RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.21■■■■■ 4.19
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PTPRS-208ENST00000590509 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.12■■■■□ 3.53
PTPRS-208ENST00000590509 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.06■■■■□ 3.36
PTPRS-208ENST00000590509 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPRS-208ENST00000590509 NACADO15069 1562 aa35.2■■■■□ 3.23
PTPRS-208ENST00000590509 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
PTPRS-208ENST00000590509 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.01■■■■□ 3.2
PTPRS-208ENST00000590509 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.98■■■■□ 3.19
PTPRS-208ENST00000590509 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.76■■■■□ 3.16
PTPRS-208ENST00000590509 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
PTPRS-208ENST00000590509 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.08■■■■□ 3.05
PTPRS-208ENST00000590509 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
PTPRS-208ENST00000590509 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.01■■■■□ 3.04
PTPRS-208ENST00000590509 SCRIBQ14160 1630 aa33.93■■■■□ 3.02
PTPRS-208ENST00000590509 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.92■■■■□ 3.02
PTPRS-208ENST00000590509 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.9■■■■□ 3.02
PTPRS-208ENST00000590509 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PTPRS-208ENST00000590509 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.29■■■□□ 2.92
PTPRS-208ENST00000590509 CUX2O14529 1486 aa32.61■■■□□ 2.81
PTPRS-208ENST00000590509 NCAPD3P42695 1498 aa32.55■■■□□ 2.8
PTPRS-208ENST00000590509 ERCC6Q03468 1493 aa32.52■■■□□ 2.8
PTPRS-208ENST00000590509 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.43■■■□□ 2.78
PTPRS-208ENST00000590509 NESP48681 1621 aa32.38■■■□□ 2.77
PTPRS-208ENST00000590509 SMARCA4P51532 1647 aa32.27■■■□□ 2.76
PTPRS-208ENST00000590509 HMGXB3Q12766 1538 aa32.24■■■□□ 2.75
PTPRS-208ENST00000590509 SMARCA2P51531 1590 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRS-208ENST00000590509 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
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PTPRS-208ENST00000590509 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
PTPRS-208ENST00000590509 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRS-208ENST00000590509 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.89■■■□□ 2.7
PTPRS-208ENST00000590509 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRS-208ENST00000590509 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.84■■■□□ 2.69
PTPRS-208ENST00000590509 TRIM41Q8WV44 630 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRS-208ENST00000590509 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.66■■■□□ 2.66
PTPRS-208ENST00000590509 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRS-208ENST00000590509 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.49■■■□□ 2.63
PTPRS-208ENST00000590509 WDR62O43379 1518 aa31.45■■■□□ 2.63
PTPRS-208ENST00000590509 WIZO95785 1651 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRS-208ENST00000590509 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRS-208ENST00000590509 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRS-208ENST00000590509 CFTRP13569 1480 aa31.08■■■□□ 2.57
PTPRS-208ENST00000590509 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
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PTPRS-208ENST00000590509 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PTPRS-208ENST00000590509 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
PTPRS-208ENST00000590509 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRS-208ENST00000590509 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRS-208ENST00000590509 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.84■■■□□ 2.53
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
PTPRS-208ENST00000590509 PRDM2Q13029 1718 aa30.71■■■□□ 2.51
PTPRS-208ENST00000590509 ARHGEF11O15085 1522 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRS-208ENST00000590509 IFT140Q96RY7 1462 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRS-208ENST00000590509 TOPBP1Q92547 1522 aa30.58■■■□□ 2.49
PTPRS-208ENST00000590509 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PTPRS-208ENST00000590509 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRS-208ENST00000590509 CHD1O14646 1710 aa30.43■■■□□ 2.46
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PTPRS-208ENST00000590509 ARAP1Q96P48 1450 aa30.36■■■□□ 2.45
PTPRS-208ENST00000590509 ABCC8Q09428 1581 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRS-208ENST00000590509 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PTPRS-208ENST00000590509 FBLN2P98095 1184 aa30.23■■■□□ 2.43
PTPRS-208ENST00000590509 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PTPRS-208ENST00000590509 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRS-208ENST00000590509 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
PTPRS-208ENST00000590509 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.06■■■□□ 2.4
PTPRS-208ENST00000590509 SOGA1O94964 1423 aa30.05■■■□□ 2.4
PTPRS-208ENST00000590509 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRS-208ENST00000590509 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRS-208ENST00000590509 CUX1P39880 1505 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRS-208ENST00000590509 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PTPRS-208ENST00000590509 SYNJ1O43426 1573 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRS-208ENST00000590509 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PTPRS-208ENST00000590509 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
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PTPRS-208ENST00000590509 PBRM1Q86U86 1689 aa29.74■■■□□ 2.35
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PTPRS-208ENST00000590509 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.68■■■□□ 2.34
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PTPRS-208ENST00000590509 GRIN2AQ12879 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
PTPRS-208ENST00000590509 CEP170Q5SW79 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTS12P58397 1594 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRS-208ENST00000590509 NUP160Q12769 1436 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRS-208ENST00000590509 SHROOM2Q13796 1616 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRS-208ENST00000590509 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRS-208ENST00000590509 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
PTPRS-208ENST00000590509 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRS-208ENST00000590509 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRS-208ENST00000590509 TOP2BQ02880 1626 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPRS-208ENST00000590509 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPRS-208ENST00000590509 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRS-208ENST00000590509 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.14■■■□□ 2.25
PTPRS-208ENST00000590509 JPH4Q96JJ6 628 aa29.09■■■□□ 2.25
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