Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-18■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ZKSCAN1-203ENST00000432317 573 ntTSL 48.09□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PPAT-205ENST00000510643 808 ntTSL 517.8■□□□□ 0.442e-10■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PPAT-204ENST00000507724 563 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-10■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PPAT-201ENST00000264220 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-10■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 530.33■■■□□ 2.458e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.088e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-207ENST00000467395 410 ntTSL 327.63■■■□□ 2.018e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-204ENST00000562312 682 ntTSL 527.35■■□□□ 1.974e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 323.96■■□□□ 1.438e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.258e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-207ENST00000574734 616 ntTSL 322.55■■□□□ 1.24e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.128e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.934e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.924e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.884e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.794e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.64e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-206ENST00000564991 3765 ntTSL 518.7■□□□□ 0.584e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.474e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt17.68■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.394e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.334e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.224e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.134e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-204ENST00000571957 392 ntTSL 215.58■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.014e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TXNDC17-209ENST00000576020 391 ntTSL 213.33□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 513.06□□□□□ -0.328e-8■■□□□ 11.8
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FTOQ9C0B1 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 312.67□□□□□ -0.388e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ACYP1-203ENST00000553302 606 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.498e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.984e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)26.19■■□□□ 1.784e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.594e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.184e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 515.84■□□□□ 0.134e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.144e-11■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.021e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 231.9■■■□□ 2.71e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.321e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PTPRS-209ENST00000591760 478 ntTSL 229.39■■■□□ 2.31e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-210ENST00000561072 574 ntTSL 429.09■■■□□ 2.252e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.221e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.881e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.742e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.682e-8■■□□□ 11.8
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FTOQ9C0B1 NIPA2-206ENST00000559571 673 ntTSL 325.44■■□□□ 1.662e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.582e-8■■□□□ 11.8
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FTOQ9C0B1 NIPA2-208ENST00000560205 589 ntTSL 424.56■■□□□ 1.522e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.481e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-212ENST00000530836 1613 ntTSL 524.26■■□□□ 1.471e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-208ENST00000527797 1609 ntTSL 524.15■■□□□ 1.461e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-209ENST00000528142 1821 ntTSL 324.07■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.412e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-206ENST00000526734 570 ntTSL 223.48■■□□□ 1.351e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-213ENST00000530983 2337 ntTSL 522.65■■□□□ 1.221e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.141e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.122e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.092e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-207ENST00000526977 2036 ntTSL 521.8■■□□□ 1.081e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 420.59■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 420.59■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.762e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 419.69■□□□□ 0.741e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NR3C1-216ENST00000514699 623 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-211ENST00000481304 1014 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.652e-8■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.641e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 STRN4-218ENST00000600358 1267 ntTSL 518.53■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-202ENST00000434049 816 ntTSL 517.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-203ENST00000445564 568 ntTSL 417.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 GDI1-209ENST00000475976 600 ntTSL 217.63■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 CCPG1-206ENST00000564092 578 ntTSL 417.31■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 11.8
FTOQ9C0B1 VPS28-215ENST00000531924 695 ntTSL 317.12■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 11.8
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