RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.73■■■■□ 3.15
SRRT-210ENST00000477529 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.18■■■□□ 2.58
SRRT-210ENST00000477529 ABCC9O60706 1549 aa30.22■■■□□ 2.43
SRRT-210ENST00000477529 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.18■■■□□ 2.26
SRRT-210ENST00000477529 NACADO15069 1562 aa29.11■■■□□ 2.25
SRRT-210ENST00000477529 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SRRT-210ENST00000477529 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.96■■■□□ 2.23
SRRT-210ENST00000477529 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.89■■■□□ 2.21
SRRT-210ENST00000477529 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.77■■■□□ 2.2
SRRT-210ENST00000477529 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.69■■■□□ 2.18
SRRT-210ENST00000477529 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.37■■■□□ 2.13
SRRT-210ENST00000477529 SCRIBQ14160 1630 aa28.3■■■□□ 2.12
SRRT-210ENST00000477529 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.084e-8■■■□□ 15.8
SRRT-210ENST00000477529 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.96■■■□□ 2.07
SRRT-210ENST00000477529 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.62■■■□□ 2.01
SRRT-210ENST00000477529 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SRRT-210ENST00000477529 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.5■■□□□ 1.99
SRRT-210ENST00000477529 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.13■■□□□ 1.93
SRRT-210ENST00000477529 SMARCA4P51532 1647 aa27.09■■□□□ 1.93
SRRT-210ENST00000477529 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SRRT-210ENST00000477529 SMARCA2P51531 1590 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-210ENST00000477529 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.81■■□□□ 1.88
SRRT-210ENST00000477529 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.77■■□□□ 1.88
SRRT-210ENST00000477529 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.77■■□□□ 1.88
SRRT-210ENST00000477529 HMGXB3Q12766 1538 aa26.76■■□□□ 1.87
SRRT-210ENST00000477529 NCAPD3P42695 1498 aa26.73■■□□□ 1.87
SRRT-210ENST00000477529 WIZO95785 1651 aa26.63■■□□□ 1.85
SRRT-210ENST00000477529 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SRRT-210ENST00000477529 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SRRT-210ENST00000477529 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SRRT-210ENST00000477529 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.2■■□□□ 1.79
SRRT-210ENST00000477529 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.19■■□□□ 1.78
SRRT-210ENST00000477529 NESP48681 1621 aa26.18■■□□□ 1.78
SRRT-210ENST00000477529 PRDM2Q13029 1718 aa26.18■■□□□ 1.78
SRRT-210ENST00000477529 ERCC6Q03468 1493 aa26.02■■□□□ 1.76
SRRT-210ENST00000477529 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SRRT-210ENST00000477529 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.88■■□□□ 1.73
SRRT-210ENST00000477529 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.82■■□□□ 1.72
SRRT-210ENST00000477529 CUX2O14529 1486 aa25.82■■□□□ 1.72
SRRT-210ENST00000477529 CFTRP13569 1480 aa25.81■■□□□ 1.72
SRRT-210ENST00000477529 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.8■■□□□ 1.72
SRRT-210ENST00000477529 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.69■■□□□ 1.7
SRRT-210ENST00000477529 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.68■■□□□ 1.7
SRRT-210ENST00000477529 WDR62O43379 1518 aa25.68■■□□□ 1.7
SRRT-210ENST00000477529 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
SRRT-210ENST00000477529 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SRRT-210ENST00000477529 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SRRT-210ENST00000477529 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.36■■□□□ 1.65
SRRT-210ENST00000477529 TOPBP1Q92547 1522 aa25.32■■□□□ 1.64
SRRT-210ENST00000477529 ABCC8Q09428 1581 aa25.26■■□□□ 1.63
SRRT-210ENST00000477529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SRRT-210ENST00000477529 WDR97A6NE52 1622 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-210ENST00000477529 CUX1P39880 1505 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-210ENST00000477529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SRRT-210ENST00000477529 IFT140Q96RY7 1462 aa25.1■■□□□ 1.61
SRRT-210ENST00000477529 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-210ENST00000477529 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SRRT-210ENST00000477529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SRRT-210ENST00000477529 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.02■■□□□ 1.6
SRRT-210ENST00000477529 PBRM1Q86U86 1689 aa24.98■■□□□ 1.59
SRRT-210ENST00000477529 TOP2BQ02880 1626 aa24.98■■□□□ 1.59
SRRT-210ENST00000477529 SYNJ1O43426 1573 aa24.98■■□□□ 1.59
SRRT-210ENST00000477529 CHD1O14646 1710 aa24.98■■□□□ 1.59
SRRT-210ENST00000477529 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.93■■□□□ 1.58
SRRT-210ENST00000477529 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.88■■□□□ 1.57
SRRT-210ENST00000477529 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.86■■□□□ 1.57
SRRT-210ENST00000477529 SOGA1O94964 1423 aa24.85■■□□□ 1.57
SRRT-210ENST00000477529 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
SRRT-210ENST00000477529 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.569e-37■■■■■ 34.1
SRRT-210ENST00000477529 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.77■■□□□ 1.56
SRRT-210ENST00000477529 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SRRT-210ENST00000477529 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.65■■□□□ 1.54
SRRT-210ENST00000477529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.65■■□□□ 1.54
SRRT-210ENST00000477529 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.53
SRRT-210ENST00000477529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SRRT-210ENST00000477529 ADAMTS12P58397 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
SRRT-210ENST00000477529 SYNJ2O15056 1496 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 OSCARQ8IYS5 282 aa24.51■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.47■■□□□ 1.51
SRRT-210ENST00000477529 CUL7Q14999 1698 aa24.43■■□□□ 1.5
SRRT-210ENST00000477529 GRIN2AQ12879 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
SRRT-210ENST00000477529 ARHGEF11O15085 1522 aa24.38■■□□□ 1.49
SRRT-210ENST00000477529 CEP170Q5SW79 1584 aa24.37■■□□□ 1.49
SRRT-210ENST00000477529 FBLN2P98095 1184 aa24.36■■□□□ 1.49
SRRT-210ENST00000477529 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
SRRT-210ENST00000477529 KIF27Q86VH2 1401 aa24.3■■□□□ 1.48
SRRT-210ENST00000477529 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SRRT-210ENST00000477529 SHROOM2Q13796 1616 aa24.28■■□□□ 1.48
SRRT-210ENST00000477529 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.25■■□□□ 1.47
SRRT-210ENST00000477529 NUP160Q12769 1436 aa24.25■■□□□ 1.47
SRRT-210ENST00000477529 ARAP1Q96P48 1450 aa24.16■■□□□ 1.46
SRRT-210ENST00000477529 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.15■■□□□ 1.46
SRRT-210ENST00000477529 IGF1RP08069 1367 aa24.14■■□□□ 1.45
SRRT-210ENST00000477529 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.12■■□□□ 1.45
SRRT-210ENST00000477529 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
SRRT-210ENST00000477529 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.01■■□□□ 1.43
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