RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007390.2

TSR3-201, Transcript of TSR3, acp transferase ribosome maturation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSR3, Length 1,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3-201ENST00000007390 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.43■■■■■ 7.43
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TSR3-201ENST00000007390 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.81■■■■■ 5.88
TSR3-201ENST00000007390 NACADO15069 1562 aa51.66■■■■■ 5.86
TSR3-201ENST00000007390 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.36■■■■■ 5.81
TSR3-201ENST00000007390 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.28■■■■■ 5.8
TSR3-201ENST00000007390 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.1■■■■■ 5.77
TSR3-201ENST00000007390 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.87■■■■■ 5.73
TSR3-201ENST00000007390 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.56■■■■■ 5.68
TSR3-201ENST00000007390 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.37■■■■■ 5.65
TSR3-201ENST00000007390 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.26■■■■■ 5.64
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TSR3-201ENST00000007390 SCRIBQ14160 1630 aa49.93■■■■■ 5.58
TSR3-201ENST00000007390 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.79■■■■■ 5.56
TSR3-201ENST00000007390 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
TSR3-201ENST00000007390 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.86■■■■■ 5.41
TSR3-201ENST00000007390 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.61■■■■■ 5.37
TSR3-201ENST00000007390 SMARCA4P51532 1647 aa47.75■■■■■ 5.23
TSR3-201ENST00000007390 NCAPD3P42695 1498 aa47.69■■■■■ 5.22
TSR3-201ENST00000007390 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
TSR3-201ENST00000007390 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.63■■■■■ 5.22
TSR3-201ENST00000007390 SMARCA2P51531 1590 aa47.55■■■■■ 5.2
TSR3-201ENST00000007390 HMGXB3Q12766 1538 aa47.42■■■■■ 5.18
TSR3-201ENST00000007390 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.35■■■■■ 5.17
TSR3-201ENST00000007390 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.32■■■■■ 5.17
TSR3-201ENST00000007390 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
TSR3-201ENST00000007390 WIZO95785 1651 aa46.74■■■■■ 5.07
TSR3-201ENST00000007390 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
TSR3-201ENST00000007390 NESP48681 1621 aa46.61■■■■■ 5.05
TSR3-201ENST00000007390 ERCC6Q03468 1493 aa46.6■■■■■ 5.05
TSR3-201ENST00000007390 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.49■■■■■ 5.03
TSR3-201ENST00000007390 CUX2O14529 1486 aa46.33■■■■■ 5.01
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TSR3-201ENST00000007390 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.25■■■■■ 4.99
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TSR3-201ENST00000007390 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
TSR3-201ENST00000007390 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.03■■■■■ 4.96
TSR3-201ENST00000007390 CFTRP13569 1480 aa45.9■■■■■ 4.94
TSR3-201ENST00000007390 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.74■■■■■ 4.91
TSR3-201ENST00000007390 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.72■■■■■ 4.91
TSR3-201ENST00000007390 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.71■■■■■ 4.91
TSR3-201ENST00000007390 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.7■■■■■ 4.91
TSR3-201ENST00000007390 WDR62O43379 1518 aa45.62■■■■■ 4.89
TSR3-201ENST00000007390 PRDM2Q13029 1718 aa45.46■■■■■ 4.87
TSR3-201ENST00000007390 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.41■■■■■ 4.86
TSR3-201ENST00000007390 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
TSR3-201ENST00000007390 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
TSR3-201ENST00000007390 TOPBP1Q92547 1522 aa44.93■■■■■ 4.78
TSR3-201ENST00000007390 ABCC8Q09428 1581 aa44.93■■■■■ 4.78
TSR3-201ENST00000007390 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.85■■■■■ 4.77
TSR3-201ENST00000007390 IFT140Q96RY7 1462 aa44.78■■■■■ 4.76
TSR3-201ENST00000007390 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
TSR3-201ENST00000007390 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
TSR3-201ENST00000007390 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
TSR3-201ENST00000007390 CUX1P39880 1505 aa44.42■■■■■ 4.7
TSR3-201ENST00000007390 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
TSR3-201ENST00000007390 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.34■■■■■ 4.69
TSR3-201ENST00000007390 SOGA1O94964 1423 aa44.32■■■■■ 4.68
TSR3-201ENST00000007390 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.3■■■■■ 4.68
TSR3-201ENST00000007390 OSCARQ8IYS5 282 aa44.28■■■■■ 4.68
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TSR3-201ENST00000007390 WDR97A6NE52 1622 aa44.15■■■■■ 4.66
TSR3-201ENST00000007390 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
TSR3-201ENST00000007390 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.98■■■■■ 4.63
TSR3-201ENST00000007390 TOP2BQ02880 1626 aa43.93■■■■■ 4.62
TSR3-201ENST00000007390 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.92■■■■■ 4.62
TSR3-201ENST00000007390 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.92■■■■■ 4.62
TSR3-201ENST00000007390 GRIN2BQ13224 1484 aa43.88■■■■■ 4.61
TSR3-201ENST00000007390 SYNJ1O43426 1573 aa43.88■■■■■ 4.61
TSR3-201ENST00000007390 CHD1O14646 1710 aa43.87■■■■■ 4.61
TSR3-201ENST00000007390 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.86■■■■■ 4.61
TSR3-201ENST00000007390 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
TSR3-201ENST00000007390 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.8■■■■■ 4.6
TSR3-201ENST00000007390 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.77■■■■■ 4.6
TSR3-201ENST00000007390 FBLN2P98095 1184 aa43.76■■■■■ 4.6
TSR3-201ENST00000007390 PBRM1Q86U86 1689 aa43.7■■■■■ 4.59
TSR3-201ENST00000007390 SYNJ2O15056 1496 aa43.65■■■■■ 4.58
TSR3-201ENST00000007390 TRIM41Q8WV44 630 aa43.63■■■■■ 4.57
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TSR3-201ENST00000007390 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.62■■■■■ 4.57
TSR3-201ENST00000007390 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.62■■■■■ 4.57
TSR3-201ENST00000007390 ARHGEF11O15085 1522 aa43.59■■■■■ 4.57
TSR3-201ENST00000007390 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.48■■■■■ 4.55
TSR3-201ENST00000007390 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.39■■■■■ 4.54
TSR3-201ENST00000007390 ADAMTS12P58397 1594 aa43.38■■■■■ 4.54
TSR3-201ENST00000007390 GRIN2AQ12879 1464 aa43.31■■■■■ 4.52
TSR3-201ENST00000007390 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.31■■■■■ 4.52
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TSR3-201ENST00000007390 NUP160Q12769 1436 aa43.16■■■■■ 4.5
TSR3-201ENST00000007390 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.15■■■■■ 4.5
TSR3-201ENST00000007390 CEP170Q5SW79 1584 aa43.1■■■■■ 4.49
TSR3-201ENST00000007390 KIF27Q86VH2 1401 aa43.09■■■■■ 4.49
TSR3-201ENST00000007390 IGF1RP08069 1367 aa42.98■■■■■ 4.47
TSR3-201ENST00000007390 CUL7Q14999 1698 aa42.89■■■■■ 4.46
TSR3-201ENST00000007390 SHROOM2Q13796 1616 aa42.87■■■■■ 4.45
TSR3-201ENST00000007390 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.78■■■■■ 4.44
TSR3-201ENST00000007390 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.76■■■■■ 4.44
TSR3-201ENST00000007390 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.69■■■■■ 4.42
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