Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRTAP25-1Q3LHN0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP25-1Q3LHN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP25-1Q3LHN0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP25-1Q3LHN0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP25-1Q3LHN0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP25-1Q3LHN0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP25-1Q3LHN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KRTAP25-1Q3LHN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP25-1Q3LHN0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KRTAP25-1Q3LHN0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP25-1Q3LHN0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP25-1Q3LHN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KRTAP25-1Q3LHN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
KRTAP25-1Q3LHN0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP25-1Q3LHN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KRTAP25-1Q3LHN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP25-1Q3LHN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP25-1Q3LHN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KRTAP25-1Q3LHN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
KRTAP25-1Q3LHN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KRTAP25-1Q3LHN0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KRTAP25-1Q3LHN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KRTAP25-1Q3LHN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP25-1Q3LHN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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