RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528157.5

MANF-204, Transcript of mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MANF, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANF-204ENST00000528157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.87■■■■■ 7.33
MANF-204ENST00000528157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.56■■■■■ 6.33
MANF-204ENST00000528157 ABCC9O60706 1549 aa54.45■■■■■ 6.31
MANF-204ENST00000528157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.83■■■■■ 5.89
MANF-204ENST00000528157 NACADO15069 1562 aa51.49■■■■■ 5.83
MANF-204ENST00000528157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.39■■■■■ 5.82
MANF-204ENST00000528157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.88■■■■■ 5.74
MANF-204ENST00000528157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.82■■■■■ 5.73
MANF-204ENST00000528157 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.74■■■■■ 5.71
MANF-204ENST00000528157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.72■■■■■ 5.71
MANF-204ENST00000528157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.48■■■■■ 5.67
MANF-204ENST00000528157 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.36■■■■■ 5.65
MANF-204ENST00000528157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.2■■■■■ 5.63
MANF-204ENST00000528157 SCRIBQ14160 1630 aa49.84■■■■■ 5.57
MANF-204ENST00000528157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.53■■■■■ 5.52
MANF-204ENST00000528157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.19■■■■■ 5.46
MANF-204ENST00000528157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
MANF-204ENST00000528157 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.98■■■■■ 5.43
MANF-204ENST00000528157 NCAPD3P42695 1498 aa47.5■■■■■ 5.19
MANF-204ENST00000528157 SMARCA4P51532 1647 aa47.49■■■■■ 5.19
MANF-204ENST00000528157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.44■■■■■ 5.18
MANF-204ENST00000528157 SMARCA2P51531 1590 aa47.3■■■■■ 5.16
MANF-204ENST00000528157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
MANF-204ENST00000528157 HMGXB3Q12766 1538 aa47.2■■■■■ 5.15
MANF-204ENST00000528157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
MANF-204ENST00000528157 ERCC6Q03468 1493 aa46.96■■■■■ 5.11
MANF-204ENST00000528157 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.95■■■■■ 5.11
MANF-204ENST00000528157 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.94■■■■■ 5.11
MANF-204ENST00000528157 NESP48681 1621 aa46.85■■■■■ 5.09
MANF-204ENST00000528157 CUX2O14529 1486 aa46.74■■■■■ 5.07
MANF-204ENST00000528157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.5■■■■■ 5.03
MANF-204ENST00000528157 WIZO95785 1651 aa46.47■■■■■ 5.03
MANF-204ENST00000528157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.45■■■■■ 5.03
MANF-204ENST00000528157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
MANF-204ENST00000528157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.3■■■■■ 5
MANF-204ENST00000528157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.13■■■■■ 4.98
MANF-204ENST00000528157 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.09■■■■■ 4.97
MANF-204ENST00000528157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
MANF-204ENST00000528157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
MANF-204ENST00000528157 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.79■■■■■ 4.92
MANF-204ENST00000528157 WDR62O43379 1518 aa45.67■■■■■ 4.9
MANF-204ENST00000528157 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.65■■■■■ 4.9
MANF-204ENST00000528157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.61■■■■■ 4.89
MANF-204ENST00000528157 CFTRP13569 1480 aa45.61■■■■■ 4.89
MANF-204ENST00000528157 PRDM2Q13029 1718 aa45.31■■■■■ 4.84
MANF-204ENST00000528157 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.29■■■■■ 4.84
MANF-204ENST00000528157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
MANF-204ENST00000528157 TOPBP1Q92547 1522 aa44.79■■■■■ 4.76
MANF-204ENST00000528157 IFT140Q96RY7 1462 aa44.69■■■■■ 4.74
MANF-204ENST00000528157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
MANF-204ENST00000528157 TRIM41Q8WV44 630 aa44.68■■■■■ 4.74
MANF-204ENST00000528157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.64■■■■■ 4.74
MANF-204ENST00000528157 OSCARQ8IYS5 282 aa44.63■■■■■ 4.74
MANF-204ENST00000528157 ABCC8Q09428 1581 aa44.6■■■■■ 4.73
MANF-204ENST00000528157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
MANF-204ENST00000528157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
MANF-204ENST00000528157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
MANF-204ENST00000528157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.29■■■■■ 4.682e-9■■■■■ 36.3
MANF-204ENST00000528157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.22■■■■■ 4.67
MANF-204ENST00000528157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
MANF-204ENST00000528157 CHD1O14646 1710 aa44.17■■■■■ 4.66
MANF-204ENST00000528157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.16■■■■■ 4.66
MANF-204ENST00000528157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.16■■■■■ 4.66
MANF-204ENST00000528157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.16■■■■■ 4.66
MANF-204ENST00000528157 CUX1P39880 1505 aa44.11■■■■■ 4.65
MANF-204ENST00000528157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.11■■■■■ 4.65
MANF-204ENST00000528157 SOGA1O94964 1423 aa44.11■■■■■ 4.65
MANF-204ENST00000528157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
MANF-204ENST00000528157 ARHGEF11O15085 1522 aa43.99■■■■■ 4.63
MANF-204ENST00000528157 FBLN2P98095 1184 aa43.98■■■■■ 4.63
MANF-204ENST00000528157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.86■■■■■ 4.61
MANF-204ENST00000528157 WDR97A6NE52 1622 aa43.85■■■■■ 4.61
MANF-204ENST00000528157 GRIN2BQ13224 1484 aa43.7■■■■■ 4.59
MANF-204ENST00000528157 PBRM1Q86U86 1689 aa43.68■■■■■ 4.58
MANF-204ENST00000528157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MANF-204ENST00000528157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.65■■■■■ 4.58
MANF-204ENST00000528157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
MANF-204ENST00000528157 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.59■■■■■ 4.57
MANF-204ENST00000528157 ARAP1Q96P48 1450 aa43.58■■■■■ 4.57
MANF-204ENST00000528157 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.56■■■■■ 4.56
MANF-204ENST00000528157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.56■■■■■ 4.56
MANF-204ENST00000528157 SYNJ2O15056 1496 aa43.54■■■■■ 4.56
MANF-204ENST00000528157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.54■■■■■ 4.56
MANF-204ENST00000528157 SYNJ1O43426 1573 aa43.54■■■■■ 4.56
MANF-204ENST00000528157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.45■■■■■ 4.55
MANF-204ENST00000528157 TOP2BQ02880 1626 aa43.43■■■■■ 4.54
MANF-204ENST00000528157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
MANF-204ENST00000528157 ADAMTS12P58397 1594 aa43.22■■■■■ 4.51
MANF-204ENST00000528157 GRIN2AQ12879 1464 aa43.16■■■■■ 4.5
MANF-204ENST00000528157 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
MANF-204ENST00000528157 CEP170Q5SW79 1584 aa43.06■■■■■ 4.48
MANF-204ENST00000528157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.02■■■■■ 4.48
MANF-204ENST00000528157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.01■■■■■ 4.48
MANF-204ENST00000528157 NUP160Q12769 1436 aa42.98■■■■■ 4.47
MANF-204ENST00000528157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.98■■■■■ 4.47
MANF-204ENST00000528157 SHROOM2Q13796 1616 aa42.82■■■■■ 4.44
MANF-204ENST00000528157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.6■■■■■ 4.41
MANF-204ENST00000528157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
MANF-204ENST00000528157 KIF27Q86VH2 1401 aa42.54■■■■■ 4.4
MANF-204ENST00000528157 JPH4Q96JJ6 628 aa42.53■■■■■ 4.4
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