RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569248.5

STUB1-211, Transcript of STIP1 homology and U-box containing protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene STUB1, Length 1,853 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1-211ENST00000569248 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.86■■■■■ 7.97
STUB1-211ENST00000569248 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.19■■■■■ 6.59
STUB1-211ENST00000569248 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.62■■■■■ 6.33
STUB1-211ENST00000569248 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.62■■■■■ 6.17
STUB1-211ENST00000569248 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.48■■■■■ 6.15
STUB1-211ENST00000569248 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.44■■■■■ 6.15
STUB1-211ENST00000569248 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.7■■■■■ 6.03
STUB1-211ENST00000569248 ABCC9O60706 1549 aa52.51■■■■■ 6
STUB1-211ENST00000569248 NACADO15069 1562 aa52.19■■■■■ 5.94
STUB1-211ENST00000569248 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.88■■■■■ 5.9
STUB1-211ENST00000569248 SCRIBQ14160 1630 aa51.8■■■■■ 5.88
STUB1-211ENST00000569248 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.56■■■■■ 5.84
STUB1-211ENST00000569248 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.62■■■■■ 5.69
STUB1-211ENST00000569248 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.57■■■■■ 5.69
STUB1-211ENST00000569248 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.34■■■■■ 5.65
STUB1-211ENST00000569248 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.14■■■■■ 5.62
STUB1-211ENST00000569248 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.03■■■■■ 5.6
STUB1-211ENST00000569248 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.03■■■■■ 5.6
STUB1-211ENST00000569248 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.98■■■■■ 5.59
STUB1-211ENST00000569248 WIZO95785 1651 aa49.79■■■■■ 5.56
STUB1-211ENST00000569248 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.71■■■■■ 5.55
STUB1-211ENST00000569248 SMARCA4P51532 1647 aa49.7■■■■■ 5.55
STUB1-211ENST00000569248 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
STUB1-211ENST00000569248 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.05■■■■■ 5.44
STUB1-211ENST00000569248 SMARCA2P51531 1590 aa48.84■■■■■ 5.41
STUB1-211ENST00000569248 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.81■■■■■ 5.4
STUB1-211ENST00000569248 TRIM41Q8WV44 630 aa48.73■■■■■ 5.39
STUB1-211ENST00000569248 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.71■■■■■ 5.39
STUB1-211ENST00000569248 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.69■■■■■ 5.38
STUB1-211ENST00000569248 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.49■■■■■ 5.35
STUB1-211ENST00000569248 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.16■■■■■ 5.3
STUB1-211ENST00000569248 NCAPD3P42695 1498 aa48.16■■■■■ 5.3
STUB1-211ENST00000569248 HMGXB3Q12766 1538 aa48.14■■■■■ 5.3
STUB1-211ENST00000569248 ABCC8Q09428 1581 aa48.01■■■■■ 5.28
STUB1-211ENST00000569248 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
STUB1-211ENST00000569248 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.63■■■■■ 5.22
STUB1-211ENST00000569248 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.53■■■■■ 5.2
STUB1-211ENST00000569248 SYNJ1O43426 1573 aa47.37■■■■■ 5.17
STUB1-211ENST00000569248 EEA1Q15075 1411 aa47.37■■■■■ 5.17
STUB1-211ENST00000569248 CFTRP13569 1480 aa47.31■■■■■ 5.16
STUB1-211ENST00000569248 SOGA1O94964 1423 aa47.28■■■■■ 5.16
STUB1-211ENST00000569248 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.14■■■■■ 5.14
STUB1-211ENST00000569248 TOP2BQ02880 1626 aa47.14■■■■■ 5.14
STUB1-211ENST00000569248 PRDM2Q13029 1718 aa47.11■■■■■ 5.13
STUB1-211ENST00000569248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.07■■■■■ 5.13
STUB1-211ENST00000569248 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.07■■■■■ 5.13
STUB1-211ENST00000569248 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.05■■■■■ 5.12
STUB1-211ENST00000569248 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.01■■■■■ 5.12
