RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590381.5

PQLC1-211, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PQLC1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-211ENST00000590381 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.31■■■■■ 9.01
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PQLC1-211ENST00000590381 SMARCA2P51531 1590 aa55.23■■■■■ 6.43
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PQLC1-211ENST00000590381 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.08■■■■■ 6.25
PQLC1-211ENST00000590381 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.07■■■■■ 6.25
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PQLC1-211ENST00000590381 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.78■■■■■ 6.2
PQLC1-211ENST00000590381 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.76■■■■■ 6.2
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PQLC1-211ENST00000590381 CFTRP13569 1480 aa53.33■■■■■ 6.13
PQLC1-211ENST00000590381 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.3■■■■■ 6.12
PQLC1-211ENST00000590381 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.23■■■■■ 6.11
PQLC1-211ENST00000590381 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.2■■■■■ 6.11
PQLC1-211ENST00000590381 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.12■■■■■ 6.09
PQLC1-211ENST00000590381 WDR62O43379 1518 aa53.12■■■■■ 6.09
PQLC1-211ENST00000590381 PRDM2Q13029 1718 aa52.8■■■■■ 6.04
PQLC1-211ENST00000590381 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.77■■■■■ 6.04
PQLC1-211ENST00000590381 TOPBP1Q92547 1522 aa52.3■■■■■ 5.96
PQLC1-211ENST00000590381 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.25■■■■■ 5.95
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PQLC1-211ENST00000590381 IFT140Q96RY7 1462 aa52.12■■■■■ 5.93
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PQLC1-211ENST00000590381 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.57■■■■■ 5.85
PQLC1-211ENST00000590381 TRIM41Q8WV44 630 aa51.49■■■■■ 5.83
PQLC1-211ENST00000590381 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
PQLC1-211ENST00000590381 CHD1O14646 1710 aa51.26■■■■■ 5.8
PQLC1-211ENST00000590381 FBLN2P98095 1184 aa51.24■■■■■ 5.79
PQLC1-211ENST00000590381 WDR97A6NE52 1622 aa51.17■■■■■ 5.78
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PQLC1-211ENST00000590381 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-211ENST00000590381 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-211ENST00000590381 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-211ENST00000590381 GRIN2BQ13224 1484 aa51.03■■■■■ 5.76
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PQLC1-211ENST00000590381 ARHGEF11O15085 1522 aa50.97■■■■■ 5.75
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PQLC1-211ENST00000590381 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.91■■■■■ 5.74
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PQLC1-211ENST00000590381 SYNJ2O15056 1496 aa50.78■■■■■ 5.72
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PQLC1-211ENST00000590381 ADAMTS12P58397 1594 aa50.43■■■■■ 5.66
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PQLC1-211ENST00000590381 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.32■■■■■ 5.65
PQLC1-211ENST00000590381 CEP170Q5SW79 1584 aa50.2■■■■■ 5.63
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PQLC1-211ENST00000590381 KIF27Q86VH2 1401 aa49.95■■■■■ 5.59
PQLC1-211ENST00000590381 IGF1RP08069 1367 aa49.92■■■■■ 5.58
PQLC1-211ENST00000590381 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.89■■■■■ 5.58
PQLC1-211ENST00000590381 SHROOM2Q13796 1616 aa49.88■■■■■ 5.58
PQLC1-211ENST00000590381 JPH4Q96JJ6 628 aa49.74■■■■■ 5.55
PQLC1-211ENST00000590381 CUL7Q14999 1698 aa49.71■■■■■ 5.55
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