Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DNAJC17-209ENST00000561018 880 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-214ENST00000607954 1005 ntTSL 511.2□□□□□ -0.623e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PTPN18-212ENST00000483617 595 ntTSL 311.05□□□□□ -0.642e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TKFC-218ENST00000533853 460 ntTSL 310.83□□□□□ -0.681e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-213ENST00000476777 769 ntTSL 510.51□□□□□ -0.732e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-222ENST00000493919 1948 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-208ENST00000404276 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-209ENST00000405598 1959 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-219ENST00000448511 1532 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BZW1-206ENST00000447069 557 ntTSL 49.87□□□□□ -0.831e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-215ENST00000434810 984 ntTSL 39.43□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-221ENST00000456369 588 ntTSL 39.43□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 39.17□□□□□ -0.943e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-211ENST00000417588 1551 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-214ENST00000433728 1580 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-219ENST00000491747 2379 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 28.74□□□□□ -1.013e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-205ENST00000461221 5693 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.022e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRPF3-207ENST00000454960 582 ntTSL 38.62□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-226ENST00000591534 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-207ENST00000461798 582 ntTSL 38.52□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.073e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-206ENST00000402731 1545 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.24□□□□□ -1.093e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 57.98□□□□□ -1.133e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.161e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-224ENST00000497488 779 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.212e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.232e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-230ENST00000634433 2534 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 27.03□□□□□ -1.283e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-214ENST00000477152 1980 ntTSL 1 (best)6.63□□□□□ -1.352e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-215ENST00000478531 1972 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.362e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 YAP1-205ENST00000526594 785 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRPF3-205ENST00000446974 414 ntTSL 36.08□□□□□ -1.442e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 56.06□□□□□ -1.443e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.482e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 ADGRA3-211ENST00000513385 538 ntTSL 45.57□□□□□ -1.522e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 25.47□□□□□ -1.533e-22■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.542e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-220ENST00000492859 1584 ntTSL 1 (best)4.61□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.762e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.062e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.942e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 414.88□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD1A-206ENST00000588459 576 ntTSL 412.84□□□□□ -0.352e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 MTA3-210ENST00000461256 553 ntTSL 511.66□□□□□ -0.544e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 MTA3-216ENST00000484780 563 ntTSL 49.55□□□□□ -0.884e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.115e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TCF7L2-213ENST00000471569 330 ntTSL 510.28□□□□□ -0.766e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.619e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.599e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TCF25-213ENST00000564957 459 ntTSL 318.19■□□□□ 0.54e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.269e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.069e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 LY6G5B-209ENST00000471088 677 ntTSL 511.76□□□□□ -0.531e-16■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.622e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.669e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 510.74□□□□□ -0.699e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 KXD1-216ENST00000601630 1327 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.779e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IL22RA1-201ENST00000270800 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.835e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.012e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.022e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.082e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.352e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 56.35□□□□□ -1.391e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 511.61□□□□□ -0.554e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.844e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 513.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DENND4B-212ENST00000494683 456 ntTSL 312.98□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 216.87■□□□□ 0.293e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.243e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 17.1
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 301.3 ms