Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-208ENST00000476741 1717 ntTSL 211.97□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-216ENST00000584617 723 ntTSL 57.83□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-209ENST00000482007 1098 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.284e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 RAD51C-212ENST00000487921 653 ntTSL 34.57□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-207ENST00000559971 1455 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.373e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-203ENST00000380343 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-208ENST00000560353 672 ntTSL 39.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-202ENST00000380340 872 ntTSL 29.76□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-210ENST00000560890 758 ntTSL 39.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.313e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 DDX46-206ENST00000507053 530 ntTSL 44.89□□□□□ -1.633e-11■■■■■ 39.4
DDX3XO00571 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-12■■■■■ 39.3
DDX3XO00571 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.988e-12■■■■■ 39.3
DDX3XO00571 LRR1-204ENST00000554869 1886 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.528e-12■■■■■ 39.3
DDX3XO00571 LRR1-203ENST00000540712 1597 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.138e-12■■■■■ 39.3
DDX3XO00571 LSM1-204ENST00000522515 1568 ntTSL 317.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LSM1-202ENST00000520286 776 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.87■■□□□ 1.731e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 323.68■■□□□ 1.381e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 223.07■■□□□ 1.281e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.141e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.141e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.141e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 319.2■□□□□ 0.661e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.712e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 320.3■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 TAF7-203ENST00000624761 603 ntTSL 421.15■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 AC090360.1-202ENST00000562771 1032 ntAPPRIS P5 TSL 425.07■■□□□ 1.64e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.64e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.154e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 RBFA-203ENST00000586847 566 ntTSL 422.09■■□□□ 1.134e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 RBFA-204ENST00000591612 1587 nt19.9■□□□□ 0.784e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.414e-19■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 323.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 323.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 39.2
DDX3XO00571 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.431e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.11e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 NDUFB2-214ENST00000479181 665 ntTSL 27.68□□□□□ -1.181e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.561e-28■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-16■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.492e-16■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.982e-16■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 225.41■■□□□ 1.669e-14■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 522.7■■□□□ 1.229e-14■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 SEMA4B-203ENST00000558051 552 ntTSL 417.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 39.1
DDX3XO00571 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 532.92■■■□□ 2.869e-16■■■■■ 39
DDX3XO00571 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 530.35■■■□□ 2.459e-16■■■■■ 39
DDX3XO00571 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-11■■■■■ 39
DDX3XO00571 VPS18-203ENST00000558855 1050 ntTSL 513.71□□□□□ -0.215e-11■■■■■ 39
DDX3XO00571 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.297e-9■■■■■ 39
DDX3XO00571 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-11■■■■■ 39
DDX3XO00571 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.592e-12■■■■■ 39
DDX3XO00571 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 321.12■□□□□ 0.972e-12■■■■■ 39
DDX3XO00571 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 39
DDX3XO00571 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 39
DDX3XO00571 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 39
DDX3XO00571 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-54■■■■■ 39
DDX3XO00571 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-54■■■■■ 39
DDX3XO00571 PLOD2-205ENST00000469350 723 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-54■■■■■ 39
DDX3XO00571 ISG20L2-201ENST00000313146 3303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 39
DDX3XO00571 ISG20L2-204ENST00000470713 635 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 39
DDX3XO00571 ISG20L2-203ENST00000469074 594 ntTSL 27.35□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 39
DDX3XO00571 TMX4-202ENST00000462384 873 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 TMX4-203ENST00000527925 787 ntTSL 517.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-212ENST00000533656 923 ntTSL 222.89■■□□□ 1.251e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-207ENST00000529180 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.96■■□□□ 1.111e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-211ENST00000533487 600 ntTSL 321.78■■□□□ 1.081e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-214ENST00000534124 1089 ntTSL 521.61■■□□□ 1.051e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-209ENST00000530773 837 ntTSL 520.42■□□□□ 0.861e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-206ENST00000528588 723 ntTSL 320■□□□□ 0.791e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.631e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 VPS51-205ENST00000528050 426 ntTSL 29.51□□□□□ -0.891e-21■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.276e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 ETF1-208ENST00000514005 608 ntTSL 56.06□□□□□ -1.446e-9■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SERPINB1-202ENST00000460260 580 ntTSL 221.87■■□□□ 1.095e-28■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SERPINB1-205ENST00000490094 782 ntTSL 518.18■□□□□ 0.55e-28■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SERPINB1-204ENST00000476896 872 ntTSL 515.03■□□□□ -05e-28■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.075e-28■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.794e-11■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 322.12■■□□□ 1.134e-11■■■■■ 38.9
DDX3XO00571 KLHDC2-207ENST00000555443 1756 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-16■■■■■ 38.9
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