RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460976.5

CTBP2-206, Transcript of C-terminal binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTBP2, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2-206ENST00000460976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.45■■■■■ 8.07
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CTBP2-206ENST00000460976 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.51■■■■■ 6.48
CTBP2-206ENST00000460976 NACADO15069 1562 aa55.24■■■■■ 6.43
CTBP2-206ENST00000460976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.91■■■■■ 6.38
CTBP2-206ENST00000460976 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.65■■■■■ 6.34
CTBP2-206ENST00000460976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.37■■■■■ 6.29
CTBP2-206ENST00000460976 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.32■■■■■ 6.29
CTBP2-206ENST00000460976 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.14■■■■■ 6.26
CTBP2-206ENST00000460976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54■■■■■ 6.24
CTBP2-206ENST00000460976 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.85■■■■■ 6.21
CTBP2-206ENST00000460976 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.83■■■■■ 6.21
CTBP2-206ENST00000460976 SCRIBQ14160 1630 aa53.37■■■■■ 6.13
CTBP2-206ENST00000460976 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.22■■■■■ 6.11
CTBP2-206ENST00000460976 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.48■■■■■ 5.99
CTBP2-206ENST00000460976 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.47■■■■■ 5.99
CTBP2-206ENST00000460976 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.2■■■■■ 5.95
CTBP2-206ENST00000460976 SMARCA4P51532 1647 aa50.99■■■■■ 5.75
CTBP2-206ENST00000460976 NCAPD3P42695 1498 aa50.94■■■■■ 5.75
CTBP2-206ENST00000460976 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.85■■■■■ 5.73
CTBP2-206ENST00000460976 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.81■■■■■ 5.72
CTBP2-206ENST00000460976 SMARCA2P51531 1590 aa50.8■■■■■ 5.72
CTBP2-206ENST00000460976 HMGXB3Q12766 1538 aa50.67■■■■■ 5.7
CTBP2-206ENST00000460976 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.5■■■■■ 5.67
CTBP2-206ENST00000460976 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.43■■■■■ 5.66
CTBP2-206ENST00000460976 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.41■■■■■ 5.66
CTBP2-206ENST00000460976 ERCC6Q03468 1493 aa50.06■■■■■ 5.6
CTBP2-206ENST00000460976 NESP48681 1621 aa49.96■■■■■ 5.59
CTBP2-206ENST00000460976 WIZO95785 1651 aa49.88■■■■■ 5.58
CTBP2-206ENST00000460976 CUX2O14529 1486 aa49.82■■■■■ 5.57
CTBP2-206ENST00000460976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.78■■■■■ 5.56
CTBP2-206ENST00000460976 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.53■■■■■ 5.52
CTBP2-206ENST00000460976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.44■■■■■ 5.5
CTBP2-206ENST00000460976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
CTBP2-206ENST00000460976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.41■■■■■ 5.5
CTBP2-206ENST00000460976 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.4■■■■■ 5.5
CTBP2-206ENST00000460976 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
CTBP2-206ENST00000460976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.11■■■■■ 5.45
CTBP2-206ENST00000460976 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.98■■■■■ 5.43
CTBP2-206ENST00000460976 CFTRP13569 1480 aa48.96■■■■■ 5.43
CTBP2-206ENST00000460976 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.89■■■■■ 5.42
CTBP2-206ENST00000460976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.86■■■■■ 5.41
CTBP2-206ENST00000460976 WDR62O43379 1518 aa48.86■■■■■ 5.41
CTBP2-206ENST00000460976 PRDM2Q13029 1718 aa48.69■■■■■ 5.39
CTBP2-206ENST00000460976 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.67■■■■■ 5.38
CTBP2-206ENST00000460976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
CTBP2-206ENST00000460976 TOPBP1Q92547 1522 aa48.01■■■■■ 5.28
CTBP2-206ENST00000460976 ABCC8Q09428 1581 aa47.96■■■■■ 5.27
CTBP2-206ENST00000460976 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.92■■■■■ 5.26
CTBP2-206ENST00000460976 IFT140Q96RY7 1462 aa47.89■■■■■ 5.26
CTBP2-206ENST00000460976 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.71■■■■■ 5.23
CTBP2-206ENST00000460976 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
CTBP2-206ENST00000460976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
CTBP2-206ENST00000460976 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
CTBP2-206ENST00000460976 OSCARQ8IYS5 282 aa47.55■■■■■ 5.2
CTBP2-206ENST00000460976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
CTBP2-206ENST00000460976 CUX1P39880 1505 aa47.35■■■■■ 5.17
CTBP2-206ENST00000460976 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.33■■■■■ 5.17
CTBP2-206ENST00000460976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.33■■■■■ 5.17
CTBP2-206ENST00000460976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.33■■■■■ 5.17
CTBP2-206ENST00000460976 SOGA1O94964 1423 aa47.3■■■■■ 5.16
CTBP2-206ENST00000460976 WDR97A6NE52 1622 aa47.18■■■■■ 5.14
CTBP2-206ENST00000460976 TRIM41Q8WV44 630 aa47.17■■■■■ 5.14
CTBP2-206ENST00000460976 CHD1O14646 1710 aa47.16■■■■■ 5.14
CTBP2-206ENST00000460976 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
CTBP2-206ENST00000460976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
CTBP2-206ENST00000460976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
CTBP2-206ENST00000460976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.97■■■■■ 5.11
CTBP2-206ENST00000460976 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.92■■■■■ 5.1
CTBP2-206ENST00000460976 FBLN2P98095 1184 aa46.9■■■■■ 5.1
CTBP2-206ENST00000460976 GRIN2BQ13224 1484 aa46.87■■■■■ 5.09
CTBP2-206ENST00000460976 ARHGEF11O15085 1522 aa46.85■■■■■ 5.09
CTBP2-206ENST00000460976 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
CTBP2-206ENST00000460976 PBRM1Q86U86 1689 aa46.82■■■■■ 5.09
CTBP2-206ENST00000460976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.82■■■■■ 5.09
CTBP2-206ENST00000460976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.81■■■■■ 5.08
CTBP2-206ENST00000460976 TOP2BQ02880 1626 aa46.77■■■■■ 5.08
CTBP2-206ENST00000460976 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.76■■■■■ 5.08
CTBP2-206ENST00000460976 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.76■■■■■ 5.08
CTBP2-206ENST00000460976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.075e-6■■■□□ 14.6
CTBP2-206ENST00000460976 SYNJ1O43426 1573 aa46.71■■■■■ 5.07
CTBP2-206ENST00000460976 SYNJ2O15056 1496 aa46.66■■■■■ 5.06
CTBP2-206ENST00000460976 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
CTBP2-206ENST00000460976 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.57■■■■■ 5.05
CTBP2-206ENST00000460976 ARAP1Q96P48 1450 aa46.41■■■■■ 5.02
CTBP2-206ENST00000460976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.38■■■■■ 5.02
CTBP2-206ENST00000460976 ADAMTS12P58397 1594 aa46.35■■■■■ 5.01
CTBP2-206ENST00000460976 GRIN2AQ12879 1464 aa46.28■■■■■ 5
CTBP2-206ENST00000460976 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.27■■■■■ 5
CTBP2-206ENST00000460976 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.2■■■■■ 4.99
CTBP2-206ENST00000460976 CEP170Q5SW79 1584 aa46.1■■■■■ 4.97
CTBP2-206ENST00000460976 NUP160Q12769 1436 aa46.09■■■■■ 4.97
CTBP2-206ENST00000460976 SHROOM2Q13796 1616 aa45.89■■■■■ 4.94
CTBP2-206ENST00000460976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.84■■■■■ 4.93
CTBP2-206ENST00000460976 KIF27Q86VH2 1401 aa45.84■■■■■ 4.93
CTBP2-206ENST00000460976 CUL7Q14999 1698 aa45.75■■■■■ 4.91
CTBP2-206ENST00000460976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
CTBP2-206ENST00000460976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.7■■■■■ 4.91
CTBP2-206ENST00000460976 IGF1RP08069 1367 aa45.7■■■■■ 4.91
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