RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562312.1

NOMO2-204, Transcript of NODAL modulator 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO2, Length 682 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO2-204ENST00000562312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.74■■■■■ 6.99
NOMO2-204ENST00000562312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.54■■■■■ 6
NOMO2-204ENST00000562312 ABCC9O60706 1549 aa52.38■■■■■ 5.98
NOMO2-204ENST00000562312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.95■■■■■ 5.59
NOMO2-204ENST00000562312 NACADO15069 1562 aa49.68■■■■■ 5.54
NOMO2-204ENST00000562312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.58■■■■■ 5.53
NOMO2-204ENST00000562312 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.09■■■■■ 5.45
NOMO2-204ENST00000562312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.94■■■■■ 5.43
NOMO2-204ENST00000562312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.86■■■■■ 5.41
NOMO2-204ENST00000562312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
NOMO2-204ENST00000562312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.7■■■■■ 5.39
NOMO2-204ENST00000562312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
NOMO2-204ENST00000562312 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.44■■■■■ 5.35
NOMO2-204ENST00000562312 SCRIBQ14160 1630 aa47.92■■■■■ 5.26
NOMO2-204ENST00000562312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.87■■■■■ 5.25
NOMO2-204ENST00000562312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.3■■■■■ 5.16
NOMO2-204ENST00000562312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
NOMO2-204ENST00000562312 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.17■■■■■ 5.14
NOMO2-204ENST00000562312 NCAPD3P42695 1498 aa45.89■■■■■ 4.94
NOMO2-204ENST00000562312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.77■■■■■ 4.92
NOMO2-204ENST00000562312 SMARCA4P51532 1647 aa45.74■■■■■ 4.91
NOMO2-204ENST00000562312 SMARCA2P51531 1590 aa45.65■■■■■ 4.9
NOMO2-204ENST00000562312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
NOMO2-204ENST00000562312 HMGXB3Q12766 1538 aa45.52■■■■■ 4.88
NOMO2-204ENST00000562312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
NOMO2-204ENST00000562312 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.3■■■■■ 4.84
NOMO2-204ENST00000562312 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.25■■■■■ 4.83
NOMO2-204ENST00000562312 ERCC6Q03468 1493 aa45.23■■■■■ 4.83
NOMO2-204ENST00000562312 CUX2O14529 1486 aa45.05■■■■■ 4.8
NOMO2-204ENST00000562312 NESP48681 1621 aa45.04■■■■■ 4.8
NOMO2-204ENST00000562312 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.8■■■■■ 4.76
NOMO2-204ENST00000562312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.77■■■■■ 4.76
NOMO2-204ENST00000562312 WIZO95785 1651 aa44.69■■■■■ 4.74
NOMO2-204ENST00000562312 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.58■■■■■ 4.73
NOMO2-204ENST00000562312 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.53■■■■■ 4.72
NOMO2-204ENST00000562312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
NOMO2-204ENST00000562312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
NOMO2-204ENST00000562312 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.41■■■■■ 4.7
NOMO2-204ENST00000562312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
NOMO2-204ENST00000562312 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.14■■■■■ 4.66
NOMO2-204ENST00000562312 CFTRP13569 1480 aa44.04■■■■■ 4.64
NOMO2-204ENST00000562312 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.01■■■■■ 4.64
NOMO2-204ENST00000562312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.99■■■■■ 4.63
NOMO2-204ENST00000562312 WDR62O43379 1518 aa43.99■■■■■ 4.63
NOMO2-204ENST00000562312 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.7■■■■■ 4.59
NOMO2-204ENST00000562312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
NOMO2-204ENST00000562312 PRDM2Q13029 1718 aa43.49■■■■■ 4.55
