RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.55■■■■■ 4.08
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.94■■■■□ 3.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.8■■■■□ 3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.44■■■□□ 2.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.37■■■□□ 2.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.73■■■□□ 2.83
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC9O60706 1549 aa32.49■■■□□ 2.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCRIBQ14160 1630 aa32.38■■■□□ 2.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NACADO15069 1562 aa32.35■■■□□ 2.77
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.82■■■□□ 2.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.53■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.42■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.42■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WIZO95785 1651 aa31.23■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCA4P51532 1647 aa31.03■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.02■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM41Q8WV44 630 aa30.78■■■□□ 2.52
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.7■■■□□ 2.51
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCA2P51531 1590 aa30.62■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.58■■■□□ 2.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.56■■■□□ 2.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.31■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC8Q09428 1581 aa30.26■■■□□ 2.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.12■■■□□ 2.41
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.96■■■□□ 2.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGXB3Q12766 1538 aa29.9■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCAPD3P42695 1498 aa29.88■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRCP23327 699 aa29.84■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOGA1O94964 1423 aa29.84■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEA1Q15075 1411 aa29.79■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNJ1O43426 1573 aa29.79■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.7■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.62■■■□□ 2.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP2BQ02880 1626 aa29.55■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.53■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.5■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP162Q5TB80 1403 aa29.48■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA3Q08378 1498 aa29.48■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFTRP13569 1480 aa29.46■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF21BO75037 1637 aa29.43■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.39■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.39■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM2Q13029 1718 aa29.36■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUX1P39880 1505 aa29.32■■■□□ 2.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.2■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.18■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIP1P30622 1438 aa29.07■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.07■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRXQ9BXM0 1461 aa29.05■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF27Q86VH2 1401 aa29.04■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.91■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.91■■■□□ 2.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.87■■■□□ 2.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUX2O14529 1486 aa28.83■■■□□ 2.21
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NESP48681 1621 aa28.79■■■□□ 2.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.77■■■□□ 2.2
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.74■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGF1RP08069 1367 aa28.72■■■□□ 2.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARAP1Q96P48 1450 aa28.7■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOPBP1Q92547 1522 aa28.68■■■□□ 2.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APLP2Q06481 763 aa28.62■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.59■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.59■■■□□ 2.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.57■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.55■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.52■■■□□ 2.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.49■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR97A6NE52 1622 aa28.46■■■□□ 2.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.43■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUL7Q14999 1698 aa28.4■■■□□ 2.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.32■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.25■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K1Q13233 1512 aa28.2■■■□□ 2.11
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIAM1Q13009 1591 aa28.19■■■□□ 2.1
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