RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.41■■■■■ 7.74
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PTPRS-209ENST00000591760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.55■■■■■ 6.16
PTPRS-209ENST00000591760 NACADO15069 1562 aa53.36■■■■■ 6.13
PTPRS-209ENST00000591760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.08■■■■■ 6.09
PTPRS-209ENST00000591760 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.89■■■■■ 6.06
PTPRS-209ENST00000591760 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.74■■■■■ 6.03
PTPRS-209ENST00000591760 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.48■■■■■ 5.99
PTPRS-209ENST00000591760 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.33■■■■■ 5.97
PTPRS-209ENST00000591760 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.01■■■■■ 5.92
PTPRS-209ENST00000591760 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.9■■■■■ 5.9
PTPRS-209ENST00000591760 SCRIBQ14160 1630 aa51.62■■■■■ 5.85
PTPRS-209ENST00000591760 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.56■■■■■ 5.84
PTPRS-209ENST00000591760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.41■■■■■ 5.82
PTPRS-209ENST00000591760 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.6■■■■■ 5.69
PTPRS-209ENST00000591760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.51■■■■■ 5.68
PTPRS-209ENST00000591760 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.23■■■■■ 5.63
PTPRS-209ENST00000591760 SMARCA4P51532 1647 aa49.34■■■■■ 5.49
PTPRS-209ENST00000591760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.22■■■■■ 5.47
PTPRS-209ENST00000591760 NCAPD3P42695 1498 aa49.19■■■■■ 5.47
PTPRS-209ENST00000591760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.14■■■■■ 5.46
PTPRS-209ENST00000591760 SMARCA2P51531 1590 aa49.13■■■■■ 5.46
PTPRS-209ENST00000591760 HMGXB3Q12766 1538 aa48.98■■■■■ 5.43
PTPRS-209ENST00000591760 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.87■■■■■ 5.41
PTPRS-209ENST00000591760 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.83■■■■■ 5.41
PTPRS-209ENST00000591760 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.4
PTPRS-209ENST00000591760 WIZO95785 1651 aa48.31■■■■■ 5.32
PTPRS-209ENST00000591760 ERCC6Q03468 1493 aa48.2■■■■■ 5.31
PTPRS-209ENST00000591760 NESP48681 1621 aa48.14■■■■■ 5.3
PTPRS-209ENST00000591760 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
PTPRS-209ENST00000591760 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.04■■■■■ 5.28
PTPRS-209ENST00000591760 CUX2O14529 1486 aa47.87■■■■■ 5.25
PTPRS-209ENST00000591760 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
PTPRS-209ENST00000591760 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.73■■■■■ 5.23
PTPRS-209ENST00000591760 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.7■■■■■ 5.23
PTPRS-209ENST00000591760 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.64■■■■■ 5.22
PTPRS-209ENST00000591760 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
PTPRS-209ENST00000591760 CFTRP13569 1480 aa47.36■■■■■ 5.17
PTPRS-209ENST00000591760 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.25■■■■■ 5.15
PTPRS-209ENST00000591760 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.22■■■■■ 5.15
PTPRS-209ENST00000591760 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.21■■■■■ 5.15
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.18■■■■■ 5.14
PTPRS-209ENST00000591760 WDR62O43379 1518 aa47.13■■■■■ 5.14
PTPRS-209ENST00000591760 PRDM2Q13029 1718 aa47.07■■■■■ 5.13
PTPRS-209ENST00000591760 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.88■■■■■ 5.1
PTPRS-209ENST00000591760 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
PTPRS-209ENST00000591760 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
PTPRS-209ENST00000591760 ABCC8Q09428 1581 aa46.39■■■■■ 5.02
PTPRS-209ENST00000591760 TOPBP1Q92547 1522 aa46.39■■■■■ 5.02
PTPRS-209ENST00000591760 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.34■■■■■ 5.01
PTPRS-209ENST00000591760 IFT140Q96RY7 1462 aa46.24■■■■■ 4.99
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
PTPRS-209ENST00000591760 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
PTPRS-209ENST00000591760 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
PTPRS-209ENST00000591760 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
PTPRS-209ENST00000591760 CUX1P39880 1505 aa45.86■■■■■ 4.93
PTPRS-209ENST00000591760 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.79■■■■■ 4.92
PTPRS-209ENST00000591760 SOGA1O94964 1423 aa45.75■■■■■ 4.91
PTPRS-209ENST00000591760 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.74■■■■■ 4.91
PTPRS-209ENST00000591760 OSCARQ8IYS5 282 aa45.72■■■■■ 4.91
PTPRS-209ENST00000591760 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.69■■■■■ 4.917e-6■■□□□ 12.2
PTPRS-209ENST00000591760 WDR97A6NE52 1622 aa45.63■■■■■ 4.89
PTPRS-209ENST00000591760 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
PTPRS-209ENST00000591760 CHD1O14646 1710 aa45.42■■■■■ 4.86
PTPRS-209ENST00000591760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.39■■■■■ 4.86
PTPRS-209ENST00000591760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.39■■■■■ 4.86
PTPRS-209ENST00000591760 TOP2BQ02880 1626 aa45.37■■■■■ 4.85
PTPRS-209ENST00000591760 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.33■■■■■ 4.85
PTPRS-209ENST00000591760 SYNJ1O43426 1573 aa45.32■■■■■ 4.85
PTPRS-209ENST00000591760 GRIN2BQ13224 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
PTPRS-209ENST00000591760 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.31■■■■■ 4.84
PTPRS-209ENST00000591760 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
PTPRS-209ENST00000591760 FBLN2P98095 1184 aa45.24■■■■■ 4.83
PTPRS-209ENST00000591760 PBRM1Q86U86 1689 aa45.24■■■■■ 4.83
PTPRS-209ENST00000591760 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.23■■■■■ 4.83
PTPRS-209ENST00000591760 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.23■■■■■ 4.83
PTPRS-209ENST00000591760 TRIM41Q8WV44 630 aa45.13■■■■■ 4.82
PTPRS-209ENST00000591760 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.12■■■■■ 4.81
PTPRS-209ENST00000591760 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.12■■■■■ 4.81
PTPRS-209ENST00000591760 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.12■■■■■ 4.81
PTPRS-209ENST00000591760 SYNJ2O15056 1496 aa45.09■■■■■ 4.81
PTPRS-209ENST00000591760 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.05■■■■■ 4.8
PTPRS-209ENST00000591760 ARHGEF11O15085 1522 aa45.05■■■■■ 4.8
PTPRS-209ENST00000591760 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.9■■■■■ 4.78
PTPRS-209ENST00000591760 ADAMTS12P58397 1594 aa44.83■■■■■ 4.77
PTPRS-209ENST00000591760 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
PTPRS-209ENST00000591760 GRIN2AQ12879 1464 aa44.72■■■■■ 4.75
PTPRS-209ENST00000591760 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.7■■■■■ 4.75
PTPRS-209ENST00000591760 ARAP1Q96P48 1450 aa44.63■■■■■ 4.73
PTPRS-209ENST00000591760 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.57■■■■■ 4.73
PTPRS-209ENST00000591760 CEP170Q5SW79 1584 aa44.53■■■■■ 4.72
PTPRS-209ENST00000591760 NUP160Q12769 1436 aa44.53■■■■■ 4.72
PTPRS-209ENST00000591760 KIF27Q86VH2 1401 aa44.49■■■■■ 4.71
PTPRS-209ENST00000591760 CUL7Q14999 1698 aa44.35■■■■■ 4.69
PTPRS-209ENST00000591760 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
PTPRS-209ENST00000591760 SHROOM2Q13796 1616 aa44.3■■■■■ 4.68
PTPRS-209ENST00000591760 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.19■■■■■ 4.67
PTPRS-209ENST00000591760 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.19■■■■■ 4.66
PTPRS-209ENST00000591760 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.05■■■■■ 4.64
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