Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.19■■□□□ 1.34e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.41■□□□□ 0.864e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.55■□□□□ 0.724e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.614e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.5□□□□□ -0.894e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.5□□□□□ -0.894e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.62□□□□□ -1.034e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 57.07□□□□□ -1.284e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 56.69□□□□□ -1.344e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.63□□□□□ -1.514e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.944e-78■■■■■ 527.9
DDX3XO00571 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.44□□□□□ -0.19e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.8□□□□□ -0.529e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.64□□□□□ -0.559e-54■■■■■ 339.3
DDX3XO00571 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 210.92□□□□□ -0.664e-72■■■■■ 314.2
DDX3XO00571 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.614e-72■■■■■ 314.2
DDX3XO00571 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 226.45■■□□□ 1.822e-75■■■■■ 164.5
DDX3XO00571 TMEM14B-219ENST00000492297 559 ntTSL 215.74■□□□□ 0.112e-15■■■■■ 145.7
DDX3XO00571 PTDSS1-203ENST00000517557 757 ntTSL 222.74■■□□□ 1.235e-44■■■■■ 141
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DDX3XO00571 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.354e-29■■■■■ 128.1
DDX3XO00571 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.254e-29■■■■■ 128.1
DDX3XO00571 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-28■■■■■ 126
DDX3XO00571 PTDSS1-201ENST00000337004 2366 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.347e-20■■■■■ 123.4
DDX3XO00571 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-20■■■■■ 123.4
DDX3XO00571 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-17■■■■■ 120.1
DDX3XO00571 AAED1-203ENST00000446045 2723 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.015e-17■■■■■ 120.1
DDX3XO00571 PRADC1-203ENST00000480093 600 ntTSL 524.72■■□□□ 1.554e-18■■■■■ 119.7
DDX3XO00571 PRADC1-202ENST00000470391 551 ntTSL 323.92■■□□□ 1.424e-18■■■■■ 119.7
DDX3XO00571 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-18■■■■■ 119.7
DDX3XO00571 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 326.45■■□□□ 1.823e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 226.32■■□□□ 1.83e-27■■■■■ 118.4
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DDX3XO00571 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 325.16■■□□□ 1.623e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.483e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.083e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.053e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 518.86■□□□□ 0.613e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.593e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 318.11■□□□□ 0.493e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 516.25■□□□□ 0.193e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-27■■■■■ 118.4
DDX3XO00571 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.552e-23■■■■■ 117.7
DDX3XO00571 APOC1-204ENST00000589078 213 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 117.3
DDX3XO00571 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-24■■■■■ 114.3
DDX3XO00571 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-23■■■■■ 114.1
DDX3XO00571 DFFA-203ENST00000476658 744 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-23■■■■■ 114.1
DDX3XO00571 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-23■■■■■ 114.1
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DDX3XO00571 GPR89A-202ENST00000460277 1955 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.512e-22■■■■■ 111.2
DDX3XO00571 GPR89A-211ENST00000528944 866 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-22■■■■■ 111.2
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DDX3XO00571 GPR89A-201ENST00000313835 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-22■■■■■ 111.2
DDX3XO00571 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-22■■■■■ 111.2
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DDX3XO00571 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 109.1
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DDX3XO00571 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-17■■■■■ 109.1
DDX3XO00571 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-17■■■■■ 109.1
DDX3XO00571 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 108.6
DDX3XO00571 TMEM38B-203ENST00000434214 502 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 108.6
DDX3XO00571 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-25■■■■■ 107.6
DDX3XO00571 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.631e-25■■■■■ 107.6
DDX3XO00571 TOR1AIP2-204ENST00000483123 2687 ntTSL 28.62□□□□□ -1.032e-20■■■■■ 106.5
DDX3XO00571 TOR1AIP2-202ENST00000474318 1760 ntTSL 57.82□□□□□ -1.162e-20■■■■■ 106.5
DDX3XO00571 SLC39A9-208ENST00000556125 944 ntTSL 320.13■□□□□ 0.813e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-205ENST00000554059 1763 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.543e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-207ENST00000555840 2377 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 211.81□□□□□ -0.523e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-211ENST00000628474 3701 ntTSL 59.95□□□□□ -0.823e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC39A9-206ENST00000555245 1531 ntTSL 28.11□□□□□ -1.113e-12■■■■■ 105.5
DDX3XO00571 SLC25A23-201ENST00000264088 2056 ntTSL 1 (best)26.23■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-205ENST00000595267 742 ntTSL 226.23■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.793e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 SLC25A23-208ENST00000597307 557 ntTSL 413.15□□□□□ -0.33e-25■■■■■ 105.4
DDX3XO00571 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 314.06□□□□□ -0.168e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 313.27□□□□□ -0.298e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 38.81□□□□□ -18e-16■■■■■ 105.1
DDX3XO00571 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.233e-10■■■■■ 105
DDX3XO00571 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.533e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.523e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-52■■■■■ 103.9
DDX3XO00571 FAM50A-205ENST00000481619 763 ntTSL 212.65□□□□□ -0.383e-23■■■■■ 102.9
DDX3XO00571 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 218.64■□□□□ 0.579e-23■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.549e-23■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 CD24-207ENST00000621311 257 ntTSL 417.39■□□□□ 0.379e-49■■■■■ 100.8
DDX3XO00571 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.099e-23■■■■■ 100.8
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