RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.26■■■□□ 2.92
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USP48-201ENST00000308271 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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USP48-201ENST00000308271 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.96■■□□□ 1.75
USP48-201ENST00000308271 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.95■■□□□ 1.75
USP48-201ENST00000308271 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USP48-201ENST00000308271 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.95■■□□□ 1.74
USP48-201ENST00000308271 ARID3CA6NKF2 412 aa25.93■■□□□ 1.74
USP48-201ENST00000308271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.93■■□□□ 1.74
USP48-201ENST00000308271 CCER2I3L3R5 266 aa25.93■■□□□ 1.74
USP48-201ENST00000308271 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.93■■□□□ 1.74
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