RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260118.6

GGH-201, Transcript of gamma-glutamyl hydrolase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGH, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGH-201ENST00000260118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.47■■■■■ 6.79
GGH-201ENST00000260118 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.77■■■■■ 5.72
GGH-201ENST00000260118 ABCC9O60706 1549 aa49.44■■■■■ 5.51
GGH-201ENST00000260118 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.08■■■■■ 5.29
GGH-201ENST00000260118 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
GGH-201ENST00000260118 NACADO15069 1562 aa47.66■■■■■ 5.22
GGH-201ENST00000260118 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
GGH-201ENST00000260118 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
GGH-201ENST00000260118 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.47■■■■■ 5.19
GGH-201ENST00000260118 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.56■■■■■ 5.04
GGH-201ENST00000260118 SCRIBQ14160 1630 aa46.53■■■■■ 5.04
GGH-201ENST00000260118 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.37■■■■■ 5.01
GGH-201ENST00000260118 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.21■■■■■ 4.99
GGH-201ENST00000260118 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
GGH-201ENST00000260118 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.01■■■■■ 4.8
GGH-201ENST00000260118 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
GGH-201ENST00000260118 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.8■■■■■ 4.76
GGH-201ENST00000260118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.67■■■■■ 4.74
GGH-201ENST00000260118 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
GGH-201ENST00000260118 SMARCA4P51532 1647 aa44.48■■■■■ 4.71
GGH-201ENST00000260118 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.35■■■■■ 4.69
GGH-201ENST00000260118 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.15■■■■■ 4.66
GGH-201ENST00000260118 SMARCA2P51531 1590 aa44.06■■■■■ 4.64
GGH-201ENST00000260118 NCAPD3P42695 1498 aa44.02■■■■■ 4.64
GGH-201ENST00000260118 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
GGH-201ENST00000260118 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.97■■■■■ 4.63
GGH-201ENST00000260118 WIZO95785 1651 aa43.9■■■■■ 4.62
GGH-201ENST00000260118 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
GGH-201ENST00000260118 HMGXB3Q12766 1538 aa43.79■■■■■ 4.6
GGH-201ENST00000260118 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
GGH-201ENST00000260118 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
GGH-201ENST00000260118 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.96■■■■■ 4.47
GGH-201ENST00000260118 NESP48681 1621 aa42.93■■■■■ 4.46
GGH-201ENST00000260118 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.8■■■■■ 4.44
GGH-201ENST00000260118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.75■■■■■ 4.43
GGH-201ENST00000260118 CFTRP13569 1480 aa42.63■■■■■ 4.41
GGH-201ENST00000260118 ERCC6Q03468 1493 aa42.55■■■■■ 4.4
GGH-201ENST00000260118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.49■■■■■ 4.39
GGH-201ENST00000260118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.35■■■■■ 4.37
GGH-201ENST00000260118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.32■■■■■ 4.37
GGH-201ENST00000260118 PRDM2Q13029 1718 aa42.23■■■■■ 4.35
GGH-201ENST00000260118 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.21■■■■■ 4.35
GGH-201ENST00000260118 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GGH-201ENST00000260118 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.03■■■■■ 4.32
GGH-201ENST00000260118 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
GGH-201ENST00000260118 WDR62O43379 1518 aa41.85■■■■■ 4.29
GGH-201ENST00000260118 CUX2O14529 1486 aa41.81■■■■■ 4.28
GGH-201ENST00000260118 TOPBP1Q92547 1522 aa41.68■■■■■ 4.26
GGH-201ENST00000260118 ABCC8Q09428 1581 aa41.64■■■■■ 4.26
GGH-201ENST00000260118 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.64■■■■■ 4.26
GGH-201ENST00000260118 CUX1P39880 1505 aa41.56■■■■■ 4.24
GGH-201ENST00000260118 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
GGH-201ENST00000260118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
GGH-201ENST00000260118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.36■■■■■ 4.21
GGH-201ENST00000260118 SYNJ1O43426 1573 aa41.36■■■■■ 4.21
GGH-201ENST00000260118 TOP2BQ02880 1626 aa41.28■■■■■ 4.2
GGH-201ENST00000260118 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
GGH-201ENST00000260118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.25■■■■■ 4.19
GGH-201ENST00000260118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.25■■■■■ 4.19
GGH-201ENST00000260118 SOGA1O94964 1423 aa41.24■■■■■ 4.19
GGH-201ENST00000260118 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
GGH-201ENST00000260118 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
GGH-201ENST00000260118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
GGH-201ENST00000260118 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.99■■■■■ 4.15
GGH-201ENST00000260118 TRIM41Q8WV44 630 aa40.93■■■■■ 4.14
GGH-201ENST00000260118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.93■■■■■ 4.14
GGH-201ENST00000260118 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
GGH-201ENST00000260118 WDR97A6NE52 1622 aa40.9■■■■■ 4.14
GGH-201ENST00000260118 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.75■■■■■ 4.11
GGH-201ENST00000260118 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.74■■■■■ 4.11
GGH-201ENST00000260118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.7■■■■■ 4.11
GGH-201ENST00000260118 GRIN2BQ13224 1484 aa40.65■■■■■ 4.1
GGH-201ENST00000260118 PBRM1Q86U86 1689 aa40.58■■■■■ 4.09
GGH-201ENST00000260118 KIF27Q86VH2 1401 aa40.57■■■■■ 4.09
GGH-201ENST00000260118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.56■■■■■ 4.08
GGH-201ENST00000260118 FBLN2P98095 1184 aa40.49■■■■■ 4.07
GGH-201ENST00000260118 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
GGH-201ENST00000260118 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.44■■■■■ 4.06
GGH-201ENST00000260118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.43■■■■■ 4.06
GGH-201ENST00000260118 IGF1RP08069 1367 aa40.38■■■■■ 4.05
GGH-201ENST00000260118 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
GGH-201ENST00000260118 SYNJ2O15056 1496 aa40.33■■■■■ 4.05
GGH-201ENST00000260118 CHD1O14646 1710 aa40.32■■■■■ 4.04
GGH-201ENST00000260118 OSCARQ8IYS5 282 aa40.3■■■■■ 4.04
GGH-201ENST00000260118 ADAMTS12P58397 1594 aa40.29■■■■■ 4.04
GGH-201ENST00000260118 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.28■■■■■ 4.04
GGH-201ENST00000260118 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
GGH-201ENST00000260118 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.15■■■■■ 4.02
GGH-201ENST00000260118 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
GGH-201ENST00000260118 CUL7Q14999 1698 aa40.13■■■■■ 4.02
GGH-201ENST00000260118 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.09■■■■■ 4.01
GGH-201ENST00000260118 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.05■■■■■ 4
GGH-201ENST00000260118 EEA1Q15075 1411 aa40.04■■■■■ 4
GGH-201ENST00000260118 CEP170Q5SW79 1584 aa39.93■■■■□ 3.98
GGH-201ENST00000260118 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.93■■■■□ 3.98
GGH-201ENST00000260118 NUP160Q12769 1436 aa39.92■■■■□ 3.98
GGH-201ENST00000260118 PRXQ9BXM0 1461 aa39.89■■■■□ 3.98
GGH-201ENST00000260118 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.86■■■■□ 3.97
GGH-201ENST00000260118 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.71■■■■□ 3.95
GGH-201ENST00000260118 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms