Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-14■■■■■ 559.8
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 413.45□□□□□ -0.261e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.451e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 411.26□□□□□ -0.611e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 410.09□□□□□ -0.791e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 47.54□□□□□ -1.21e-91■■■■■ 349.5
FTOQ9C0B1 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 411.02□□□□□ -0.655e-11■■■■■ 204.6
FTOQ9C0B1 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 219.73■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 518.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 216.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.78□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 157.3
FTOQ9C0B1 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 228.7■■■□□ 2.198e-33■■■■■ 90.7
FTOQ9C0B1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.056e-13■■■■■ 83.9
FTOQ9C0B1 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 320.24■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.84e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-8■■■■■ 73.4
FTOQ9C0B1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.123e-29■■■■■ 72.1
FTOQ9C0B1 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 323.87■■□□□ 1.413e-29■■■■■ 72.1
FTOQ9C0B1 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-15■■■■■ 70.9
FTOQ9C0B1 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-12■■■■■ 67.7
FTOQ9C0B1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-12■■■■■ 66
FTOQ9C0B1 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 517.39■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 66
FTOQ9C0B1 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 222.77■■□□□ 1.244e-12■■■■■ 58.4
FTOQ9C0B1 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 58.2
FTOQ9C0B1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.58e-12■■■■■ 58.1
FTOQ9C0B1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 57.9
FTOQ9C0B1 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.94□□□□□ -1.781e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.44□□□□□ -1.861e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.131e-14■■■■■ 57.8
FTOQ9C0B1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 417.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 415.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 57.7
FTOQ9C0B1 C1QTNF12-205ENST00000486627 639 ntTSL 325.79■■□□□ 1.725e-12■■■■■ 56.3
FTOQ9C0B1 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 221.16■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 56.1
FTOQ9C0B1 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 425.53■■□□□ 1.682e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-206ENST00000539611 576 ntTSL 524.04■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-204ENST00000485410 563 ntTSL 322.06■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 54.5
FTOQ9C0B1 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 423.12■■□□□ 1.291e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.57■■□□□ 1.21e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 321.45■■□□□ 1.021e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 221.08■□□□□ 0.971e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 417.75■□□□□ 0.431e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.351e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 317.05■□□□□ 0.321e-11■■■■■ 54.4
FTOQ9C0B1 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 527.78■■■□□ 2.041e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 326.78■■□□□ 1.881e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 226.09■■□□□ 1.771e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 321.31■■□□□ 11e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 53.6
FTOQ9C0B1 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.241e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 53.4
FTOQ9C0B1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 53.2
FTOQ9C0B1 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 520.85■□□□□ 0.933e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.013e-12■■■■■ 53
FTOQ9C0B1 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 318.62■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 51.4
FTOQ9C0B1 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 416.57■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 51.4
FTOQ9C0B1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.461e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 321.46■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 521.46■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 420.4■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 519.41■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 519.34■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 512.07□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 310.25□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 51.3
FTOQ9C0B1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 50.9
FTOQ9C0B1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 50.8
FTOQ9C0B1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 50.8
Retrieved 100 of 7,068 protein–RNA pairs in 34.4 ms