RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416230.1

SH3GLB2-204, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3GLB2, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2-204ENST00000416230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.66■■■■■ 6.02
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SH3GLB2-204ENST00000416230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.31■■■■■ 4.84
SH3GLB2-204ENST00000416230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.07■■■■■ 4.81
SH3GLB2-204ENST00000416230 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
SH3GLB2-204ENST00000416230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.57■■■■■ 4.73
SH3GLB2-204ENST00000416230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.36■■■■■ 4.69
SH3GLB2-204ENST00000416230 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.25■■■■■ 4.67
SH3GLB2-204ENST00000416230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.17■■■■■ 4.66
SH3GLB2-204ENST00000416230 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.96■■■■■ 4.63
SH3GLB2-204ENST00000416230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.56
SH3GLB2-204ENST00000416230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.54■■■■■ 4.56
SH3GLB2-204ENST00000416230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
SH3GLB2-204ENST00000416230 SCRIBQ14160 1630 aa43.1■■■■■ 4.49
SH3GLB2-204ENST00000416230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.08■■■■■ 4.49
SH3GLB2-204ENST00000416230 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.05■■■■■ 4.48
SH3GLB2-204ENST00000416230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
SH3GLB2-204ENST00000416230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.73■■■■■ 4.27
SH3GLB2-204ENST00000416230 NCAPD3P42695 1498 aa41.51■■■■■ 4.24
SH3GLB2-204ENST00000416230 CUX2O14529 1486 aa41.34■■■■■ 4.21
SH3GLB2-204ENST00000416230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.29■■■■■ 4.2
SH3GLB2-204ENST00000416230 ERCC6Q03468 1493 aa41.25■■■■■ 4.19
SH3GLB2-204ENST00000416230 SMARCA2P51531 1590 aa41.18■■■■■ 4.18
SH3GLB2-204ENST00000416230 HMGXB3Q12766 1538 aa41.13■■■■■ 4.18
SH3GLB2-204ENST00000416230 SMARCA4P51532 1647 aa41.12■■■■■ 4.17
SH3GLB2-204ENST00000416230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
SH3GLB2-204ENST00000416230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SH3GLB2-204ENST00000416230 NESP48681 1621 aa40.85■■■■■ 4.13
SH3GLB2-204ENST00000416230 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.78■■■■■ 4.12
SH3GLB2-204ENST00000416230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.6■■■■■ 4.09
SH3GLB2-204ENST00000416230 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.53■■■■■ 4.08
SH3GLB2-204ENST00000416230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
SH3GLB2-204ENST00000416230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.42■■■■■ 4.06
SH3GLB2-204ENST00000416230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.3■■■■■ 4.04
SH3GLB2-204ENST00000416230 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.22■■■■■ 4.03
SH3GLB2-204ENST00000416230 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.03■■■■■ 4
SH3GLB2-204ENST00000416230 WIZO95785 1651 aa40■■■■□ 3.99
SH3GLB2-204ENST00000416230 WDR62O43379 1518 aa39.94■■■■□ 3.98
SH3GLB2-204ENST00000416230 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.81■■■■□ 3.96
SH3GLB2-204ENST00000416230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.73■■■■□ 3.95
SH3GLB2-204ENST00000416230 CFTRP13569 1480 aa39.68■■■■□ 3.94
SH3GLB2-204ENST00000416230 TRIM41Q8WV44 630 aa39.67■■■■□ 3.94
SH3GLB2-204ENST00000416230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
SH3GLB2-204ENST00000416230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
SH3GLB2-204ENST00000416230 OSCARQ8IYS5 282 aa39.41■■■■□ 3.9
SH3GLB2-204ENST00000416230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
SH3GLB2-204ENST00000416230 PRDM2Q13029 1718 aa39.17■■■■□ 3.86
SH3GLB2-204ENST00000416230 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.09■■■■□ 3.85
