Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-211ENST00000530749 2558 ntTSL 221.41■■□□□ 1.027e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 17e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.897e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.877e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.851e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GPAA1-218ENST00000534072 1090 ntTSL 219.81■□□□□ 0.767e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.757e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GPAA1-212ENST00000529638 1570 ntTSL 518.84■□□□□ 0.617e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 517.7■□□□□ 0.427e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-210ENST00000477529 540 ntTSL 215.3■□□□□ 0.047e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.081e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 214.49□□□□□ -0.094e-10■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 314.38□□□□□ -0.114e-10■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.127e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 DNPH1-203ENST00000505042 396 ntTSL 214.1□□□□□ -0.157e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GPAA1-215ENST00000530796 936 ntTSL 313.76□□□□□ -0.217e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-206ENST00000437136 876 ntTSL 513.57□□□□□ -0.241e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-216ENST00000492468 2257 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-213ENST00000482028 633 ntTSL 213.28□□□□□ -0.281e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-14■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.477e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.477e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-213ENST00000611405 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.517e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-14■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.535e-14■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 GRIPAP1-212ENST00000619149 2828 ntTSL 211.63□□□□□ -0.555e-14■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC4-209ENST00000468476 3592 ntTSL 28.72□□□□□ -1.011e-7■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRRT-203ENST00000445337 446 ntTSL 36.57□□□□□ -1.367e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-203ENST00000527537 3403 ntTSL 1 (best)6.06□□□□□ -1.447e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RDX-213ENST00000532461 3286 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.57e-8■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.681e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.781e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.851e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.871e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 33.11□□□□□ -1.911e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-204ENST00000517691 2033 ntTSL 1 (best)2.89□□□□□ -1.951e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.031e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.861e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 514.27□□□□□ -0.131e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-208ENST00000530913 805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.221e-32■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 223.78■■□□□ 1.44e-8■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.733e-8■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.831e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 ARPC3-203ENST00000467622 1098 ntTSL 59.64□□□□□ -0.873e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 519.8■□□□□ 0.763e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 314.9□□□□□ -0.023e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.8
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.763e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 214.79□□□□□ -0.043e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-73■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-7■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.645e-14■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.135e-14■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 514.28□□□□□ -0.126e-82■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-82■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-204ENST00000570671 740 ntTSL 211.37□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 MYL4-209ENST00000573747 640 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-7■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.963e-9■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 TSR3-202ENST00000566296 649 ntTSL 318.34■□□□□ 0.533e-9■■□□□ 12.7
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.094e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-207ENST00000556831 729 ntTSL 215.35■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.224e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 26.92□□□□□ -1.34e-7■■□□□ 12.6
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-9■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-9■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 317.09■□□□□ 0.332e-9■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.122e-9■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-11■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.082e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 221.2■□□□□ 0.982e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 318.96■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 12.5
APOBEC3CQ9NRW3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 12.5
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