RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588090.5

CIRBP-216, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,459 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-216ENST00000588090 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.34■■■■■ 6.61
CIRBP-216ENST00000588090 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
CIRBP-216ENST00000588090 ABCC9O60706 1549 aa48.52■■■■■ 5.36
CIRBP-216ENST00000588090 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
CIRBP-216ENST00000588090 NACADO15069 1562 aa46.93■■■■■ 5.1
CIRBP-216ENST00000588090 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.9■■■■■ 5.1
CIRBP-216ENST00000588090 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.86■■■■■ 5.09
CIRBP-216ENST00000588090 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.77■■■■■ 5.08
CIRBP-216ENST00000588090 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.68■■■■■ 5.06
CIRBP-216ENST00000588090 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
CIRBP-216ENST00000588090 SCRIBQ14160 1630 aa45.6■■■■■ 4.89
CIRBP-216ENST00000588090 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.42■■■■■ 4.86
CIRBP-216ENST00000588090 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.35■■■■■ 4.85
CIRBP-216ENST00000588090 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.06■■■■■ 4.8
CIRBP-216ENST00000588090 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
CIRBP-216ENST00000588090 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.15■■■■■ 4.66
CIRBP-216ENST00000588090 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.96■■■■■ 4.63
CIRBP-216ENST00000588090 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.8■■■■■ 4.6
CIRBP-216ENST00000588090 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
CIRBP-216ENST00000588090 SMARCA4P51532 1647 aa43.68■■■■■ 4.58
CIRBP-216ENST00000588090 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.4■■■■■ 4.54
CIRBP-216ENST00000588090 SMARCA2P51531 1590 aa43.34■■■■■ 4.53
CIRBP-216ENST00000588090 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.53
CIRBP-216ENST00000588090 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
CIRBP-216ENST00000588090 NCAPD3P42695 1498 aa43.26■■■■■ 4.52
CIRBP-216ENST00000588090 HMGXB3Q12766 1538 aa43.12■■■■■ 4.49
CIRBP-216ENST00000588090 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
CIRBP-216ENST00000588090 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
CIRBP-216ENST00000588090 WIZO95785 1651 aa42.97■■■■■ 4.47
CIRBP-216ENST00000588090 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
CIRBP-216ENST00000588090 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
CIRBP-216ENST00000588090 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
CIRBP-216ENST00000588090 NESP48681 1621 aa42.08■■■■■ 4.33
CIRBP-216ENST00000588090 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.01■■■■■ 4.32
CIRBP-216ENST00000588090 CADPSQ9ULU8 1353 aa42■■■■■ 4.31
CIRBP-216ENST00000588090 ERCC6Q03468 1493 aa41.84■■■■■ 4.29
CIRBP-216ENST00000588090 CFTRP13569 1480 aa41.84■■■■■ 4.29
CIRBP-216ENST00000588090 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.79■■■■■ 4.28
CIRBP-216ENST00000588090 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.67■■■■■ 4.26
CIRBP-216ENST00000588090 PRDM2Q13029 1718 aa41.66■■■■■ 4.26
CIRBP-216ENST00000588090 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.53■■■■■ 4.24
CIRBP-216ENST00000588090 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.47■■■■■ 4.23
CIRBP-216ENST00000588090 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CIRBP-216ENST00000588090 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.34■■■■■ 4.21
CIRBP-216ENST00000588090 CUX2O14529 1486 aa41.31■■■■■ 4.2
CIRBP-216ENST00000588090 WDR62O43379 1518 aa41.21■■■■■ 4.19
CIRBP-216ENST00000588090 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
CIRBP-216ENST00000588090 ABCC8Q09428 1581 aa40.97■■■■■ 4.15
CIRBP-216ENST00000588090 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.91■■■■■ 4.14
