RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536283.1

ARF3-205, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ARF3, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-205ENST00000536283 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.01■■■■■ 6.4
ARF3-205ENST00000536283 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.24■■■■■ 5.47
ARF3-205ENST00000536283 ABCC9O60706 1549 aa48.83■■■■■ 5.41
ARF3-205ENST00000536283 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.66■■■■■ 5.06
ARF3-205ENST00000536283 NACADO15069 1562 aa46.43■■■■■ 5.02
ARF3-205ENST00000536283 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.24■■■■■ 4.99
ARF3-205ENST00000536283 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.9■■■■■ 4.94
ARF3-205ENST00000536283 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
ARF3-205ENST00000536283 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.63■■■■■ 4.89
ARF3-205ENST00000536283 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.48■■■■■ 4.87
ARF3-205ENST00000536283 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
ARF3-205ENST00000536283 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.35■■■■■ 4.85
ARF3-205ENST00000536283 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.27■■■■■ 4.84
ARF3-205ENST00000536283 SCRIBQ14160 1630 aa44.91■■■■■ 4.78
ARF3-205ENST00000536283 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
ARF3-205ENST00000536283 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
ARF3-205ENST00000536283 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.13■■■■■ 4.66
ARF3-205ENST00000536283 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.94■■■■■ 4.62
ARF3-205ENST00000536283 SMARCA4P51532 1647 aa42.86■■■■■ 4.45
ARF3-205ENST00000536283 NCAPD3P42695 1498 aa42.82■■■■■ 4.45
ARF3-205ENST00000536283 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.76■■■■■ 4.44
ARF3-205ENST00000536283 SMARCA2P51531 1590 aa42.7■■■■■ 4.43
ARF3-205ENST00000536283 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
ARF3-205ENST00000536283 HMGXB3Q12766 1538 aa42.59■■■■■ 4.41
ARF3-205ENST00000536283 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.42■■■■■ 4.38
ARF3-205ENST00000536283 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
ARF3-205ENST00000536283 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.4■■■■■ 4.38
ARF3-205ENST00000536283 ERCC6Q03468 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
ARF3-205ENST00000536283 NESP48681 1621 aa42.06■■■■■ 4.32
ARF3-205ENST00000536283 WIZO95785 1651 aa41.94■■■■■ 4.3
ARF3-205ENST00000536283 CUX2O14529 1486 aa41.92■■■■■ 4.3
ARF3-205ENST00000536283 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.84■■■■■ 4.29
ARF3-205ENST00000536283 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
ARF3-205ENST00000536283 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
ARF3-205ENST00000536283 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.57■■■■■ 4.25
ARF3-205ENST00000536283 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.56■■■■■ 4.24
ARF3-205ENST00000536283 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.54■■■■■ 4.24
ARF3-205ENST00000536283 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
ARF3-205ENST00000536283 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.36■■■■■ 4.21
ARF3-205ENST00000536283 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.21■■■■■ 4.19
ARF3-205ENST00000536283 CFTRP13569 1480 aa41.16■■■■■ 4.18
ARF3-205ENST00000536283 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.13■■■■■ 4.17
ARF3-205ENST00000536283 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.1■■■■■ 4.17
ARF3-205ENST00000536283 WDR62O43379 1518 aa41.1■■■■■ 4.17
ARF3-205ENST00000536283 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.92■■■■■ 4.14
ARF3-205ENST00000536283 PRDM2Q13029 1718 aa40.87■■■■■ 4.13
ARF3-205ENST00000536283 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
ARF3-205ENST00000536283 TOPBP1Q92547 1522 aa40.37■■■■■ 4.05
ARF3-205ENST00000536283 ABCC8Q09428 1581 aa40.3■■■■■ 4.04
ARF3-205ENST00000536283 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.28■■■■■ 4.04
ARF3-205ENST00000536283 IFT140Q96RY7 1462 aa40.28■■■■■ 4.04
ARF3-205ENST00000536283 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
ARF3-205ENST00000536283 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
ARF3-205ENST00000536283 OSCARQ8IYS5 282 aa40.02■■■■■ 4
ARF3-205ENST00000536283 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
ARF3-205ENST00000536283 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
ARF3-205ENST00000536283 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
ARF3-205ENST00000536283 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
ARF3-205ENST00000536283 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.82■■■■□ 3.97
ARF3-205ENST00000536283 CUX1P39880 1505 aa39.82■■■■□ 3.97
ARF3-205ENST00000536283 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.81■■■■□ 3.96
ARF3-205ENST00000536283 SOGA1O94964 1423 aa39.78■■■■□ 3.96
ARF3-205ENST00000536283 TRIM41Q8WV44 630 aa39.77■■■■□ 3.96
ARF3-205ENST00000536283 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
ARF3-205ENST00000536283 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
ARF3-205ENST00000536283 WDR97A6NE52 1622 aa39.63■■■■□ 3.93
ARF3-205ENST00000536283 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
ARF3-205ENST00000536283 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
ARF3-205ENST00000536283 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
ARF3-205ENST00000536283 FBLN2P98095 1184 aa39.5■■■■□ 3.91
ARF3-205ENST00000536283 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.49■■■■□ 3.91
ARF3-205ENST00000536283 ARHGEF11O15085 1522 aa39.44■■■■□ 3.9
ARF3-205ENST00000536283 GRIN2BQ13224 1484 aa39.42■■■■□ 3.9
ARF3-205ENST00000536283 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
ARF3-205ENST00000536283 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.36■■■■□ 3.89
ARF3-205ENST00000536283 PBRM1Q86U86 1689 aa39.35■■■■□ 3.89
ARF3-205ENST00000536283 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.33■■■■□ 3.89
ARF3-205ENST00000536283 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.32■■■■□ 3.89
ARF3-205ENST00000536283 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.31■■■■□ 3.88
ARF3-205ENST00000536283 TOP2BQ02880 1626 aa39.31■■■■□ 3.88
ARF3-205ENST00000536283 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.3■■■■□ 3.88
ARF3-205ENST00000536283 SYNJ1O43426 1573 aa39.28■■■■□ 3.88
ARF3-205ENST00000536283 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
ARF3-205ENST00000536283 SYNJ2O15056 1496 aa39.25■■■■□ 3.87
ARF3-205ENST00000536283 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.17■■■■□ 3.86
ARF3-205ENST00000536283 ARAP1Q96P48 1450 aa39.07■■■■□ 3.85
ARF3-205ENST00000536283 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.06■■■■□ 3.84
ARF3-205ENST00000536283 ADAMTS12P58397 1594 aa38.99■■■■□ 3.83
ARF3-205ENST00000536283 GRIN2AQ12879 1464 aa38.92■■■■□ 3.82
ARF3-205ENST00000536283 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.89■■■■□ 3.82
ARF3-205ENST00000536283 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.85■■■■□ 3.81
ARF3-205ENST00000536283 CEP170Q5SW79 1584 aa38.78■■■■□ 3.8
ARF3-205ENST00000536283 NUP160Q12769 1436 aa38.76■■■■□ 3.8
ARF3-205ENST00000536283 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.58■■■■□ 3.77
ARF3-205ENST00000536283 SHROOM2Q13796 1616 aa38.56■■■■□ 3.76
ARF3-205ENST00000536283 KIF27Q86VH2 1401 aa38.54■■■■□ 3.76
ARF3-205ENST00000536283 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
ARF3-205ENST00000536283 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.43■■■■□ 3.74
ARF3-205ENST00000536283 CUL7Q14999 1698 aa38.43■■■■□ 3.74
ARF3-205ENST00000536283 IGF1RP08069 1367 aa38.42■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms