Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 FKBP4-203ENST00000539181 370 ntTSL 38.78□□□□□ -18e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.118e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.238e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-209ENST00000556827 752 ntTSL 27.26□□□□□ -1.258e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RFC3-203ENST00000616236 612 ntTSL 36.8□□□□□ -1.328e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.358e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EIF2D-209ENST00000613435 437 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.368e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.448e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SVIP-203ENST00000529848 263 ntTSL 55.64□□□□□ -1.518e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NSUN2-209ENST00000514127 614 ntTSL 35.16□□□□□ -1.588e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.598e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EIF2D-208ENST00000484492 479 ntTSL 55.01□□□□□ -1.618e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.798e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.018e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.188e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-6■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RPL5-201ENST00000315741 681 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-46■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EBP-201ENST00000276096 904 ntTSL 220.01■□□□□ 0.794e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 DDB1-212ENST00000538470 858 ntTSL 210.58□□□□□ -0.722e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-17■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.137e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.517e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 521.61■■□□□ 1.057e-13■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.113e-26■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.092e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 TSG101-211ENST00000580814 441 ntTSL 28.04□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 TSG101-212ENST00000584526 912 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.659e-31■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ALDOA-220ENST00000566846 512 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-89■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-6■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.14e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MRPS34-203ENST00000569585 713 ntTSL 216.53■□□□□ 0.244e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.032e-27■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ISYNA1-212ENST00000583309 371 ntTSL 213.71□□□□□ -0.215e-11■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ACADVL-215ENST00000578809 709 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ACADVL-211ENST00000578319 718 ntTSL 315.91■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 213.57□□□□□ -0.246e-15■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.366e-15■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.526e-15■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3D-211ENST00000478547 452 ntTSL 39.06□□□□□ -0.966e-15■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.713e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.583e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SH3GLB2-208ENST00000455407 837 ntTSL 234.67■■■■□ 3.149e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SH3GLB2-212ENST00000483980 1015 ntTSL 234.4■■■■□ 3.19e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RALY-207ENST00000481580 773 ntTSL 228.57■■■□□ 2.164e-10■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 426.91■■□□□ 1.92e-24■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SH3GLB2-204ENST00000416230 720 ntTSL 225.75■■□□□ 1.719e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARF3-206ENST00000539611 576 ntTSL 525.46■■□□□ 1.672e-24■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-24■□□□□ 10.8
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PABPC4Q13310 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.339e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PHKB-204ENST00000564711 697 ntTSL 58.75□□□□□ -1.019e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PHKB-210ENST00000566319 3080 ntTSL 28.28□□□□□ -1.089e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.169e-13■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNF8-208ENST00000510195 445 ntTSL 232.46■■■□□ 2.792e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.138e-15■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SSBP4-210ENST00000601444 427 ntTSL 523.8■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 GNL1-203ENST00000462708 774 ntTSL 210.18□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.326e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 318.96■□□□□ 0.634e-23■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CBFA2T3-205ENST00000563856 2380 ntTSL 219.66■□□□□ 0.742e-29■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.974e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.774e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 217.45■□□□□ 0.384e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 215.62■□□□□ 0.094e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 211.39□□□□□ -0.594e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PRR11-205ENST00000580177 1641 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.991e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 215.16■□□□□ 0.021e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-17■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CAPRIN1-215ENST00000533657 2774 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-26■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-26■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 LSM5-209ENST00000468872 636 ntTSL 27.31□□□□□ -1.242e-26■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 59.52□□□□□ -0.897e-23■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 35.72□□□□□ -1.497e-23■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BROX-208ENST00000539697 3734 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -14e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.124e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-14■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)26.75■■□□□ 1.877e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 224.96■■□□□ 1.597e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SNF8-214ENST00000515174 823 ntTSL 211.32□□□□□ -0.63e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.216e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RPS19BP1-206ENST00000491966 647 ntTSL 218.08■□□□□ 0.488e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.746e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.616e-8■□□□□ 10.8
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