SH3GLB2-204ENST00000416230 IFT140Q96RY7 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
SH3GLB2-204ENST00000416230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
SH3GLB2-204ENST00000416230 TOPBP1Q92547 1522 aa38.93■■■■□ 3.82
SH3GLB2-204ENST00000416230 ABCC8Q09428 1581 aa38.91■■■■□ 3.82
SH3GLB2-204ENST00000416230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.84■■■■□ 3.81
SH3GLB2-204ENST00000416230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.84■■■■□ 3.81
SH3GLB2-204ENST00000416230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.84■■■■□ 3.81
SH3GLB2-204ENST00000416230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.75■■■■□ 3.79
SH3GLB2-204ENST00000416230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
SH3GLB2-204ENST00000416230 ARHGEF11O15085 1522 aa38.71■■■■□ 3.79
SH3GLB2-204ENST00000416230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
SH3GLB2-204ENST00000416230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.57■■■■□ 3.764e-8■■■■■ 42.1
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SH3GLB2-204ENST00000416230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.47■■■■□ 3.75
SH3GLB2-204ENST00000416230 CHD1O14646 1710 aa38.46■■■■□ 3.75
SH3GLB2-204ENST00000416230 FBLN2P98095 1184 aa38.4■■■■□ 3.74
SH3GLB2-204ENST00000416230 SOGA1O94964 1423 aa38.36■■■■□ 3.73
SH3GLB2-204ENST00000416230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.35■■■■□ 3.73
SH3GLB2-204ENST00000416230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
SH3GLB2-204ENST00000416230 ARAP1Q96P48 1450 aa38.29■■■■□ 3.72
SH3GLB2-204ENST00000416230 WDR97A6NE52 1622 aa38.25■■■■□ 3.71
SH3GLB2-204ENST00000416230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.2■■■■□ 3.71
SH3GLB2-204ENST00000416230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.16■■■■□ 3.7
SH3GLB2-204ENST00000416230 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
SH3GLB2-204ENST00000416230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
SH3GLB2-204ENST00000416230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
SH3GLB2-204ENST00000416230 CUX1P39880 1505 aa38.11■■■■□ 3.69
SH3GLB2-204ENST00000416230 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.07■■■■□ 3.69
SH3GLB2-204ENST00000416230 GRIN2BQ13224 1484 aa38.07■■■■□ 3.68
SH3GLB2-204ENST00000416230 SYNJ1O43426 1573 aa38.05■■■■□ 3.68
SH3GLB2-204ENST00000416230 SYNJ2O15056 1496 aa37.97■■■■□ 3.67
SH3GLB2-204ENST00000416230 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.87■■■■□ 3.65
SH3GLB2-204ENST00000416230 PBRM1Q86U86 1689 aa37.8■■■■□ 3.64
SH3GLB2-204ENST00000416230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.79■■■■□ 3.64
SH3GLB2-204ENST00000416230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.72■■■■□ 3.63
SH3GLB2-204ENST00000416230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.61
SH3GLB2-204ENST00000416230 GRIN2AQ12879 1464 aa37.56■■■■□ 3.6
SH3GLB2-204ENST00000416230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
SH3GLB2-204ENST00000416230 NUP160Q12769 1436 aa37.46■■■■□ 3.59
SH3GLB2-204ENST00000416230 ADAMTS12P58397 1594 aa37.46■■■■□ 3.59
SH3GLB2-204ENST00000416230 TOP2BQ02880 1626 aa37.42■■■■□ 3.58
SH3GLB2-204ENST00000416230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.41■■■■□ 3.58
SH3GLB2-204ENST00000416230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.4■■■■□ 3.58
SH3GLB2-204ENST00000416230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.4■■■■□ 3.58
SH3GLB2-204ENST00000416230 CEP170Q5SW79 1584 aa37.39■■■■□ 3.58
SH3GLB2-204ENST00000416230 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
SH3GLB2-204ENST00000416230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.31■■■■□ 3.56
SH3GLB2-204ENST00000416230 SHROOM2Q13796 1616 aa37.3■■■■□ 3.56
SH3GLB2-204ENST00000416230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SH3GLB2-204ENST00000416230 JPH4Q96JJ6 628 aa37.11■■■■□ 3.53
SH3GLB2-204ENST00000416230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.94■■■■□ 3.5
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