Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 LAP3-204ENST00000507960 435 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-8■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.724e-7■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.442e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-210ENST00000561440 1922 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.082e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-206ENST00000560612 1877 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-208ENST00000561068 522 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 34.5□□□□□ -1.692e-14■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.774e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.724e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.494e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.454e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.094e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 514.87□□□□□ -0.034e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■■□□□ 12.8
GRSF1Q12849 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.12e-7■■□□□ 12.7
GRSF1Q12849 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■□□□ 12.7
GRSF1Q12849 CPOX-205ENST00000515041 1030 ntTSL 225.61■■□□□ 1.694e-10■■□□□ 12.7
GRSF1Q12849 CPOX-204ENST00000513674 826 ntTSL 524.46■■□□□ 1.514e-10■■□□□ 12.7
GRSF1Q12849 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-10■■□□□ 12.7
GRSF1Q12849 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.664e-6■■□□□ 12.6
GRSF1Q12849 SNX27-202ENST00000368841 7070 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 12.6
GRSF1Q12849 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.454e-6■■□□□ 12.6
GRSF1Q12849 HNRNPD-205ENST00000507010 748 ntTSL 326.47■■□□□ 1.833e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 224.95■■□□□ 1.583e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 524.27■■□□□ 1.483e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.453e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.243e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-207ENST00000509107 583 ntTSL 521.96■■□□□ 1.113e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 HNRNPD-212ENST00000515432 545 ntTSL 58.11□□□□□ -1.113e-9■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.443e-11■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.743e-11■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.482e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-231ENST00000591097 1507 ntTSL 1 (best)24.29■■□□□ 1.482e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 322.96■■□□□ 1.272e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.222e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-224ENST00000589686 532 ntTSL 222.17■■□□□ 1.142e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-226ENST00000590171 905 ntTSL 321.79■■□□□ 1.082e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-234ENST00000591659 587 ntTSL 221.79■■□□□ 1.082e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.082e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-229ENST00000590704 1456 ntTSL 221.74■■□□□ 1.072e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-208ENST00000586548 1734 ntTSL 321.63■■□□□ 1.052e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.922e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.782e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-238ENST00000592412 532 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 319.62■□□□□ 0.732e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 219.62■□□□□ 0.732e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-243ENST00000593128 796 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-244ENST00000593283 758 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 518.22■□□□□ 0.512e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-241ENST00000593048 650 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-230ENST00000591055 928 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 216.63■□□□□ 0.252e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 215.24■□□□□ 0.032e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 CIRBP-218ENST00000588344 370 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 GRB2-207ENST00000577711 555 ntTSL 221.63■■□□□ 1.055e-12■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-12■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-12■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.095e-12■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.492e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.662e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.612e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 519.5■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 216.93■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -12e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.482e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 SLC1A2-205ENST00000464522 607 ntTSL 35.82□□□□□ -1.482e-8■■□□□ 12.5
GRSF1Q12849 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 219.32■□□□□ 0.687e-18■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.141e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-211ENST00000569248 1853 ntTSL 528.34■■■□□ 2.132e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.972e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-209ENST00000567173 743 ntTSL 326.77■■□□□ 1.882e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.842e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 STUB1-202ENST00000563505 894 ntTSL 225.64■■□□□ 1.72e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.242e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 322.29■■□□□ 1.162e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.112e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 CDKN1A-205ENST00000459970 604 ntTSL 519.17■□□□□ 0.662e-6■■□□□ 12.4
GRSF1Q12849 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 12.4
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