RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462384.6

TMX4-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMX4, Length 873 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-202ENST00000462384 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.9■■■■■ 5.74
TMX4-202ENST00000462384 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.44■■■■■ 4.86
TMX4-202ENST00000462384 ABCC9O60706 1549 aa45■■■■■ 4.79
TMX4-202ENST00000462384 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
TMX4-202ENST00000462384 NACADO15069 1562 aa42.82■■■■■ 4.44
TMX4-202ENST00000462384 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.77■■■■■ 4.44
TMX4-202ENST00000462384 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.35■■■■■ 4.37
TMX4-202ENST00000462384 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
TMX4-202ENST00000462384 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.12■■■■■ 4.33
TMX4-202ENST00000462384 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.02■■■■■ 4.32
TMX4-202ENST00000462384 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
TMX4-202ENST00000462384 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.77■■■■■ 4.28
TMX4-202ENST00000462384 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.73■■■■■ 4.27
TMX4-202ENST00000462384 SCRIBQ14160 1630 aa41.52■■■■■ 4.24
TMX4-202ENST00000462384 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.14■■■■■ 4.18
TMX4-202ENST00000462384 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
TMX4-202ENST00000462384 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.66■■■■■ 4.1
TMX4-202ENST00000462384 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.44■■■■■ 4.06
TMX4-202ENST00000462384 SMARCA4P51532 1647 aa39.62■■■■□ 3.93
TMX4-202ENST00000462384 NCAPD3P42695 1498 aa39.51■■■■□ 3.92
TMX4-202ENST00000462384 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.5■■■■□ 3.91
TMX4-202ENST00000462384 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
TMX4-202ENST00000462384 SMARCA2P51531 1590 aa39.4■■■■□ 3.9
TMX4-202ENST00000462384 HMGXB3Q12766 1538 aa39.29■■■■□ 3.88
TMX4-202ENST00000462384 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.27■■■■□ 3.88
TMX4-202ENST00000462384 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.18■■■■□ 3.86
TMX4-202ENST00000462384 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
TMX4-202ENST00000462384 WIZO95785 1651 aa38.85■■■■□ 3.81
TMX4-202ENST00000462384 NESP48681 1621 aa38.81■■■■□ 3.8
TMX4-202ENST00000462384 ERCC6Q03468 1493 aa38.77■■■■□ 3.8
TMX4-202ENST00000462384 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
TMX4-202ENST00000462384 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.55■■■■□ 3.76
TMX4-202ENST00000462384 CUX2O14529 1486 aa38.47■■■■□ 3.75
TMX4-202ENST00000462384 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
TMX4-202ENST00000462384 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.34■■■■□ 3.73
TMX4-202ENST00000462384 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.34■■■■□ 3.73
TMX4-202ENST00000462384 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
TMX4-202ENST00000462384 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
TMX4-202ENST00000462384 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
TMX4-202ENST00000462384 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.97■■■■□ 3.67
TMX4-202ENST00000462384 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.95■■■■□ 3.67
TMX4-202ENST00000462384 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.93■■■■□ 3.66
TMX4-202ENST00000462384 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.91■■■■□ 3.66
TMX4-202ENST00000462384 WDR62O43379 1518 aa37.87■■■■□ 3.65
TMX4-202ENST00000462384 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.85■■■■□ 3.65
TMX4-202ENST00000462384 PRDM2Q13029 1718 aa37.74■■■■□ 3.63
TMX4-202ENST00000462384 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
TMX4-202ENST00000462384 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
TMX4-202ENST00000462384 TOPBP1Q92547 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
TMX4-202ENST00000462384 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.19■■■■□ 3.54
TMX4-202ENST00000462384 ABCC8Q09428 1581 aa37.17■■■■□ 3.54
TMX4-202ENST00000462384 IFT140Q96RY7 1462 aa37.13■■■■□ 3.53
TMX4-202ENST00000462384 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
TMX4-202ENST00000462384 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
TMX4-202ENST00000462384 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
TMX4-202ENST00000462384 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
TMX4-202ENST00000462384 CUX1P39880 1505 aa36.87■■■■□ 3.49
TMX4-202ENST00000462384 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.83■■■■□ 3.49
TMX4-202ENST00000462384 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.81■■■■□ 3.48
TMX4-202ENST00000462384 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
TMX4-202ENST00000462384 OSCARQ8IYS5 282 aa36.79■■■■□ 3.48
TMX4-202ENST00000462384 SOGA1O94964 1423 aa36.76■■■■□ 3.48
TMX4-202ENST00000462384 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
TMX4-202ENST00000462384 CHD1O14646 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
TMX4-202ENST00000462384 WDR97A6NE52 1622 aa36.53■■■■□ 3.44
TMX4-202ENST00000462384 TRIM41Q8WV44 630 aa36.49■■■■□ 3.43
TMX4-202ENST00000462384 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.44■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 FBLN2P98095 1184 aa36.44■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 SYNJ1O43426 1573 aa36.41■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.4■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 TOP2BQ02880 1626 aa36.39■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.39■■■■□ 3.42
TMX4-202ENST00000462384 GRIN2BQ13224 1484 aa36.38■■■■□ 3.41
TMX4-202ENST00000462384 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.35■■■■□ 3.41
TMX4-202ENST00000462384 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.35■■■■□ 3.41
TMX4-202ENST00000462384 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.35■■■■□ 3.41
TMX4-202ENST00000462384 PBRM1Q86U86 1689 aa36.34■■■■□ 3.41
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TMX4-202ENST00000462384 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TMX4-202ENST00000462384 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.31■■■■□ 3.4
TMX4-202ENST00000462384 ARHGEF11O15085 1522 aa36.27■■■■□ 3.4
TMX4-202ENST00000462384 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
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TMX4-202ENST00000462384 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.1■■■■□ 3.37
TMX4-202ENST00000462384 ADAMTS12P58397 1594 aa36.01■■■■□ 3.35
TMX4-202ENST00000462384 ARAP1Q96P48 1450 aa35.97■■■■□ 3.35
TMX4-202ENST00000462384 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.95■■■■□ 3.35
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TMX4-202ENST00000462384 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
TMX4-202ENST00000462384 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.88■■■■□ 3.33
TMX4-202ENST00000462384 CEP170Q5SW79 1584 aa35.82■■■■□ 3.32
TMX4-202ENST00000462384 NUP160Q12769 1436 aa35.78■■■■□ 3.32
TMX4-202ENST00000462384 KIF27Q86VH2 1401 aa35.66■■■■□ 3.3
TMX4-202ENST00000462384 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.64■■■■□ 3.3
TMX4-202ENST00000462384 IGF1RP08069 1367 aa35.6■■■■□ 3.29
TMX4-202ENST00000462384 SHROOM2Q13796 1616 aa35.58■■■■□ 3.29
TMX4-202ENST00000462384 CUL7Q14999 1698 aa35.52■■■■□ 3.28
TMX4-202ENST00000462384 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.49■■■■□ 3.27
TMX4-202ENST00000462384 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
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