RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525334.5

TSPAN4-215, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN4, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-215ENST00000525334 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.4■■■■■ 4.86
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TSPAN4-215ENST00000525334 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.33■■■■□ 3.57
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TSPAN4-215ENST00000525334 SCRIBQ14160 1630 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPAN4-215ENST00000525334 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
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TSPAN4-215ENST00000525334 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.99■■■■□ 3.35
TSPAN4-215ENST00000525334 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.79■■■■□ 3.32
TSPAN4-215ENST00000525334 SMARCA4P51532 1647 aa35.28■■■■□ 3.24
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TSPAN4-215ENST00000525334 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.13■■■■□ 3.21
TSPAN4-215ENST00000525334 SMARCA2P51531 1590 aa35.08■■■■□ 3.21
TSPAN4-215ENST00000525334 MROH2BQ7Z745 1585 aa35■■■■□ 3.19
TSPAN4-215ENST00000525334 HMGXB3Q12766 1538 aa34.96■■■■□ 3.19
TSPAN4-215ENST00000525334 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.94■■■■□ 3.18
TSPAN4-215ENST00000525334 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
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TSPAN4-215ENST00000525334 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
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TSPAN4-215ENST00000525334 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPAN4-215ENST00000525334 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
TSPAN4-215ENST00000525334 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.09■■■■□ 3.05
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TSPAN4-215ENST00000525334 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPAN4-215ENST00000525334 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.98■■■■□ 3.03
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TSPAN4-215ENST00000525334 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.69■■■□□ 2.98
TSPAN4-215ENST00000525334 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.65■■■□□ 2.98
TSPAN4-215ENST00000525334 WDR62O43379 1518 aa33.6■■■□□ 2.97
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TSPAN4-215ENST00000525334 ABCC8Q09428 1581 aa33.11■■■□□ 2.89
TSPAN4-215ENST00000525334 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.11■■■□□ 2.89
TSPAN4-215ENST00000525334 IFT140Q96RY7 1462 aa33■■■□□ 2.87
TSPAN4-215ENST00000525334 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
TSPAN4-215ENST00000525334 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
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TSPAN4-215ENST00000525334 WDR97A6NE52 1622 aa32.54■■■□□ 2.8
TSPAN4-215ENST00000525334 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.51■■■□□ 2.79
TSPAN4-215ENST00000525334 SYNJ1O43426 1573 aa32.5■■■□□ 2.79
TSPAN4-215ENST00000525334 TOP2BQ02880 1626 aa32.5■■■□□ 2.79
TSPAN4-215ENST00000525334 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.43■■■□□ 2.78
TSPAN4-215ENST00000525334 CHD1O14646 1710 aa32.38■■■□□ 2.77
TSPAN4-215ENST00000525334 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPAN4-215ENST00000525334 GRIN2BQ13224 1484 aa32.36■■■□□ 2.77
TSPAN4-215ENST00000525334 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.34■■■□□ 2.77
TSPAN4-215ENST00000525334 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.33■■■□□ 2.77
TSPAN4-215ENST00000525334 TRIM41Q8WV44 630 aa32.31■■■□□ 2.76
TSPAN4-215ENST00000525334 PBRM1Q86U86 1689 aa32.31■■■□□ 2.76
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TSPAN4-215ENST00000525334 ARHGEF11O15085 1522 aa32.06■■■□□ 2.72
TSPAN4-215ENST00000525334 ADAMTS12P58397 1594 aa32.05■■■□□ 2.72
TSPAN4-215ENST00000525334 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.03■■■□□ 2.72
TSPAN4-215ENST00000525334 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.03■■■□□ 2.72
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TSPAN4-215ENST00000525334 SHROOM2Q13796 1616 aa31.62■■■□□ 2.65
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TSPAN4-215ENST00000525334 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.56■■■□□ 2.64
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