Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 CASC19-237ENST00000641514 1074 nt5.89□□□□□ -1.475e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-234ENST00000641488 1157 nt5.89□□□□□ -1.475e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.54□□□□□ -1.525e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.54□□□□□ -1.525e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.555e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-233ENST00000641487 966 nt5.39□□□□□ -1.555e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.22□□□□□ -1.575e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.07□□□□□ -1.65e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.635e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-269ENST00000641964 1415 nt4.75□□□□□ -1.655e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-215ENST00000641174 959 nt4.66□□□□□ -1.665e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-225ENST00000641365 2219 nt4.66□□□□□ -1.665e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-213ENST00000641162 1091 nt4.65□□□□□ -1.675e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.65□□□□□ -1.675e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-231ENST00000641425 1156 nt4.61□□□□□ -1.675e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.6□□□□□ -1.675e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-256ENST00000641746 958 nt4.39□□□□□ -1.715e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.78□□□□□ -1.85e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-262ENST00000641867 866 nt3.21□□□□□ -1.95e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-267ENST00000641944 1117 nt2.94□□□□□ -1.945e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-209ENST00000641060 679 nt2.73□□□□□ -1.975e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-217ENST00000641187 875 nt2.31□□□□□ -2.045e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.52□□□□□ -2.335e-7■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.29e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.179e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.389e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.389e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.059e-10■■□□□ 12.6
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RBM22Q9NW64 ABAT-212ENST00000566590 2423 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.149e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-203ENST00000495596 1976 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.229e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.339e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-202ENST00000394349 878 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.799e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-207ENST00000552120 511 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.139e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.289e-10■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 37.65□□□□□ -1.183e-8■■□□□ 12.6
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RBM22Q9NW64 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.732e-7■■□□□ 12.6
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RBM22Q9NW64 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.164e-8■■□□□ 12.6
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RBM22Q9NW64 SLC12A4-214ENST00000574665 847 ntTSL 512.03□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 12.6
RBM22Q9NW64 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-6■■□□□ 12.6
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RBM22Q9NW64 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 525.47■■□□□ 1.671e-6■■□□□ 12.5
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RBM22Q9NW64 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-7■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 12.5
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RBM22Q9NW64 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-9■■□□□ 12.5
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RBM22Q9NW64 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.811e-9■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 RNF213-219ENST00000574909 298 ntTSL 37.61□□□□□ -1.192e-9■■□□□ 12.5
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RBM22Q9NW64 JRK-201ENST00000503272 587 ntTSL 416.37■□□□□ 0.216e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.126e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 TNFRSF1A-204ENST00000440083 1034 ntTSL 214.69□□□□□ -0.066e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-206ENST00000556162 1855 ntTSL 214.37□□□□□ -0.116e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-210ENST00000557341 559 ntTSL 514.12□□□□□ -0.156e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-203ENST00000555416 1215 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.216e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ZNF3-204ENST00000412947 595 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.356e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ZNF3-210ENST00000449785 735 ntTSL 312.85□□□□□ -0.356e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ZNF3-209ENST00000441298 574 ntTSL 412.84□□□□□ -0.356e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 TNFRSF1A-207ENST00000535958 568 ntTSL 412.83□□□□□ -0.366e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 212.61□□□□□ -0.396e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 312.12□□□□□ -0.476e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 TNFRSF1A-208ENST00000536194 581 ntTSL 311.44□□□□□ -0.586e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.666e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 TNFRSF1A-211ENST00000538363 554 ntTSL 210.89□□□□□ -0.676e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 SNX6-208ENST00000556712 851 ntTSL 510.43□□□□□ -0.746e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 410.37□□□□□ -0.756e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 ZNF3-208ENST00000428683 999 ntTSL 210.27□□□□□ -0.776e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 TNFRSF1A-214ENST00000543048 571 ntTSL 59.78□□□□□ -0.846e-10■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 CPNE1-226ENST00000486021 506 ntTSL 27.48□□□□□ -1.211e-17■■□□□ 12.5
RBM22Q9NW64 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.486e-10■■□□□ 12.5
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