RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286353.8

PXYLP1-201, Transcript of 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXYLP1, Length 3,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1-201ENST00000286353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.43■■■■□ 3.1
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PXYLP1-201ENST00000286353 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.42■■■□□ 2.14
PXYLP1-201ENST00000286353 NACADO15069 1562 aa27.77■■■□□ 2.04
PXYLP1-201ENST00000286353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.46■■□□□ 1.99
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PXYLP1-201ENST00000286353 SCRIBQ14160 1630 aa27.23■■□□□ 1.95
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PXYLP1-201ENST00000286353 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
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PXYLP1-201ENST00000286353 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.48■■□□□ 1.83
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PXYLP1-201ENST00000286353 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.4■■□□□ 1.82
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PXYLP1-201ENST00000286353 SMARCA2P51531 1590 aa25.98■■□□□ 1.75
PXYLP1-201ENST00000286353 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.73■■□□□ 1.71
PXYLP1-201ENST00000286353 HMGXB3Q12766 1538 aa25.72■■□□□ 1.71
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PXYLP1-201ENST00000286353 NCAPD3P42695 1498 aa25.51■■□□□ 1.67
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PXYLP1-201ENST00000286353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.26■■□□□ 1.64
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PXYLP1-201ENST00000286353 SYNJ1O43426 1573 aa25.14■■□□□ 1.61
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PXYLP1-201ENST00000286353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.04■■□□□ 1.6
PXYLP1-201ENST00000286353 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
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PXYLP1-201ENST00000286353 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.8■■□□□ 1.56
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PXYLP1-201ENST00000286353 GOLGA3Q08378 1498 aa24.67■■□□□ 1.54
PXYLP1-201ENST00000286353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.67■■□□□ 1.54
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PXYLP1-201ENST00000286353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.3■■□□□ 1.48
PXYLP1-201ENST00000286353 TOPBP1Q92547 1522 aa24.29■■□□□ 1.48
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PXYLP1-201ENST00000286353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.26■■□□□ 1.47
PXYLP1-201ENST00000286353 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.26■■□□□ 1.47
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PXYLP1-201ENST00000286353 NESP48681 1621 aa24.16■■□□□ 1.46
PXYLP1-201ENST00000286353 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.15■■□□□ 1.46
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PXYLP1-201ENST00000286353 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.11■■□□□ 1.45
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PXYLP1-201ENST00000286353 CUX2O14529 1486 aa24.07■■□□□ 1.44
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PXYLP1-201ENST00000286353 ADAMTS12P58397 1594 aa23.8■■□□□ 1.4
PXYLP1-201ENST00000286353 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
PXYLP1-201ENST00000286353 TIAM1Q13009 1591 aa23.74■■□□□ 1.39
PXYLP1-201ENST00000286353 IFT140Q96RY7 1462 aa23.7■■□□□ 1.39
PXYLP1-201ENST00000286353 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PXYLP1-201ENST00000286353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.67■■□□□ 1.38
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