STUB1-211ENST00000569248 CUX1P39880 1505 aa46.84■■■■■ 5.09
STUB1-211ENST00000569248 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.76■■■■■ 5.08
STUB1-211ENST00000569248 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.75■■■■■ 5.07
STUB1-211ENST00000569248 GOLGA3Q08378 1498 aa46.74■■■■■ 5.07
STUB1-211ENST00000569248 KIF21BO75037 1637 aa46.68■■■■■ 5.06
STUB1-211ENST00000569248 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.67■■■■■ 5.06
STUB1-211ENST00000569248 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
STUB1-211ENST00000569248 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
STUB1-211ENST00000569248 CEP162Q5TB80 1403 aa46.53■■■■■ 5.04
STUB1-211ENST00000569248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.48■■■■■ 5.03
STUB1-211ENST00000569248 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.41■■■■■ 5.02
STUB1-211ENST00000569248 KIF27Q86VH2 1401 aa46.38■■■■■ 5.02
STUB1-211ENST00000569248 NESP48681 1621 aa46.33■■■■■ 5.01
STUB1-211ENST00000569248 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.28■■■■■ 5
STUB1-211ENST00000569248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.23■■■■■ 4.99
STUB1-211ENST00000569248 PRXQ9BXM0 1461 aa46.23■■■■■ 4.99
STUB1-211ENST00000569248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.21■■■■■ 4.99
STUB1-211ENST00000569248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.19■■■■■ 4.98
STUB1-211ENST00000569248 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.1■■■■■ 4.97
STUB1-211ENST00000569248 CUX2O14529 1486 aa46.08■■■■■ 4.97
STUB1-211ENST00000569248 TOPBP1Q92547 1522 aa46.06■■■■■ 4.96
STUB1-211ENST00000569248 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.05■■■■■ 4.96
STUB1-211ENST00000569248 HRCP23327 699 aa46.02■■■■■ 4.96
STUB1-211ENST00000569248 CLIP1P30622 1438 aa46.01■■■■■ 4.96
STUB1-211ENST00000569248 IGF1RP08069 1367 aa45.89■■■■■ 4.94
STUB1-211ENST00000569248 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
STUB1-211ENST00000569248 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
STUB1-211ENST00000569248 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
STUB1-211ENST00000569248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.83■■■■■ 4.93
STUB1-211ENST00000569248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.78■■■■■ 4.92
STUB1-211ENST00000569248 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.75■■■■■ 4.92
STUB1-211ENST00000569248 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.72■■■■■ 4.91
STUB1-211ENST00000569248 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.68■■■■■ 4.9
STUB1-211ENST00000569248 WDR97A6NE52 1622 aa45.58■■■■■ 4.89
STUB1-211ENST00000569248 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
STUB1-211ENST00000569248 CUL7Q14999 1698 aa45.45■■■■■ 4.87
STUB1-211ENST00000569248 ARAP1Q96P48 1450 aa45.44■■■■■ 4.86
STUB1-211ENST00000569248 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.38■■■■■ 4.86
STUB1-211ENST00000569248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.37■■■■■ 4.85
STUB1-211ENST00000569248 APLP2Q06481 763 aa45.37■■■■■ 4.85
STUB1-211ENST00000569248 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
STUB1-211ENST00000569248 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.31■■■■■ 4.84
STUB1-211ENST00000569248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
STUB1-211ENST00000569248 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.28■■■■■ 4.84
STUB1-211ENST00000569248 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
STUB1-211ENST00000569248 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
STUB1-211ENST00000569248 WDR62O43379 1518 aa45.11■■■■■ 4.81
STUB1-211ENST00000569248 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.06■■■■■ 4.8
STUB1-211ENST00000569248 ERCC6Q03468 1493 aa44.97■■■■■ 4.79
STUB1-211ENST00000569248 IFT140Q96RY7 1462 aa44.97■■■■■ 4.79
STUB1-211ENST00000569248 PBRM1Q86U86 1689 aa44.95■■■■■ 4.79
STUB1-211ENST00000569248 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.92■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms