Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-12■■■■■ 37.3
RPS3P23396 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 37.3
RPS3P23396 ATP5A1-212ENST00000590324 807 ntTSL 59.44□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 37.2
RPS3P23396 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 221.67■■□□□ 1.062e-26■■■■■ 37.2
RPS3P23396 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 37.2
RPS3P23396 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 37.2
RPS3P23396 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.379e-8■■■■■ 37.1
RPS3P23396 GGH-205ENST00000520609 1109 ntTSL 211.85□□□□□ -0.519e-8■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-210ENST00000533105 567 ntTSL 421.22■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 NDUFS3-208ENST00000530295 253 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 37.1
RPS3P23396 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 27.78□□□□□ -1.169e-11■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 323.06■■□□□ 1.284e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.794e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 318.75■□□□□ 0.594e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 218.75■□□□□ 0.594e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 218.67■□□□□ 0.584e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 316.38■□□□□ 0.214e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 516.38■□□□□ 0.214e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 316.2■□□□□ 0.184e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-210ENST00000581091 573 ntTSL 211.6□□□□□ -0.554e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 57.42□□□□□ -1.224e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.44e-41■■■■■ 37.1
RPS3P23396 TFR2-210ENST00000474947 1514 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 37
RPS3P23396 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 16e-7■■■■■ 37
RPS3P23396 A1BG-202ENST00000595014 2301 ntTSL 219.22■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 37
RPS3P23396 AC012313.3-201ENST00000600123 1765 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 37
RPS3P23396 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC8.8□□□□□ -18e-49■■■■■ 36.9
RPS3P23396 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 36.9
RPS3P23396 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 36.9
RPS3P23396 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 38.59□□□□□ -1.039e-13■■■■■ 36.9
RPS3P23396 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.724e-10■■■■■ 36.9
RPS3P23396 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 36.9
RPS3P23396 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 36.9
RPS3P23396 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 36.9
RPS3P23396 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 36.9
RPS3P23396 HYOU1-206ENST00000530467 552 ntTSL 419.11■□□□□ 0.651e-11■■■■■ 36.9
RPS3P23396 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-11■■■■■ 36.8
RPS3P23396 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 36.8
RPS3P23396 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 36.8
RPS3P23396 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.366e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 ARHGEF2-208ENST00000470541 1877 ntTSL 319.24■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 36.7
RPS3P23396 COX7A2-207ENST00000481061 914 ntTSL 27.12□□□□□ -1.272e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 MAGED2-208ENST00000463787 662 ntTSL 37.47□□□□□ -1.217e-7■■■■■ 36.7
RPS3P23396 DIAPH1-206ENST00000468119 619 ntTSL 410.33□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 36.7
RPS3P23396 VSNL1-202ENST00000404666 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 VSNL1-201ENST00000295156 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 HIST1H2BJ-202ENST00000606923 408 ntTSL 36.61□□□□□ -1.351e-12■■■■■ 36.7
RPS3P23396 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 36.7
RPS3P23396 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 210.01□□□□□ -0.817e-17■■■■■ 36.7
RPS3P23396 IDH1-206ENST00000451391 563 ntTSL 318.5■□□□□ 0.554e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 IDH1-204ENST00000417583 702 ntTSL 414.03□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 IDH1-208ENST00000481557 556 ntTSL 211.76□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-210ENST00000545368 619 ntTSL 312.83□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-206ENST00000536241 1490 ntTSL 511.38□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-201ENST00000229265 1047 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-208ENST00000540683 985 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-204ENST00000535406 1327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-209ENST00000544610 624 ntTSL 36.48□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 CDCA3-205ENST00000535871 454 ntTSL 56.48□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RFESD-203ENST00000458310 2788 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 36.7
RPS3P23396 PHB-213ENST00000513412 650 ntTSL 210.42□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RAE1-204ENST00000411894 588 ntTSL 59.29□□□□□ -0.926e-10■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RAE1-205ENST00000429339 480 ntTSL 59.29□□□□□ -0.926e-10■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RFESD-207ENST00000511684 615 ntTSL 38.35□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RAE1-206ENST00000452119 691 ntTSL 37.55□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 36.7
RPS3P23396 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 36.7
RPS3P23396 FDFT1-220ENST00000531733 712 ntTSL 219.97■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 36.6
RPS3P23396 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 36.6
RPS3P23396 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.795e-8■■■■■ 36.6
RPS3P23396 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 36.6
RPS3P23396 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.225e-8■■■■■ 36.6
RPS3P23396 MRFAP1L1-202ENST00000500563 2127 nt14.01□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 36.5
RPS3P23396 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 36.5
RPS3P23396 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 519.57■□□□□ 0.727e-13■■■■■ 36.4
RPS3P23396 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 225.61■■□□□ 1.697e-9■■■■■ 36.4
RPS3P23396 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 317.97■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 36.4
RPS3P23396 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 214.75□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 36.4
RPS3P23396 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.036e-15■■■■■ 36.4
RPS3P23396 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-15■■■■■ 36.4
RPS3P23396 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.046e-15■■■■■ 36.4
RPS3P23396 NDUFAB1-204ENST00000567761 520 ntTSL 35.62□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 36.4
RPS3P23396 LDHA-214ENST00000536528 516 ntTSL 36.77□□□□□ -1.338e-13■■■■■ 36.4
RPS3P23396 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 36.3
RPS3P23396 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-11■■■■■ 36.3
RPS3P23396 MRPS18A-203ENST00000427312 803 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 36.3
RPS3P23396 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.251e-7■■■■■ 36.3
RPS3P23396 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 36.2
RPS3P23396 NUP160-206ENST00000528071 4138 ntTSL 510.47□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 36.2
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