RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393747.3

CTTN-204, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 5

Gene CTTN, Length 1,315 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-204ENST00000393747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.96■■■■■ 4.79
CTTN-204ENST00000393747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.14■■■■■ 4.02
CTTN-204ENST00000393747 ABCC9O60706 1549 aa40.01■■■■■ 4
CTTN-204ENST00000393747 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.12■■■■□ 3.69
CTTN-204ENST00000393747 NACADO15069 1562 aa37.94■■■■□ 3.66
CTTN-204ENST00000393747 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.76■■■■□ 3.64
CTTN-204ENST00000393747 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.55■■■■□ 3.6
CTTN-204ENST00000393747 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.4■■■■□ 3.58
CTTN-204ENST00000393747 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CTTN-204ENST00000393747 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.56
CTTN-204ENST00000393747 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.22■■■■□ 3.55
CTTN-204ENST00000393747 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.15■■■■□ 3.54
CTTN-204ENST00000393747 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.09■■■■□ 3.53
CTTN-204ENST00000393747 SCRIBQ14160 1630 aa36.66■■■■□ 3.46
CTTN-204ENST00000393747 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.57■■■■□ 3.45
CTTN-204ENST00000393747 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CTTN-204ENST00000393747 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.12■■■■□ 3.37
CTTN-204ENST00000393747 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.01■■■■□ 3.35
CTTN-204ENST00000393747 NCAPD3P42695 1498 aa35.08■■■■□ 3.21
CTTN-204ENST00000393747 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.03■■■■□ 3.2
CTTN-204ENST00000393747 SMARCA4P51532 1647 aa34.99■■■■□ 3.19
CTTN-204ENST00000393747 SMARCA2P51531 1590 aa34.86■■■■□ 3.17
CTTN-204ENST00000393747 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CTTN-204ENST00000393747 HMGXB3Q12766 1538 aa34.81■■■■□ 3.16
CTTN-204ENST00000393747 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.68■■■■□ 3.14
CTTN-204ENST00000393747 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.68■■■■□ 3.14
CTTN-204ENST00000393747 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CTTN-204ENST00000393747 ERCC6Q03468 1493 aa34.47■■■■□ 3.11
CTTN-204ENST00000393747 NESP48681 1621 aa34.47■■■■□ 3.11
CTTN-204ENST00000393747 CUX2O14529 1486 aa34.35■■■■□ 3.09
CTTN-204ENST00000393747 WIZO95785 1651 aa34.21■■■■□ 3.07
CTTN-204ENST00000393747 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.18■■■■□ 3.06
CTTN-204ENST00000393747 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.08■■■■□ 3.05
CTTN-204ENST00000393747 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
CTTN-204ENST00000393747 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CTTN-204ENST00000393747 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.02■■■■□ 3.04
CTTN-204ENST00000393747 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.99■■■■□ 3.03
CTTN-204ENST00000393747 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.92■■■■□ 3.02
CTTN-204ENST00000393747 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
CTTN-204ENST00000393747 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.71■■■□□ 2.99
CTTN-204ENST00000393747 CFTRP13569 1480 aa33.7■■■□□ 2.98
CTTN-204ENST00000393747 WDR62O43379 1518 aa33.64■■■□□ 2.98
CTTN-204ENST00000393747 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.62■■■□□ 2.97
CTTN-204ENST00000393747 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.61■■■□□ 2.97
CTTN-204ENST00000393747 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.45■■■□□ 2.95
CTTN-204ENST00000393747 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
CTTN-204ENST00000393747 PRDM2Q13029 1718 aa33.2■■■□□ 2.91
CTTN-204ENST00000393747 TOPBP1Q92547 1522 aa33.02■■■□□ 2.88
CTTN-204ENST00000393747 IFT140Q96RY7 1462 aa32.94■■■□□ 2.86
CTTN-204ENST00000393747 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
CTTN-204ENST00000393747 ABCC8Q09428 1581 aa32.89■■■□□ 2.86
CTTN-204ENST00000393747 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.89■■■□□ 2.86
CTTN-204ENST00000393747 OSCARQ8IYS5 282 aa32.8■■■□□ 2.84
CTTN-204ENST00000393747 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
CTTN-204ENST00000393747 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
CTTN-204ENST00000393747 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
CTTN-204ENST00000393747 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
CTTN-204ENST00000393747 TRIM41Q8WV44 630 aa32.64■■■□□ 2.82
CTTN-204ENST00000393747 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.63■■■□□ 2.816e-8■■■■■ 32.8
CTTN-204ENST00000393747 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.6■■■□□ 2.81
CTTN-204ENST00000393747 CUX1P39880 1505 aa32.57■■■□□ 2.8
CTTN-204ENST00000393747 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.53■■■□□ 2.8
CTTN-204ENST00000393747 SOGA1O94964 1423 aa32.53■■■□□ 2.8
CTTN-204ENST00000393747 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
CTTN-204ENST00000393747 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
CTTN-204ENST00000393747 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
CTTN-204ENST00000393747 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
CTTN-204ENST00000393747 CHD1O14646 1710 aa32.33■■■□□ 2.77
CTTN-204ENST00000393747 ARHGEF11O15085 1522 aa32.33■■■□□ 2.77
CTTN-204ENST00000393747 WDR97A6NE52 1622 aa32.32■■■□□ 2.76
CTTN-204ENST00000393747 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.3■■■□□ 2.76
CTTN-204ENST00000393747 FBLN2P98095 1184 aa32.28■■■□□ 2.76
CTTN-204ENST00000393747 GRIN2BQ13224 1484 aa32.22■■■□□ 2.75
CTTN-204ENST00000393747 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
CTTN-204ENST00000393747 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.18■■■□□ 2.74
CTTN-204ENST00000393747 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.14■■■□□ 2.74
CTTN-204ENST00000393747 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CTTN-204ENST00000393747 SYNJ2O15056 1496 aa32.09■■■□□ 2.73
CTTN-204ENST00000393747 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.73
CTTN-204ENST00000393747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.09■■■□□ 2.73
CTTN-204ENST00000393747 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.08■■■□□ 2.73
CTTN-204ENST00000393747 SYNJ1O43426 1573 aa32.06■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 ARAP1Q96P48 1450 aa32.06■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 TOP2BQ02880 1626 aa32.05■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.04■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.03■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 PBRM1Q86U86 1689 aa32.03■■■□□ 2.72
CTTN-204ENST00000393747 ADAMTS12P58397 1594 aa31.84■■■□□ 2.69
CTTN-204ENST00000393747 GRIN2AQ12879 1464 aa31.82■■■□□ 2.69
CTTN-204ENST00000393747 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.75■■■□□ 2.67
CTTN-204ENST00000393747 NUP160Q12769 1436 aa31.75■■■□□ 2.67
CTTN-204ENST00000393747 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.75■■■□□ 2.67
CTTN-204ENST00000393747 CEP170Q5SW79 1584 aa31.7■■■□□ 2.67
CTTN-204ENST00000393747 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.62■■■□□ 2.65
CTTN-204ENST00000393747 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CTTN-204ENST00000393747 SHROOM2Q13796 1616 aa31.52■■■□□ 2.64
CTTN-204ENST00000393747 IGF1RP08069 1367 aa31.46■■■□□ 2.63
CTTN-204ENST00000393747 KIF27Q86VH2 1401 aa31.43■■■□□ 2.62
CTTN-204ENST00000393747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.38■■■□□ 2.61
CTTN-204ENST00000393747 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms