RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568146.1

NOL3-211, Transcript of nucleolar protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOL3, Length 1,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3-211ENST00000568146 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.16■■■■■ 4.98
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NOL3-211ENST00000568146 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.12■■■■□ 3.85
NOL3-211ENST00000568146 NACADO15069 1562 aa38.94■■■■□ 3.82
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NOL3-211ENST00000568146 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
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NOL3-211ENST00000568146 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.22■■■■□ 3.71
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NOL3-211ENST00000568146 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.54■■■■□ 3.6
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NOL3-211ENST00000568146 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.03■■■■□ 3.52
NOL3-211ENST00000568146 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.88■■■■□ 3.49
NOL3-211ENST00000568146 NCAPD3P42695 1498 aa35.98■■■■□ 3.35
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NOL3-211ENST00000568146 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.91■■■■□ 3.34
NOL3-211ENST00000568146 SMARCA2P51531 1590 aa35.78■■■■□ 3.32
NOL3-211ENST00000568146 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
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NOL3-211ENST00000568146 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.61■■■■□ 3.29
NOL3-211ENST00000568146 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.57■■■■□ 3.29
NOL3-211ENST00000568146 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
NOL3-211ENST00000568146 ERCC6Q03468 1493 aa35.32■■■■□ 3.24
NOL3-211ENST00000568146 NESP48681 1621 aa35.3■■■■□ 3.24
NOL3-211ENST00000568146 CUX2O14529 1486 aa35.2■■■■□ 3.22
NOL3-211ENST00000568146 WIZO95785 1651 aa35.12■■■■□ 3.21
NOL3-211ENST00000568146 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.08■■■■□ 3.21
NOL3-211ENST00000568146 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
NOL3-211ENST00000568146 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
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NOL3-211ENST00000568146 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.86■■■■□ 3.17
NOL3-211ENST00000568146 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.84■■■■□ 3.17
NOL3-211ENST00000568146 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.81■■■■□ 3.16
NOL3-211ENST00000568146 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
NOL3-211ENST00000568146 CFTRP13569 1480 aa34.57■■■■□ 3.12
NOL3-211ENST00000568146 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.56■■■■□ 3.12
NOL3-211ENST00000568146 WDR62O43379 1518 aa34.49■■■■□ 3.11
NOL3-211ENST00000568146 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.47■■■■□ 3.11
NOL3-211ENST00000568146 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.47■■■■□ 3.11
NOL3-211ENST00000568146 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.33■■■■□ 3.09
NOL3-211ENST00000568146 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
NOL3-211ENST00000568146 PRDM2Q13029 1718 aa34.16■■■■□ 3.06
NOL3-211ENST00000568146 TOPBP1Q92547 1522 aa33.87■■■■□ 3.01
NOL3-211ENST00000568146 IFT140Q96RY7 1462 aa33.78■■■■□ 3
NOL3-211ENST00000568146 ABCC8Q09428 1581 aa33.78■■■■□ 3
NOL3-211ENST00000568146 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.76■■■□□ 2.99
NOL3-211ENST00000568146 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
NOL3-211ENST00000568146 OSCARQ8IYS5 282 aa33.6■■■□□ 2.97
NOL3-211ENST00000568146 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
NOL3-211ENST00000568146 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
NOL3-211ENST00000568146 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
NOL3-211ENST00000568146 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
NOL3-211ENST00000568146 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.94
NOL3-211ENST00000568146 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.41■■■□□ 2.94
NOL3-211ENST00000568146 CUX1P39880 1505 aa33.41■■■□□ 2.94
NOL3-211ENST00000568146 SOGA1O94964 1423 aa33.37■■■□□ 2.93
NOL3-211ENST00000568146 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.37■■■□□ 2.93
NOL3-211ENST00000568146 TRIM41Q8WV44 630 aa33.36■■■□□ 2.93
NOL3-211ENST00000568146 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
NOL3-211ENST00000568146 WDR97A6NE52 1622 aa33.21■■■□□ 2.91
NOL3-211ENST00000568146 CHD1O14646 1710 aa33.19■■■□□ 2.9
NOL3-211ENST00000568146 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.15■■■□□ 2.9
NOL3-211ENST00000568146 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.15■■■□□ 2.9
NOL3-211ENST00000568146 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.15■■■□□ 2.9
NOL3-211ENST00000568146 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.11■■■□□ 2.89
NOL3-211ENST00000568146 ARHGEF11O15085 1522 aa33.1■■■□□ 2.89
NOL3-211ENST00000568146 FBLN2P98095 1184 aa33.08■■■□□ 2.89
NOL3-211ENST00000568146 GRIN2BQ13224 1484 aa33.06■■■□□ 2.88
NOL3-211ENST00000568146 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
NOL3-211ENST00000568146 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.03■■■□□ 2.88
NOL3-211ENST00000568146 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.97■■■□□ 2.87
NOL3-211ENST00000568146 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.94■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 TOP2BQ02880 1626 aa32.93■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.92■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 SYNJ2O15056 1496 aa32.92■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 SYNJ1O43426 1573 aa32.91■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 PBRM1Q86U86 1689 aa32.91■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.89■■■□□ 2.86
NOL3-211ENST00000568146 ARAP1Q96P48 1450 aa32.82■■■□□ 2.84
NOL3-211ENST00000568146 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.8■■■□□ 2.84
NOL3-211ENST00000568146 ADAMTS12P58397 1594 aa32.67■■■□□ 2.82
NOL3-211ENST00000568146 GRIN2AQ12879 1464 aa32.64■■■□□ 2.82
NOL3-211ENST00000568146 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.59■■■□□ 2.81
NOL3-211ENST00000568146 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.58■■■□□ 2.81
NOL3-211ENST00000568146 NUP160Q12769 1436 aa32.55■■■□□ 2.8
NOL3-211ENST00000568146 CEP170Q5SW79 1584 aa32.52■■■□□ 2.8
NOL3-211ENST00000568146 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.39■■■□□ 2.78
NOL3-211ENST00000568146 SHROOM2Q13796 1616 aa32.35■■■□□ 2.77
NOL3-211ENST00000568146 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
NOL3-211ENST00000568146 IGF1RP08069 1367 aa32.28■■■□□ 2.76
NOL3-211ENST00000568146 KIF27Q86VH2 1401 aa32.27■■■□□ 2.76
NOL3-211ENST00000568146 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.2■■■□□ 2.75
NOL3-211ENST00000568146 JPH4Q96JJ6 628 aa32.17■■■□□ 2.74
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