RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572766.2

SLC12A4-211, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SLC12A4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-211ENST00000572766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.84■■■□□ 2.69
SLC12A4-211ENST00000572766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.58■■■□□ 2.17
SLC12A4-211ENST00000572766 ABCC9O60706 1549 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC12A4-211ENST00000572766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.98■■□□□ 1.91
SLC12A4-211ENST00000572766 NACADO15069 1562 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC12A4-211ENST00000572766 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4-211ENST00000572766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC12A4-211ENST00000572766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SLC12A4-211ENST00000572766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC12A4-211ENST00000572766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC12A4-211ENST00000572766 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC12A4-211ENST00000572766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.773e-6■■■□□ 15.6
SLC12A4-211ENST00000572766 SCRIBQ14160 1630 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC12A4-211ENST00000572766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC12A4-211ENST00000572766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC12A4-211ENST00000572766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SLC12A4-211ENST00000572766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.45■■□□□ 1.67
SLC12A4-211ENST00000572766 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC12A4-211ENST00000572766 SMARCA4P51532 1647 aa24.83■■□□□ 1.56
SLC12A4-211ENST00000572766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC12A4-211ENST00000572766 SMARCA2P51531 1590 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC12A4-211ENST00000572766 NCAPD3P42695 1498 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4-211ENST00000572766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC12A4-211ENST00000572766 HMGXB3Q12766 1538 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC12A4-211ENST00000572766 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC12A4-211ENST00000572766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SLC12A4-211ENST00000572766 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.51■■□□□ 1.51
SLC12A4-211ENST00000572766 ERCC6Q03468 1493 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC12A4-211ENST00000572766 WIZO95785 1651 aa24.28■■□□□ 1.48
SLC12A4-211ENST00000572766 NESP48681 1621 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC12A4-211ENST00000572766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.2■■□□□ 1.47
SLC12A4-211ENST00000572766 CUX2O14529 1486 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC12A4-211ENST00000572766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SLC12A4-211ENST00000572766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.04■■□□□ 1.44
SLC12A4-211ENST00000572766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4-211ENST00000572766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SLC12A4-211ENST00000572766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC12A4-211ENST00000572766 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4-211ENST00000572766 CFTRP13569 1480 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4-211ENST00000572766 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC12A4-211ENST00000572766 PRDM2Q13029 1718 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC12A4-211ENST00000572766 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC12A4-211ENST00000572766 WDR62O43379 1518 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4-211ENST00000572766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC12A4-211ENST00000572766 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4-211ENST00000572766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4-211ENST00000572766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4-211ENST00000572766 ABCC8Q09428 1581 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC12A4-211ENST00000572766 TOPBP1Q92547 1522 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC12A4-211ENST00000572766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC12A4-211ENST00000572766 IFT140Q96RY7 1462 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC12A4-211ENST00000572766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SLC12A4-211ENST00000572766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SLC12A4-211ENST00000572766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SLC12A4-211ENST00000572766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SLC12A4-211ENST00000572766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SLC12A4-211ENST00000572766 CUX1P39880 1505 aa23.03■■□□□ 1.28
SLC12A4-211ENST00000572766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.02■■□□□ 1.28
SLC12A4-211ENST00000572766 WDR97A6NE52 1622 aa23■■□□□ 1.27
SLC12A4-211ENST00000572766 OSCARQ8IYS5 282 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC12A4-211ENST00000572766 SOGA1O94964 1423 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4-211ENST00000572766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.96■■□□□ 1.27
SLC12A4-211ENST00000572766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.264e-9■■■■■ 45.9
SLC12A4-211ENST00000572766 CHD1O14646 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
SLC12A4-211ENST00000572766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SLC12A4-211ENST00000572766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.83■■□□□ 1.25
SLC12A4-211ENST00000572766 PBRM1Q86U86 1689 aa22.82■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 TOP2BQ02880 1626 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 GRIN2BQ13224 1484 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC12A4-211ENST00000572766 SYNJ1O43426 1573 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC12A4-211ENST00000572766 TRIM41Q8WV44 630 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC12A4-211ENST00000572766 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC12A4-211ENST00000572766 ARHGEF11O15085 1522 aa22.72■■□□□ 1.23
SLC12A4-211ENST00000572766 FBLN2P98095 1184 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC12A4-211ENST00000572766 SYNJ2O15056 1496 aa22.68■■□□□ 1.22
SLC12A4-211ENST00000572766 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC12A4-211ENST00000572766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SLC12A4-211ENST00000572766 ADAMTS12P58397 1594 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC12A4-211ENST00000572766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC12A4-211ENST00000572766 GRIN2AQ12879 1464 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC12A4-211ENST00000572766 ARAP1Q96P48 1450 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4-211ENST00000572766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC12A4-211ENST00000572766 CEP170Q5SW79 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC12A4-211ENST00000572766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4-211ENST00000572766 NUP160Q12769 1436 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4-211ENST00000572766 CUL7Q14999 1698 aa22.33■■□□□ 1.16
SLC12A4-211ENST00000572766 KIF27Q86VH2 1401 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4-211ENST00000572766 SHROOM2Q13796 1616 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4-211ENST00000572766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4-211ENST00000572766 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC12A4-211ENST00000572766 IGF1RP08069 1367 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4-211ENST00000572766 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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