NOMO2-204ENST00000562312 TOPBP1Q92547 1522 aa43.17■■■■■ 4.5
NOMO2-204ENST00000562312 IFT140Q96RY7 1462 aa43.14■■■■■ 4.5
NOMO2-204ENST00000562312 ABCC8Q09428 1581 aa43.13■■■■■ 4.5
NOMO2-204ENST00000562312 OSCARQ8IYS5 282 aa43.11■■■■■ 4.49
NOMO2-204ENST00000562312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.02■■■■■ 4.48
NOMO2-204ENST00000562312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
NOMO2-204ENST00000562312 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
NOMO2-204ENST00000562312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
NOMO2-204ENST00000562312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
NOMO2-204ENST00000562312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
NOMO2-204ENST00000562312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
NOMO2-204ENST00000562312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
NOMO2-204ENST00000562312 SOGA1O94964 1423 aa42.61■■■■■ 4.41
NOMO2-204ENST00000562312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.6■■■■■ 4.41
NOMO2-204ENST00000562312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.51■■■■■ 4.4
NOMO2-204ENST00000562312 CUX1P39880 1505 aa42.5■■■■■ 4.39
NOMO2-204ENST00000562312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
NOMO2-204ENST00000562312 FBLN2P98095 1184 aa42.41■■■■■ 4.38
NOMO2-204ENST00000562312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.4■■■■■ 4.38
NOMO2-204ENST00000562312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.4■■■■■ 4.38
NOMO2-204ENST00000562312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.4■■■■■ 4.38
NOMO2-204ENST00000562312 CHD1O14646 1710 aa42.35■■■■■ 4.37
NOMO2-204ENST00000562312 WDR97A6NE52 1622 aa42.34■■■■■ 4.37
NOMO2-204ENST00000562312 ARHGEF11O15085 1522 aa42.32■■■■■ 4.37
NOMO2-204ENST00000562312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.23■■■■■ 4.35
NOMO2-204ENST00000562312 GRIN2BQ13224 1484 aa42.18■■■■■ 4.34
NOMO2-204ENST00000562312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
NOMO2-204ENST00000562312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
NOMO2-204ENST00000562312 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.08■■■■■ 4.33
NOMO2-204ENST00000562312 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.07■■■■■ 4.33
NOMO2-204ENST00000562312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.06■■■■■ 4.32
NOMO2-204ENST00000562312 SYNJ2O15056 1496 aa42.01■■■■■ 4.32
NOMO2-204ENST00000562312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.31
NOMO2-204ENST00000562312 SYNJ1O43426 1573 aa41.95■■■■■ 4.31
NOMO2-204ENST00000562312 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
NOMO2-204ENST00000562312 ARAP1Q96P48 1450 aa41.92■■■■■ 4.3
NOMO2-204ENST00000562312 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.92■■■■■ 4.3
NOMO2-204ENST00000562312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.91■■■■■ 4.3
NOMO2-204ENST00000562312 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
NOMO2-204ENST00000562312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.85■■■■■ 4.29
NOMO2-204ENST00000562312 GRIN2AQ12879 1464 aa41.62■■■■■ 4.25
NOMO2-204ENST00000562312 ADAMTS12P58397 1594 aa41.59■■■■■ 4.25
NOMO2-204ENST00000562312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.56■■■■■ 4.24
NOMO2-204ENST00000562312 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
NOMO2-204ENST00000562312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.53■■■■■ 4.24
NOMO2-204ENST00000562312 NUP160Q12769 1436 aa41.49■■■■■ 4.23
NOMO2-204ENST00000562312 CEP170Q5SW79 1584 aa41.42■■■■■ 4.22
NOMO2-204ENST00000562312 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.28■■■■■ 4.2
NOMO2-204ENST00000562312 SHROOM2Q13796 1616 aa41.22■■■■■ 4.19
NOMO2-204ENST00000562312 KIF27Q86VH2 1401 aa41.14■■■■■ 4.18
NOMO2-204ENST00000562312 JPH4Q96JJ6 628 aa41.13■■■■■ 4.17
NOMO2-204ENST00000562312 IGF1RP08069 1367 aa41.11■■■■■ 4.17
NOMO2-204ENST00000562312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
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