RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513674.1

CPOX-204, Transcript of coproporphyrinogen oxidase, humanhuman

TSL 5

Gene CPOX, Length 826 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOX-204ENST00000513674 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.35■■■■■ 6.77
CPOX-204ENST00000513674 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.33■■■■■ 5.81
CPOX-204ENST00000513674 ABCC9O60706 1549 aa50.65■■■■■ 5.7
CPOX-204ENST00000513674 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.51■■■■■ 5.36
CPOX-204ENST00000513674 NACADO15069 1562 aa48.33■■■■■ 5.33
CPOX-204ENST00000513674 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.92■■■■■ 5.26
CPOX-204ENST00000513674 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.88■■■■■ 5.26
CPOX-204ENST00000513674 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
CPOX-204ENST00000513674 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.53■■■■■ 5.2
CPOX-204ENST00000513674 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
CPOX-204ENST00000513674 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.15■■■■■ 5.14
CPOX-204ENST00000513674 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.14■■■■■ 5.14
CPOX-204ENST00000513674 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.99■■■■■ 5.11
CPOX-204ENST00000513674 SCRIBQ14160 1630 aa46.72■■■■■ 5.07
CPOX-204ENST00000513674 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.57■■■■■ 5.04
CPOX-204ENST00000513674 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
CPOX-204ENST00000513674 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.85■■■■■ 4.93
CPOX-204ENST00000513674 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
CPOX-204ENST00000513674 SMARCA4P51532 1647 aa44.66■■■■■ 4.74
CPOX-204ENST00000513674 NCAPD3P42695 1498 aa44.58■■■■■ 4.73
CPOX-204ENST00000513674 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.52■■■■■ 4.72
CPOX-204ENST00000513674 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
CPOX-204ENST00000513674 SMARCA2P51531 1590 aa44.44■■■■■ 4.71
CPOX-204ENST00000513674 HMGXB3Q12766 1538 aa44.36■■■■■ 4.69
CPOX-204ENST00000513674 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.26■■■■■ 4.68
CPOX-204ENST00000513674 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.19■■■■■ 4.66
CPOX-204ENST00000513674 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
CPOX-204ENST00000513674 WIZO95785 1651 aa43.72■■■■■ 4.59
CPOX-204ENST00000513674 NESP48681 1621 aa43.69■■■■■ 4.58
CPOX-204ENST00000513674 ERCC6Q03468 1493 aa43.67■■■■■ 4.58
CPOX-204ENST00000513674 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.53■■■■■ 4.56
CPOX-204ENST00000513674 CUX2O14529 1486 aa43.48■■■■■ 4.55
CPOX-204ENST00000513674 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
CPOX-204ENST00000513674 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
CPOX-204ENST00000513674 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.24■■■■■ 4.51
CPOX-204ENST00000513674 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
CPOX-204ENST00000513674 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.2■■■■■ 4.51
CPOX-204ENST00000513674 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.16■■■■■ 4.5
CPOX-204ENST00000513674 CFTRP13569 1480 aa42.87■■■■■ 4.45
CPOX-204ENST00000513674 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.81■■■■■ 4.44
CPOX-204ENST00000513674 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
CPOX-204ENST00000513674 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.74■■■■■ 4.43
CPOX-204ENST00000513674 WDR62O43379 1518 aa42.74■■■■■ 4.43
CPOX-204ENST00000513674 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.74■■■■■ 4.43
CPOX-204ENST00000513674 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.65■■■■■ 4.42
CPOX-204ENST00000513674 PRDM2Q13029 1718 aa42.63■■■■■ 4.41
CPOX-204ENST00000513674 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
CPOX-204ENST00000513674 TOPBP1Q92547 1522 aa42.01■■■■■ 4.32
CPOX-204ENST00000513674 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.3
CPOX-204ENST00000513674 ABCC8Q09428 1581 aa41.93■■■■■ 4.3
CPOX-204ENST00000513674 IFT140Q96RY7 1462 aa41.86■■■■■ 4.29
CPOX-204ENST00000513674 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CPOX-204ENST00000513674 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
CPOX-204ENST00000513674 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CPOX-204ENST00000513674 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
CPOX-204ENST00000513674 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CPOX-204ENST00000513674 CUX1P39880 1505 aa41.5■■■■■ 4.23
CPOX-204ENST00000513674 OSCARQ8IYS5 282 aa41.45■■■■■ 4.23
CPOX-204ENST00000513674 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.43■■■■■ 4.22
CPOX-204ENST00000513674 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
CPOX-204ENST00000513674 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.4■■■■■ 4.224e-9■■■■■ 33.2
CPOX-204ENST00000513674 SOGA1O94964 1423 aa41.37■■■■■ 4.21
CPOX-204ENST00000513674 WDR97A6NE52 1622 aa41.29■■■■■ 4.2
CPOX-204ENST00000513674 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
CPOX-204ENST00000513674 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
CPOX-204ENST00000513674 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.04■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.03■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
CPOX-204ENST00000513674 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 GRIN2BQ13224 1484 aa40.99■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 PBRM1Q86U86 1689 aa40.98■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 SYNJ1O43426 1573 aa40.97■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.96■■■■■ 4.15
CPOX-204ENST00000513674 ARHGEF11O15085 1522 aa40.92■■■■■ 4.14
CPOX-204ENST00000513674 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.91■■■■■ 4.14
CPOX-204ENST00000513674 FBLN2P98095 1184 aa40.89■■■■■ 4.14
CPOX-204ENST00000513674 SYNJ2O15056 1496 aa40.81■■■■■ 4.12
CPOX-204ENST00000513674 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.75■■■■■ 4.11
CPOX-204ENST00000513674 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CPOX-204ENST00000513674 ADAMTS12P58397 1594 aa40.59■■■■■ 4.09
CPOX-204ENST00000513674 ARAP1Q96P48 1450 aa40.56■■■■■ 4.08
CPOX-204ENST00000513674 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
CPOX-204ENST00000513674 GRIN2AQ12879 1464 aa40.49■■■■■ 4.07
CPOX-204ENST00000513674 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.43■■■■■ 4.06
CPOX-204ENST00000513674 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
CPOX-204ENST00000513674 CEP170Q5SW79 1584 aa40.35■■■■■ 4.05
CPOX-204ENST00000513674 NUP160Q12769 1436 aa40.34■■■■■ 4.05
CPOX-204ENST00000513674 SHROOM2Q13796 1616 aa40.17■■■■■ 4.02
CPOX-204ENST00000513674 KIF27Q86VH2 1401 aa40.13■■■■■ 4.01
CPOX-204ENST00000513674 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.12■■■■■ 4.01
CPOX-204ENST00000513674 CUL7Q14999 1698 aa40.06■■■■■ 4
CPOX-204ENST00000513674 IGF1RP08069 1367 aa40.04■■■■■ 4
CPOX-204ENST00000513674 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.02■■■■■ 4
CPOX-204ENST00000513674 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms