Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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