Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 CANX-210ENST00000505090 485 ntTSL 27.59□□□□□ -1.194e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.168e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.378e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 34.87□□□□□ -1.638e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 NMU-204ENST00000509371 283 ntTSL 1 (best)3.27□□□□□ -1.898e-11■□□□□ 11
SRSF7Q16629 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.26e-6■□□□□ 11
SRSF7Q16629 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 11
SRSF7Q16629 MAT2A-206ENST00000490878 565 ntTSL 34.54□□□□□ -1.684e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.243e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 215.17■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 210.7□□□□□ -0.73e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 28.83□□□□□ -14e-10■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.456e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 NOP58-206ENST00000478508 599 ntTSL 24.67□□□□□ -1.666e-7■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 29.96□□□□□ -0.822e-10■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 GABRE-205ENST00000465405 706 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.322e-10■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 GABRE-211ENST00000491339 2072 ntTSL 26.78□□□□□ -1.322e-10■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 36.17□□□□□ -1.423e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.473e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 VIRMA-204ENST00000519001 460 ntTSL 34.94□□□□□ -1.623e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.743e-8■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 06e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-205ENST00000476143 581 ntTSL 310.82□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.836e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.936e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-204ENST00000465705 760 ntTSL 59.13□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.16e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-206ENST00000481278 752 ntTSL 38.07□□□□□ -1.126e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.266e-6■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 211.55□□□□□ -0.563e-19■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-19■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.852e-13■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-27■□□□□ 10.9
SRSF7Q16629 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 513.78□□□□□ -0.25e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.338e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 213.53□□□□□ -0.248e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.418e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.988e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-203ENST00000502508 552 ntTSL 512.76□□□□□ -0.377e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-213ENST00000513066 656 ntTSL 38.19□□□□□ -1.17e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-210ENST00000508361 2481 ntTSL 28.15□□□□□ -1.17e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.127e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.167e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.177e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-212ENST00000509731 2170 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.217e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.277e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-207ENST00000505012 608 ntTSL 47.09□□□□□ -1.277e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-208ENST00000506040 755 ntTSL 56.96□□□□□ -1.37e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-209ENST00000507716 2475 ntTSL 26.86□□□□□ -1.317e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-214ENST00000514259 466 ntTSL 43.99□□□□□ -1.777e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.657e-6■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.513e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-10■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 317.04■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 314.4□□□□□ -0.13e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.293e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-203ENST00000595671 2054 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.673e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-10■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.093e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ZIM2-205ENST00000597281 2037 ntTSL 1 (best)7.11□□□□□ -1.273e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 46.79□□□□□ -1.323e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 39.7□□□□□ -0.866e-10■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 55.71□□□□□ -1.51e-8■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 49.56□□□□□ -0.883e-12■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-207ENST00000412738 1018 ntTSL 310.69□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-214ENST00000434927 716 ntTSL 57.12□□□□□ -1.275e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 46.99□□□□□ -1.295e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 36.74□□□□□ -1.335e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 55.63□□□□□ -1.515e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 25.42□□□□□ -1.545e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.655e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 24.72□□□□□ -1.655e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 34.67□□□□□ -1.665e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 53.3□□□□□ -1.885e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.945e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 52.58□□□□□ -25e-7■□□□□ 10.8
SRSF7Q16629 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 39.31□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 59.31□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 10.7
SRSF7Q16629 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 39.25□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 10.7
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