CIRBP-216ENST00000588090 TOPBP1Q92547 1522 aa40.9■■■■■ 4.14
CIRBP-216ENST00000588090 CUX1P39880 1505 aa40.7■■■■■ 4.11
CIRBP-216ENST00000588090 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.091e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-216ENST00000588090 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
CIRBP-216ENST00000588090 IFT140Q96RY7 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
CIRBP-216ENST00000588090 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.53■■■■■ 4.08
CIRBP-216ENST00000588090 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
CIRBP-216ENST00000588090 TOP2BQ02880 1626 aa40.49■■■■■ 4.07
CIRBP-216ENST00000588090 SYNJ1O43426 1573 aa40.46■■■■■ 4.07
CIRBP-216ENST00000588090 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CIRBP-216ENST00000588090 SOGA1O94964 1423 aa40.4■■■■■ 4.06
CIRBP-216ENST00000588090 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.36■■■■■ 4.05
CIRBP-216ENST00000588090 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
CIRBP-216ENST00000588090 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
CIRBP-216ENST00000588090 WDR97A6NE52 1622 aa40.23■■■■■ 4.03
CIRBP-216ENST00000588090 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.17■■■■■ 4.02
CIRBP-216ENST00000588090 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.023e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-216ENST00000588090 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
CIRBP-216ENST00000588090 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40■■■■□ 3.99
CIRBP-216ENST00000588090 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.96■■■■□ 3.99
CIRBP-216ENST00000588090 GRIN2BQ13224 1484 aa39.92■■■■□ 3.98
CIRBP-216ENST00000588090 PBRM1Q86U86 1689 aa39.92■■■■□ 3.98
CIRBP-216ENST00000588090 TRIM41Q8WV44 630 aa39.81■■■■□ 3.96
CIRBP-216ENST00000588090 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.8■■■■□ 3.96
CIRBP-216ENST00000588090 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CIRBP-216ENST00000588090 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.72■■■■□ 3.95
CIRBP-216ENST00000588090 KIF27Q86VH2 1401 aa39.71■■■■□ 3.95
CIRBP-216ENST00000588090 CHD1O14646 1710 aa39.69■■■■□ 3.94
CIRBP-216ENST00000588090 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
CIRBP-216ENST00000588090 OSCARQ8IYS5 282 aa39.6■■■■□ 3.93
CIRBP-216ENST00000588090 ADAMTS12P58397 1594 aa39.59■■■■□ 3.93
CIRBP-216ENST00000588090 FBLN2P98095 1184 aa39.58■■■■□ 3.93
CIRBP-216ENST00000588090 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.57■■■■□ 3.93
CIRBP-216ENST00000588090 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
CIRBP-216ENST00000588090 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.51■■■■□ 3.92
CIRBP-216ENST00000588090 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.49■■■■□ 3.91
CIRBP-216ENST00000588090 IGF1RP08069 1367 aa39.46■■■■□ 3.91
CIRBP-216ENST00000588090 CUL7Q14999 1698 aa39.45■■■■□ 3.91
CIRBP-216ENST00000588090 GRIN2AQ12879 1464 aa39.41■■■■□ 3.9
CIRBP-216ENST00000588090 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.38■■■■□ 3.89
CIRBP-216ENST00000588090 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.25■■■■□ 3.87
CIRBP-216ENST00000588090 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
CIRBP-216ENST00000588090 NUP160Q12769 1436 aa39.21■■■■□ 3.87
CIRBP-216ENST00000588090 EEA1Q15075 1411 aa39.2■■■■□ 3.87
CIRBP-216ENST00000588090 CEP170Q5SW79 1584 aa39.19■■■■□ 3.86
CIRBP-216ENST00000588090 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.09■■■■□ 3.85
CIRBP-216ENST00000588090 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.03■■■■□ 3.84
CIRBP-216ENST00000588090 PRXQ9BXM0 1461 aa39.02■■■■□ 3.84
CIRBP-216ENST00000588090 ARHGEF11O15085 1522 aa38.99■■■■□ 3.83
CIRBP-216ENST00000588090 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.96■■■■□ 3.83
CIRBP-216ENST00000588090 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.96■■■■□ 3.83
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