RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556039.5

ERO1A-206, Transcript of endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha, humanhuman

TSL 5

Gene ERO1A, Length 1,855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERO1A-206ENST00000556039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.69■■■■■ 8.43
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ERO1A-206ENST00000556039 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.98■■■■■ 6.55
ERO1A-206ENST00000556039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.79■■■■■ 6.52
ERO1A-206ENST00000556039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.59■■■■■ 6.49
ERO1A-206ENST00000556039 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.12■■■■■ 6.41
ERO1A-206ENST00000556039 ABCC9O60706 1549 aa55.12■■■■■ 6.41
ERO1A-206ENST00000556039 NACADO15069 1562 aa54.63■■■■■ 6.34
ERO1A-206ENST00000556039 SCRIBQ14160 1630 aa54.11■■■■■ 6.25
ERO1A-206ENST00000556039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.03■■■■■ 6.24
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ERO1A-206ENST00000556039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.9■■■■■ 6.06
ERO1A-206ENST00000556039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.72■■■■■ 6.03
ERO1A-206ENST00000556039 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.54■■■■■ 6
ERO1A-206ENST00000556039 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.37■■■■■ 5.97
ERO1A-206ENST00000556039 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.3■■■■■ 5.96
ERO1A-206ENST00000556039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.23■■■■■ 5.95
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ERO1A-206ENST00000556039 WIZO95785 1651 aa51.89■■■■■ 5.9
ERO1A-206ENST00000556039 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.75■■■■■ 5.88
ERO1A-206ENST00000556039 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.38■■■■■ 5.82
ERO1A-206ENST00000556039 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.26■■■■■ 5.8
ERO1A-206ENST00000556039 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.95■■■■■ 5.75
ERO1A-206ENST00000556039 SMARCA2P51531 1590 aa50.94■■■■■ 5.75
ERO1A-206ENST00000556039 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.89■■■■■ 5.74
ERO1A-206ENST00000556039 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.76■■■■■ 5.72
ERO1A-206ENST00000556039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
ERO1A-206ENST00000556039 TRIM41Q8WV44 630 aa50.56■■■■■ 5.68
ERO1A-206ENST00000556039 NCAPD3P42695 1498 aa50.43■■■■■ 5.66
ERO1A-206ENST00000556039 HMGXB3Q12766 1538 aa50.39■■■■■ 5.66
ERO1A-206ENST00000556039 ABCC8Q09428 1581 aa49.95■■■■■ 5.59
ERO1A-206ENST00000556039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.88■■■■■ 5.58
ERO1A-206ENST00000556039 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.78■■■■■ 5.56
ERO1A-206ENST00000556039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.62■■■■■ 5.53
ERO1A-206ENST00000556039 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.61■■■■■ 5.53
ERO1A-206ENST00000556039 CFTRP13569 1480 aa49.46■■■■■ 5.51
ERO1A-206ENST00000556039 SYNJ1O43426 1573 aa49.35■■■■■ 5.49
ERO1A-206ENST00000556039 EEA1Q15075 1411 aa49.22■■■■■ 5.47
ERO1A-206ENST00000556039 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.19■■■■■ 5.46
ERO1A-206ENST00000556039 PRDM2Q13029 1718 aa49.18■■■■■ 5.46
ERO1A-206ENST00000556039 SOGA1O94964 1423 aa49.15■■■■■ 5.46
ERO1A-206ENST00000556039 TOP2BQ02880 1626 aa49.13■■■■■ 5.46
ERO1A-206ENST00000556039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.05■■■■■ 5.44
ERO1A-206ENST00000556039 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.92■■■■■ 5.42
ERO1A-206ENST00000556039 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.9■■■■■ 5.42
ERO1A-206ENST00000556039 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.87■■■■■ 5.41
ERO1A-206ENST00000556039 CUX1P39880 1505 aa48.87■■■■■ 5.41
ERO1A-206ENST00000556039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.63■■■■■ 5.38
ERO1A-206ENST00000556039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.61■■■■■ 5.37
ERO1A-206ENST00000556039 NESP48681 1621 aa48.54■■■■■ 5.36
ERO1A-206ENST00000556039 GOLGA3Q08378 1498 aa48.54■■■■■ 5.36
ERO1A-206ENST00000556039 KIF21BO75037 1637 aa48.5■■■■■ 5.36
ERO1A-206ENST00000556039 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.5■■■■■ 5.35
ERO1A-206ENST00000556039 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.5■■■■■ 5.35
ERO1A-206ENST00000556039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.45■■■■■ 5.35
ERO1A-206ENST00000556039 KIF27Q86VH2 1401 aa48.34■■■■■ 5.33
ERO1A-206ENST00000556039 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
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ERO1A-206ENST00000556039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.27■■■■■ 5.32
ERO1A-206ENST00000556039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.26■■■■■ 5.32
ERO1A-206ENST00000556039 CEP162Q5TB80 1403 aa48.26■■■■■ 5.32
ERO1A-206ENST00000556039 TOPBP1Q92547 1522 aa48.16■■■■■ 5.3
ERO1A-206ENST00000556039 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.13■■■■■ 5.3
ERO1A-206ENST00000556039 PRXQ9BXM0 1461 aa48.12■■■■■ 5.29
ERO1A-206ENST00000556039 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.1■■■■■ 5.29
ERO1A-206ENST00000556039 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.08■■■■■ 5.29
ERO1A-206ENST00000556039 CUX2O14529 1486 aa48.07■■■■■ 5.29
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ERO1A-206ENST00000556039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
ERO1A-206ENST00000556039 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.93■■■■■ 5.26
ERO1A-206ENST00000556039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.87■■■■■ 5.25
ERO1A-206ENST00000556039 IGF1RP08069 1367 aa47.85■■■■■ 5.25
ERO1A-206ENST00000556039 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.81■■■■■ 5.24
ERO1A-206ENST00000556039 CLIP1P30622 1438 aa47.79■■■■■ 5.24
ERO1A-206ENST00000556039 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.63■■■■■ 5.21
ERO1A-206ENST00000556039 WDR97A6NE52 1622 aa47.6■■■■■ 5.21
ERO1A-206ENST00000556039 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.58■■■■■ 5.21
ERO1A-206ENST00000556039 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.44■■■■■ 5.18
ERO1A-206ENST00000556039 CUL7Q14999 1698 aa47.4■■■■■ 5.18
ERO1A-206ENST00000556039 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.4■■■■■ 5.18
ERO1A-206ENST00000556039 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
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ERO1A-206ENST00000556039 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
ERO1A-206ENST00000556039 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.32■■■■■ 5.17
ERO1A-206ENST00000556039 WDR62O43379 1518 aa47.3■■■■■ 5.16
ERO1A-206ENST00000556039 ERCC6Q03468 1493 aa47.24■■■■■ 5.15
ERO1A-206ENST00000556039 ARAP1Q96P48 1450 aa47.21■■■■■ 5.15
ERO1A-206ENST00000556039 HRCP23327 699 aa47.12■■■■■ 5.13
ERO1A-206ENST00000556039 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.12■■■■■ 5.13
ERO1A-206ENST00000556039 IFT140Q96RY7 1462 aa47.1■■■■■ 5.13
ERO1A-206ENST00000556039 APLP2Q06481 763 aa47.04■■■■■ 5.12
ERO1A-206ENST00000556039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
ERO1A-206ENST00000556039 PBRM1Q86U86 1689 aa46.96■■■■■ 5.11
ERO1A-206ENST00000556039 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.93■■■■■ 5.1
ERO1A-206ENST00000556039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.11e-6■■■□□ 18.5
ERO1A-206ENST00000556039 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
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