RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483980.5

SH3GLB2-212, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like, endophilin B2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3GLB2, Length 1,015 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2-212ENST00000483980 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.14■■■■■ 8.82
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SH3GLB2-212ENST00000483980 ABCC9O60706 1549 aa61.45■■■■■ 7.43
SH3GLB2-212ENST00000483980 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59.11■■■■■ 7.05
SH3GLB2-212ENST00000483980 NACADO15069 1562 aa58.98■■■■■ 7.03
SH3GLB2-212ENST00000483980 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.6■■■■■ 6.97
SH3GLB2-212ENST00000483980 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.55■■■■■ 6.96
SH3GLB2-212ENST00000483980 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.33■■■■■ 6.93
SH3GLB2-212ENST00000483980 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.16■■■■■ 6.9
SH3GLB2-212ENST00000483980 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.72■■■■■ 6.83
SH3GLB2-212ENST00000483980 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.29■■■■■ 6.76
SH3GLB2-212ENST00000483980 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.27■■■■■ 6.76
SH3GLB2-212ENST00000483980 SCRIBQ14160 1630 aa56.89■■■■■ 6.7
SH3GLB2-212ENST00000483980 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.84■■■■■ 6.69
SH3GLB2-212ENST00000483980 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.76■■■■■ 6.68
SH3GLB2-212ENST00000483980 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.8■■■■■ 6.52
SH3GLB2-212ENST00000483980 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.66■■■■■ 6.5
SH3GLB2-212ENST00000483980 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.34■■■■■ 6.45
SH3GLB2-212ENST00000483980 SMARCA4P51532 1647 aa54.49■■■■■ 6.31
SH3GLB2-212ENST00000483980 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.42■■■■■ 6.3
SH3GLB2-212ENST00000483980 NCAPD3P42695 1498 aa54.41■■■■■ 6.3
SH3GLB2-212ENST00000483980 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.31■■■■■ 6.28
SH3GLB2-212ENST00000483980 SMARCA2P51531 1590 aa54.29■■■■■ 6.28
SH3GLB2-212ENST00000483980 HMGXB3Q12766 1538 aa54.11■■■■■ 6.25
SH3GLB2-212ENST00000483980 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.08■■■■■ 6.25
SH3GLB2-212ENST00000483980 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.95■■■■■ 6.23
SH3GLB2-212ENST00000483980 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.82■■■■■ 6.21
SH3GLB2-212ENST00000483980 WIZO95785 1651 aa53.35■■■■■ 6.13
SH3GLB2-212ENST00000483980 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.23■■■■■ 6.11
SH3GLB2-212ENST00000483980 ERCC6Q03468 1493 aa53.05■■■■■ 6.08
SH3GLB2-212ENST00000483980 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.05■■■■■ 6.08
SH3GLB2-212ENST00000483980 NESP48681 1621 aa53.04■■■■■ 6.08
SH3GLB2-212ENST00000483980 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.84■■■■■ 6.05
SH3GLB2-212ENST00000483980 CUX2O14529 1486 aa52.78■■■■■ 6.04
SH3GLB2-212ENST00000483980 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.76■■■■■ 6.04
SH3GLB2-212ENST00000483980 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.69■■■■■ 6.03
SH3GLB2-212ENST00000483980 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.48■■■■■ 5.99
SH3GLB2-212ENST00000483980 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.44■■■■■ 5.99
SH3GLB2-212ENST00000483980 CFTRP13569 1480 aa52.37■■■■■ 5.97
SH3GLB2-212ENST00000483980 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.18■■■■■ 5.94
SH3GLB2-212ENST00000483980 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.12■■■■■ 5.93
SH3GLB2-212ENST00000483980 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.11■■■■■ 5.93
SH3GLB2-212ENST00000483980 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.1■■■■■ 5.93
SH3GLB2-212ENST00000483980 PRDM2Q13029 1718 aa52.01■■■■■ 5.92
SH3GLB2-212ENST00000483980 WDR62O43379 1518 aa51.99■■■■■ 5.91
SH3GLB2-212ENST00000483980 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.6■■■■■ 5.85
SH3GLB2-212ENST00000483980 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.59■■■■■ 5.85
SH3GLB2-212ENST00000483980 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
SH3GLB2-212ENST00000483980 ABCC8Q09428 1581 aa51.36■■■■■ 5.81
SH3GLB2-212ENST00000483980 TOPBP1Q92547 1522 aa51.23■■■■■ 5.79
SH3GLB2-212ENST00000483980 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.17■■■■■ 5.78
SH3GLB2-212ENST00000483980 IFT140Q96RY7 1462 aa51.06■■■■■ 5.76
SH3GLB2-212ENST00000483980 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
SH3GLB2-212ENST00000483980 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.74■■■■■ 5.71
SH3GLB2-212ENST00000483980 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
SH3GLB2-212ENST00000483980 CUX1P39880 1505 aa50.66■■■■■ 5.7
SH3GLB2-212ENST00000483980 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
SH3GLB2-212ENST00000483980 SOGA1O94964 1423 aa50.55■■■■■ 5.68
SH3GLB2-212ENST00000483980 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.55■■■■■ 5.68
SH3GLB2-212ENST00000483980 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.47■■■■■ 5.67
SH3GLB2-212ENST00000483980 OSCARQ8IYS5 282 aa50.47■■■■■ 5.67
SH3GLB2-212ENST00000483980 WDR97A6NE52 1622 aa50.47■■■■■ 5.67
SH3GLB2-212ENST00000483980 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.42■■■■■ 5.662e-6■■■■□ 22.7
SH3GLB2-212ENST00000483980 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.63
SH3GLB2-212ENST00000483980 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.21■■■■■ 5.63
SH3GLB2-212ENST00000483980 TOP2BQ02880 1626 aa50.19■■■■■ 5.63
SH3GLB2-212ENST00000483980 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.19■■■■■ 5.63
SH3GLB2-212ENST00000483980 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.13■■■■■ 5.62
SH3GLB2-212ENST00000483980 SYNJ1O43426 1573 aa50.05■■■■■ 5.6
SH3GLB2-212ENST00000483980 GRIN2BQ13224 1484 aa50.05■■■■■ 5.6
SH3GLB2-212ENST00000483980 CHD1O14646 1710 aa50.02■■■■■ 5.6
SH3GLB2-212ENST00000483980 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50■■■■■ 5.59
SH3GLB2-212ENST00000483980 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.97■■■■■ 5.59
SH3GLB2-212ENST00000483980 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.95■■■■■ 5.59
SH3GLB2-212ENST00000483980 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.94■■■■■ 5.59
SH3GLB2-212ENST00000483980 PBRM1Q86U86 1689 aa49.9■■■■■ 5.58
SH3GLB2-212ENST00000483980 FBLN2P98095 1184 aa49.84■■■■■ 5.57
SH3GLB2-212ENST00000483980 SYNJ2O15056 1496 aa49.78■■■■■ 5.56
SH3GLB2-212ENST00000483980 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.74■■■■■ 5.55
SH3GLB2-212ENST00000483980 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.64■■■■■ 5.54
SH3GLB2-212ENST00000483980 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.64■■■■■ 5.54
SH3GLB2-212ENST00000483980 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.64■■■■■ 5.54
SH3GLB2-212ENST00000483980 ARHGEF11O15085 1522 aa49.6■■■■■ 5.53
SH3GLB2-212ENST00000483980 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.55■■■■■ 5.52
SH3GLB2-212ENST00000483980 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.52■■■■■ 5.52
SH3GLB2-212ENST00000483980 TRIM41Q8WV44 630 aa49.52■■■■■ 5.52
SH3GLB2-212ENST00000483980 ADAMTS12P58397 1594 aa49.47■■■■■ 5.51
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SH3GLB2-212ENST00000483980 GRIN2AQ12879 1464 aa49.38■■■■■ 5.5
SH3GLB2-212ENST00000483980 KIF27Q86VH2 1401 aa49.23■■■■■ 5.47
SH3GLB2-212ENST00000483980 NUP160Q12769 1436 aa49.22■■■■■ 5.47
SH3GLB2-212ENST00000483980 ARAP1Q96P48 1450 aa49.15■■■■■ 5.46
SH3GLB2-212ENST00000483980 CEP170Q5SW79 1584 aa49.11■■■■■ 5.45
SH3GLB2-212ENST00000483980 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.11■■■■■ 5.45
SH3GLB2-212ENST00000483980 IGF1RP08069 1367 aa49.06■■■■■ 5.44
SH3GLB2-212ENST00000483980 CUL7Q14999 1698 aa49.01■■■■■ 5.44
SH3GLB2-212ENST00000483980 SHROOM2Q13796 1616 aa48.91■■■■■ 5.42
SH3GLB2-212ENST00000483980 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.76■■■■■ 5.4
SH3GLB2-212ENST00000483980 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.74■■■■■ 5.39
SH3GLB2-212ENST00000483980 JPH4Q96JJ6 628 aa48.68■■■■■ 5.38
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