■■■■ 4.41
ERCC2-209ENST00000586856 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
ERCC2-209ENST00000586856 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
ERCC2-209ENST00000586856 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
ERCC2-209ENST00000586856 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
ERCC2-209ENST00000586856 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
ERCC2-209ENST00000586856 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.4■■■■■ 4.38
ERCC2-209ENST00000586856 SOGA1O94964 1423 aa42.36■■■■■ 4.37
ERCC2-209ENST00000586856 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.367e-11■■■■■ 54.3
ERCC2-209ENST00000586856 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.35
ERCC2-209ENST00000586856 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.24■■■■■ 4.35
ERCC2-209ENST00000586856 WDR97A6NE52 1622 aa42.22■■■■■ 4.35
ERCC2-209ENST00000586856 SYNJ1O43426 1573 aa42.22■■■■■ 4.35
ERCC2-209ENST00000586856 TOP2BQ02880 1626 aa42.21■■■■■ 4.35
ERCC2-209ENST00000586856 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
ERCC2-209ENST00000586856 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.05■■■■■ 4.32
ERCC2-209ENST00000586856 OSCARQ8IYS5 282 aa41.99■■■■■ 4.31
ERCC2-209ENST00000586856 CHD1O14646 1710 aa41.97■■■■■ 4.31
ERCC2-209ENST00000586856 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.96■■■■■ 4.31
ERCC2-209ENST00000586856 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
ERCC2-209ENST00000586856 GRIN2BQ13224 1484 aa41.93■■■■■ 4.3
ERCC2-209ENST00000586856 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.92■■■■■ 4.3
ERCC2-209ENST00000586856 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
ERCC2-209ENST00000586856 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
ERCC2-209ENST00000586856 FBLN2P98095 1184 aa41.73■■■■■ 4.27
ERCC2-209ENST00000586856 SYNJ2O15056 1496 aa41.68■■■■■ 4.26
ERCC2-209ENST00000586856 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
ERCC2-209ENST00000586856 ADAMTS12P58397 1594 aa41.59■■■■■ 4.25
ERCC2-209ENST00000586856 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.55■■■■■ 4.24
ERCC2-209ENST00000586856 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.49■■■■■ 4.23
ERCC2-209ENST00000586856 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.49■■■■■ 4.23
ERCC2-209ENST00000586856 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.49■■■■■ 4.23
ERCC2-209ENST00000586856 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
ERCC2-209ENST00000586856 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.23
ERCC2-209ENST00000586856 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.41■■■■■ 4.22
ERCC2-209ENST00000586856 GRIN2AQ12879 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
ERCC2-209ENST00000586856 KIF27Q86VH2 1401 aa41.35■■■■■ 4.21
ERCC2-209ENST00000586856 CEP170Q5SW79 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
ERCC2-209ENST00000586856 TRIM41Q8WV44 630 aa41.24■■■■■ 4.19
ERCC2-209ENST00000586856 NUP160Q12769 1436 aa41.23■■■■■ 4.19
ERCC2-209ENST00000586856 CUL7Q14999 1698 aa41.19■■■■■ 4.18
ERCC2-209ENST00000586856 IGF1RP08069 1367 aa41.16■■■■■ 4.18
ERCC2-209ENST00000586856 ARAP1Q96P48 1450 aa41.1■■■■■ 4.17
ERCC2-209ENST00000586856 SHROOM2Q13796 1616 aa40.99■■■■■ 4.15
ERCC2-209ENST00000586856 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
ERCC2-209ENST00000586856 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.95■■■■■ 4.15
ERCC2-209ENST00000586856 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.93■■■■■ 4.14
ERCC2-209ENST00000586856 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.88■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms