Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.576e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-218ENST00000456817 581 ntTSL 35□□□□□ -1.616e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-209ENST00000427402 959 ntTSL 54.99□□□□□ -1.616e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.686e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-221ENST00000458458 513 ntTSL 43.83□□□□□ -1.86e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 215.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 214.12□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 512.47□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-213ENST00000617847 1649 ntTSL 512.33□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 511.63□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 211.27□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.341e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BYSL-203ENST00000475702 670 ntTSL 221.82■■□□□ 1.081e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.061e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.951e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SKA3-205ENST00000465471 930 ntTSL 520.09■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SLC11A2-221ENST00000550329 622 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NUP50-AS1-202ENST00000432502 596 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BYSL-204ENST00000489290 1153 ntTSL 318.82■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.341e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SKA3-204ENST00000462482 750 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 415.41■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 414.46□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 ERGIC1-207ENST00000520326 647 ntTSL 514.05□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-209ENST00000507573 641 ntTSL 213.24□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SKA3-201ENST00000298260 2803 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-209ENST00000604238 1268 ntTSL 511.77□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SLC11A2-214ENST00000548150 530 ntTSL 411.56□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SKA3-203ENST00000400018 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 210.88□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-207ENST00000603011 774 ntTSL 510.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 510.14□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.891e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BYSL-202ENST00000372996 1299 ntTSL 59.45□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 SRP68-208ENST00000588736 2532 ntTSL 29.15□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NUP50-AS1-203ENST00000609284 710 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 AC005632.1-201ENST00000550637 576 ntBASIC8.7□□□□□ -1.021e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.031e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NPEPPS-216ENST00000530514 2092 ntTSL 28.39□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 RAD54L-207ENST00000473251 834 ntTSL 38.15□□□□□ -1.11e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 RAD54L-208ENST00000476687 574 ntTSL 27.28□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 MICU1-208ENST00000604025 580 ntTSL 26.11□□□□□ -1.431e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 UBXN4-204ENST00000426921 568 ntTSL 420.78■□□□□ 0.923e-8■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 UBXN4-203ENST00000416538 1255 ntTSL 515.01□□□□□ -0.013e-8■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-8■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 UBXN4-208ENST00000490163 3394 ntTSL 22.74□□□□□ -1.973e-8■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-7■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.8□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 SEPT1-209ENST00000572252 1279 ntTSL 522.32■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 26.4
ILF3Q12906 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 26.4
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